G500


Basic Information

Item Value
gene id G500
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 749064 ~ 756426 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU608
CACACTGACCAGAGAGgttctgttgataagtgtgtgaattggaccattttctgtcctgctaagcattcaaaatgtaacgagtacctttgggtgtcagggaacatGTAAGTaagaaagtacattattttctttaggaatgtagtgaagtaaaagttgacaaaaatattaatagtaaagtacagataccccaaaaacgatttaagtagtactttaaagtaattctacttaagtactttacatcactggaTATGGCACATCATACAACACTGTGGAAATATGTACTGCATGTTATGAAACTTAAAAGGACAGCAAAGTATCTGTTTCAGTCAACAAGTAAACATTTGCTTCTGACACAAACAAATATAATTGTAGAGAAATGTCAACAGACAACAGGTTTAATCAAGATGTCAAGGATGAAAGGTTAAGGGTTTGTGTCCCcacctgtttcattacaatatctTCCAACCAGGTGAACCCCAGTTTATAATCCAGAAGTTACCTTGGGCATtatgagtgaaagagagagacccgGCTCTATATATTTGACTCGTTTTGACCCACtgacacccccccccaccccccggtTAGAGGGGAATAAAGCAGCCCAAGAATTAACACACAGGAACTATACTgtatatgaatatactgtacatacgaTATGACAAGAGCTGTACCAACAGTAATAAAGGACTGTATAAAGGACATATAATCCCTGAACATGTTTACAGGTTACAAGCTATACAGAGGACATATCATCCCTGAACATGTTTACAGGTTACAAGCTATACAGAGGACATATCATCCCTGAACATGTTTACAGGTTACAAGTTATACAGAGGACATATCATCCCTGAACATGTTTATAGGTTACAAGCTATACAGAGGACATATCATCCCTGAACATGTTTATAGGTTACAAGCTATACAGAGGACATATCATCCCTGAACATGTTTACAGGTTACAAGCTATACAGAGGACATATCATCCCTGAACATGTTTACAGGTTACAAGCTATACAGAGGACATATCATCCCTGAACATGTTTACAGGTTACAAGCTATACAGAGGACATATCATCCCTGAACATGTTTACAGGTTACAAGCTATACAGAGGACATATCATCCCTGAACATGTTTACAGGTTACAAGCTATACAGAGGACATATCATCCCTGAACATGTTTATAGGTTACAAGCTATACAGAGGACATATCATCCCTGAACATGTTTATGGGTTACAAGCTATACAGAGGAAGCATAAATAAAGCAATAACTAAGTATTGAGAACAATATGTACGTCACACAACTCACTTTGGGCATGCACACCATCCCACAAGTCCAGAGATATGAGTGAGTCCAGTTGTTGATGGGCAGAGACATGTTGCTCTCTGCCACTGCTTGAGGGAGACTGAGTTTTGTGTGCCCATGTTGCTCTCTGCCACTGCTTGAGGGAGACTGACAGTTTTGTGTGGCCTGTATAGTCAAGAGAGTGGCCAGATGTCCGGCCCCCTAGCAATCTCTCAGAGCactagccagcagcataccacctgcatcccactgctggctcgCTTCTGAAGCTATACCGTGTTGgtactggtcagttcctggatggaagaccagatgctgctggaggtggtgttggagggccagtaggaggcactctttcctttggtctaaataaaatatcacaatgccccagggcagtgattggggacattgccctgtgtagggtgccatcttttgtgtgtcctgactctctgtggtcactaaagatatCACGGCACTTATTGTAGGGGGTGTCCTggttaaattcccaatctggccctcaaaccatcatggccacctaataaaccccagcttccaattggctcctTCAtcccccctgtaactattccccaggtggttgctgtaaatgagaatgtgttctcagtcaacctacctggtaaaataaagcaCCCTACAGTCCACCAAGTCCTCACATCCtgtgggcagcaggtagcctagaggttaagagcaaaaggttgctggtttgaatccttaAGCCAACTAGGTAAAATAAAAACTGTAAATGtgcccatttattttttattttaccttcatttaaccaggcaagtcagttaagaacaaattcttattttcccgacagttttgtaccttgtcagctcggggatttgaacttgcaacctttcggttactagtccaacacacactaggctaccctgccgcccatgagcaaggcacttagccctaattgctctggataagatgtGATAAATTACCACACTGTACAAAAAACATTCACCAAGAGTTTGTAACATAaaccacatttccatccacaGATTTTAGGAGTGGTCAtaccatttaaaaaataacagCTATattggaaacaggaagtttcggtaCACTTTTATAAATGCAGACAGATAATTTGTCCATTTGACATGGTGGGACCTTTTAGTGTCGGTAAAATGTATTACCCAAGAAATAgcggtggaaacgcctttatgagGAAATATTGATATAATCACCAGCATATCAAGGTCAAGTTGGAGTCACACGATGACATGGGGTTCTaccacgactcaggaaaccatgcagtttattacaGATGAAATCAATGATCAACTTCAGAGGGTGGTACGAAGTGCACAGTGATGCTCTTCTCCAATAAAtggagggtcttattctggtgacatgatgatcgatgctttacggccgtttgacaaataaaaatattaaaatcgataataatctcatcatgcagACTagcccagtggttcccaaaccgcGGGGAACTCAGTCCGGCTGTAAACTTCCTCTTgagagttgtaatagtagaaagCACAAGGTGGTGCATCACCAGTTCCTCTTAGAGagatatttataacttgtcagaaatgtccagatcaacccGCCTACAGATCAGTTAGGTTTTTTAGCACATAGATAttgttgtatttttcttgtcacTCAAATATCCCATGAATACACATGAGACagggcaaaatgtatagaattccaagaaaatgtgctttaaaacagcaaattaTTATTTGCATCACAATGACAAGATGCGTAGAATTGCAGGTAATAAACTTTAAAACTGTGTGAACAGATGGCATGAACAGTTCTTGAACAGATGGTGTCATGAACAGTTCTTGATCTGCAACAAGTCCATCAGGTGCAAACAttccactggtgggaaaatgtggaTATTTTCATTACGCGGATTCTAGAATATTCCCATAGAAATCAcatcgccaattggatggaaatcaAGCTACTGAGAAGGTAGTGTAAATCAGAAACATCTCCCACAGTAAAATCTCAAACACAACACATACAAATGGATATTAAATATATTAGTAATGACATGCTCATTTGATTCTACAGAGATACAATAGGAAACATTTAGCAATACAAAGTCCCAATCTTCAACAAATACAAAATGTTAAAGTATACCGTgcttcccaaacggcaccctagtccttttatagtgcattaccctggtcaatagtagagGACTAGGGCGCCATTTGAGAAGCAGGAATTTCATCACAGGGATGAGGTTCTGTCCCAAAGAAAACAACATTACCACATCTCTTCCTGTCTGGTCCCATAGAAAACAACATTACCACCTCTCTTCCTTTCTGGTCCCATAGAAAACAACATTAccacctctcttcctgtctggtcCCATAGAAAACAACATTACCACATCTCTTCCTGTCTTCAATACATTCTAAATGCTTTCTAAGAACATTTATTTAAttcacccccaccccccaaaaaacattaaCTAAAATATGTGAAATAATTATTTACATAATAGGTGTAGTCTACATTGGTGTAACCAAAGTGTTGAGGTGTCTATTTGTGCACACCAACTGTAGCAAAATTTTTTTTAGGTAGGTCTCCTCCCCATTTTGTCCCGCTTGCTTCTGTTTatttcctagtgaatacacccctgtaCTCAATCACAGCATTGTCCAATCAGCTATTTACACCAGTATCACCCTGACAACGTGTCTGGAAAAAACACAGGTAACTCAGGTAACCACTAAGGAAGTCCCGGTGTCTTGCTGCTCAACCAAACACACAAACTAATGGGTTATTGCTATCGGGAATggttgggacgtccctaccctaaacctaacttgAAAGGCTTGCACATATGGCACCGAATGGGGATTTAGCGTTCGTCTGTCGATCGTTCAGCGcactgtgttttagggaccagCCTTTATGTCTGTATGACCACAGACACATTTCACCTGATTCTACATGTAAAATCTGTGCGCACTCAGTTCACAAATTACATTCAGAGGGGCCAAGTACTCTGGGCCAGAAAACACTACTGCTGTGTCTGAGCCCTTAACCTCGAACCGAACCTTATCCCTTACCTAGACTAGTTTAAATTTCAACTTGAATGGGATGACAGGACGTCCCAAGCATCCCAAATAGCAAGGACCCTAACAAATACAGAAGAGAAAACACATGATGTACGGGGTAAAGTTTCCCCTAGGAACAGATCTTGGATCAGCTCTTCATCTCCACAAATCCTAACATAAAACagtgggggaaatgcaaaactgattcAAGATCAgaatctaggggcaacttcactcTACACCAATCATTCACCACAATGGTTTCAATgtgtgtttcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaccaaaattaCCTAACAGAACAGCGAAGACCAAAATATACACAATATAAACAAGAGAATACTTTCTTGAATTTCAAGAAATTCAAATAGCCAAATAACTAATACAGCGTTCCCCCCCTGGCTGCTCGTTATAACTAGTGAACCTGTCCTTCTCCACTATGTTGATTAACCTGTCCTTCTCCACTACCTACCATCATTCTGATGATTAACCTGTCCTTCTCCGCTACCTACCATC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Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106595595

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU608 True 7225 lncRNA 0.41 3 749064 756426

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
nit2 nit2 coding upstream 131469 602103 ~ 617595 (+)
tbc1d23 tbc1d23 coding upstream 251936 439965 ~ 497128 (+)
LOC110532027 tomm70 coding upstream 327831 384207 ~ 421233 (+)
slc9a7 slc9a7 coding downstream 25414 781840 ~ 1244153 (+)
tubgcp5 tubgcp5 coding downstream 332970 1089396 ~ 1133908 (+)
cyfip1 LOC106590724 coding downstream 417285 1173711 ~ 1300624 (+)
LOC118964682 NA coding downstream 570896 1327322 ~ 1328266 (+)
gabrb3 LOC107673538 coding downstream 577671 1334097 ~ 1398380 (+)
G486 NA non-coding upstream 19965 728321 ~ 729099 (+)
G485 NA non-coding upstream 21181 727573 ~ 727883 (+)
G476 NA non-coding upstream 50433 698431 ~ 698631 (+)
G467 NA non-coding upstream 77798 666175 ~ 671266 (+)
G389 NA non-coding upstream 86155 661536 ~ 662909 (+)
G514 NA non-coding downstream 20901 777327 ~ 779986 (+)
G535 NA non-coding downstream 81555 837981 ~ 839050 (+)
G541 NA non-coding downstream 101959 858385 ~ 858631 (+)
G542 NA non-coding downstream 103334 859760 ~ 860156 (+)
G544 NA non-coding downstream 120805 877231 ~ 884260 (+)
G166 NA other upstream 429090 318047 ~ 319974 (+)
G51 NA other upstream 618801 120466 ~ 130263 (+)
G50 NA other upstream 628757 112959 ~ 120307 (+)
G26 NA other upstream 655346 56555 ~ 93718 (+)
G19 NA other upstream 676765 52711 ~ 72299 (+)
G583 NA other downstream 247357 1003783 ~ 1010207 (+)
G961 NA other downstream 1322472 2078898 ~ 2079603 (+)
G998 LOC106576565 other downstream 1502457 2258883 ~ 2305334 (+)
G2016 NA other downstream 1887909 2644335 ~ 2645169 (+)
G2343 NA other downstream 2458271 3214697 ~ 3216234 (+)

Expression


Co-expression Network