G391


Basic Information

Item Value
gene id G391
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 464887 ~ 466528 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU470
ATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTGTCTAACCCCAGACTCCTACACTATACCTTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTCCTACACTATACACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTCCTACACTATACCCTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTCCTACACTATACACGGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAATCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTCCTACACTATACCCTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTCCTACACTATACCCTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTGGGTATGTCTATCTAACCCCAGACTCCTACACTATACA

Function

NR:

description
PREDICTED: extensin-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU470 True 999 lncRNA 0.42 2 464887 466528

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110532027 tomm70 coding upstream 43654 384207 ~ 421233 (+)
nit2 nit2 coding downstream 135575 602103 ~ 617595 (+)
slc9a7 slc9a7 coding downstream 315312 781840 ~ 1244153 (+)
tubgcp5 tubgcp5 coding downstream 622868 1089396 ~ 1133908 (+)
cyfip1 LOC106590724 coding downstream 707183 1173711 ~ 1300624 (+)
LOC118964682 NA coding downstream 860794 1327322 ~ 1328266 (+)
G396 NA non-coding upstream 869 463502 ~ 464018 (+)
G376 NA non-coding upstream 29092 435513 ~ 435795 (+)
G373 NA non-coding upstream 32252 431661 ~ 432635 (+)
G370 NA non-coding upstream 41119 423535 ~ 423768 (+)
G369 NA non-coding upstream 41375 423216 ~ 423512 (+)
G399 NA non-coding downstream 7695 474223 ~ 474581 (+)
G420 NA non-coding downstream 90859 557387 ~ 557594 (+)
G447 NA non-coding downstream 146126 612654 ~ 616251 (+)
G456 LOC106574112 non-coding downstream 165438 631966 ~ 633986 (+)
G464 NA non-coding downstream 183210 649738 ~ 655342 (+)
G166 NA other upstream 144913 318047 ~ 319974 (+)
G51 NA other upstream 334624 120466 ~ 130263 (+)
G50 NA other upstream 344580 112959 ~ 120307 (+)
G26 NA other upstream 371169 56555 ~ 93718 (+)
G19 NA other upstream 392588 52711 ~ 72299 (+)
G583 NA other downstream 537255 1003783 ~ 1010207 (+)
G961 NA other downstream 1612370 2078898 ~ 2079603 (+)
G998 LOC106576565 other downstream 1792355 2258883 ~ 2305334 (+)
G2016 NA other downstream 2177807 2644335 ~ 2645169 (+)
G2343 NA other downstream 2748169 3214697 ~ 3216234 (+)

Expression


Co-expression Network