G1355


Basic Information

Item Value
gene id G1355
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 970185 ~ 976099 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1695
ccggagcagtttaattccAACGGCATAAAGAAATAACCagcatgggtacaaaacccgacgtGCACCAGTCACTTACAGCAAACAATccaacacaaagacatggggggaacagagggttaaatacacaacatgtaatgagggaatgagaaccaggtgtgtgggaaaacaagacaaaacaaatgggaaATGAAAAGGGGAATCGACGATGGCAAGAAGACCGGTGACCCgaccgccacccgaacaaggagaggaaccgacttcggaggaagtcgtgacagacaCACTGTTTTGACATTTGAGAAATATGGCAAGGCCCGTTTCTCTGTCCATTCTTCCCTGAAACTTATATTTTCATTATTCACCTTTCTTTTGAGACTTTTTCAGAGGACATTTTCTCTTGAATGCTGTTTTTCCCCAATCAATGcacaaagaaaaataaaaaaacaaatctaATATAGACATTGGTGATTTTATCAGTGTAATCAGAGTGAAAGTATTAGGATATGTTATTGACACTGGACTGATAATATAGCCTCTAACCAGATGTGTTTACGTATAGTTTAATTTGTAGCAGAGGCCTATGAATGGGCTGttatgatgtagcagagGGCTATGAATGGGCTGTTATAATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGATGTTGTTGCATAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGTTGTTCGATGTTGACTATTAGCAGAGAAAAGGCCAAACCTATTGCAGACCCCTGCTATCCTACACTGTACTAGTTTAGCTGCAATTTATTGTTTTGGGTGCATACACAGGAGGTCCCATACCGGGAAGTAATGACATCTAATATCAGCCCTGTTTTAAACCAAACCCTTTCCTccaaccctcactctcccattctcctcctctcctcccatagtctggtgtgtgtgtgggctgaaGGGCGAGGGTTCATGGGGTCATGGTGTAGGGGTCAGGCGTGGTCTTCGATGGGAAAGACAAGGCGTGTGCTGCGGGACAGGAATTCctggtccatctctctctctagtgcctCTTCAGATGTGCTGCTGCTCCTCTTCCCGTTGACCCCCCAGCCCCCCGCGTCCGCCCCTCCACTGGACGCTCCTTTAGCCGTGATGGCCGTGTCGTCGTAGGTCAGCGCCAAGTCGCCGTCATTCAGGATCAGGTCGGAGTCGTCGTCTCTCAGCTGCTCATGGTTCTGGAAGATGGGAACAGAGACATGAAGATGGGAACAGAGACATGAAGAGTTTGGCTATAAAagctaactgacatttactcctgaggtgctgacttgctgcaccctctacaactactgtgattattattatttaaccctgctggtcatctatgaacatttgaacatcttggccatgttctgttataatctccacccggcacagccagaagaggac
>TU1688
ccggagcagtttaattccAACGGCATAAAGAAATAACCagcatgggtacaaaacccgacgtGCACCAGTCACTTACAGCAAACAATccaacacaaagacatggggggaacagagggttaaatacacaacatgtaatgagggaatgagaaccaggtgtgtgggaaaacaagacaaaacaaatgggaaATGAAAAGGGGAATCGACGATGGCAAGAAGACCGGTGACCCgaccgccacccgaacaaggagaggaaccgacttcggaggaagtcgtgacagacaCACTGTTTTGACATTTGAGAAATATGGCAAGGCCCGTTTCTCTGTCCATTCTTCCCTGAAACTTATATTTTCATTATTCACCTTTCTTTTGAGACTTTTTCAGAGGACATTTTCTCTTGAATGCTGTTTTTCCCCAATCAATGcacaaagaaaaataaaaaaacaaatctaATATAGACATTGGTGATTTTATCAGTGTAATCAGAGTGAAAGTATTAGGATATGTTATTGACACTGGACTGATAATATAGCCTCTAACCAGATGTGTTTACGTATAGTTTAATTTGTAGCAGAGGCCTATGAATGGGCTGttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagaagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGATTGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGATTGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGATTGGGCTGttatgatgtagcagaggcctatgattgggctgttatgatgtagaagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGTTGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGCTAttatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGAATGGGCTGttatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTAttatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTATTATGATGTAGCAGAGGACTATGAATGGGCTGttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTAttatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTAttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgctattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagagGGCTATGAATGGGCTGCTAttatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGAATGGGCTGttatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTAttatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTATTATGATGTAGCAGAGGACTATGAATGGGCTGttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTAttatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTAttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgctattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGTTGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTAttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagagGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGctattatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGTTGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGCTAAtatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaATGGGTTGTTATAATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATAATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATAATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGATGTTGTTGCATAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGTTGTTCGATGTTGACTATTAGCAGAGAAAAGGCCAAACCTATTGCAGACCCCTGCTATCCTACACTGTACTAGTTTAGCTGCAATTTATTGTTTTGGGTGCATACACAGGAGGTCCCATACCGGGAAGTAATGACATCTAATATCAGCCCTGTTTTAAACCAAACCCTTTCCTccaaccctcactctcccattctcctcctctcctcccatagtctggtgtgtgtgtgggctgaaGGGCGAGGGTTCATGGGGTCATGGTGTAGGGGTCAGGCGTGGTCTTCGATGGGAAAGACAAGGCGTGTGCTGCGGGACAGGAATTCctggtccatctctctctctagtgcctCTTCAGATGTGCTGCTGCTCCTCTTCCCGTTGACCCCCCAGCCCCCCGCGTCCGCCCCTCCACTGGACGCTCCTTTAGCCGTGATGGCCGTGTCGTCGTAGGTCAGCGCCAAGTCGCCGTCATTCAGGATCAGGTCGGAGTCGTCGTCTCTCAGCTGCT
>TU1690
ccggagcagtttaattccAACGGCATAAAGAAATAACCagcatgggtacaaaacccgacgtGCACCAGTCACTTACAGCAAACAATccaacacaaagacatggggggaacagagggttaaatacacaacatgtaatgagggaatgagaaccaggtgtgtgggaaaacaagacaaaacaaatgggaaATGAAAAGGGGAATCGACGATGGCAAGAAGACCGGTGACCCgaccgccacccgaacaaggagaggaaccgacttcggaggaagtcgtgacagacaCACTGTTTTGACATTTGAGAAATATGGCAAGGCCCGTTTCTCTGTCCATTCTTCCCTGAAACTTATATTTTCATTATTCACCTTTCTTTTGAGACTTTTTCAGAGGACATTTTCTCTTGAATGCTGTTTTTCCCCAATCAATGcacaaagaaaaataaaaaaacaaatctaATATAGACATTGGTGATTTTATCAGTGTAATCAGAGTGAAAGTATTAGGATATGTTATTGACACTGGACTGATAATATAGCCTCTAACCAGATGTGTTTACGTATAGTTTAATTTGTAGCAGAGGCCTATGAATGGGCTGttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagaagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGATTGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGATTGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGATTGGGCTGttatgatgtagcagaggcctatgattgggctgttatgatgtagaagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGTTGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGCTAttatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGAATGGGCTGttatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTAttatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTATTATGATGTAGCAGAGGACTATGAATGGGCTGttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTAttatgatgtagcagaggcctatgaTTGGGCTGTTAttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgctattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGTTGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTAttatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGTAGCATAGGCCTATGAATGGGCTGCTATTACgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGCTATTACgatgtagcagaggcctatgaatgggctgctattatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGCTATTATGATGTTGTAGCATAGGCCTATGAATGGGCTGCTAttatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGTAGAAGAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGATTTTTATGatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGATGTTGTAGCATAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGATGATGTTGTAGCAGAGGCCTATGAATGGGctgttataatgttgtagcataggcctatgaatgggctgctattatgatgtagcagaggcctatgaCTGGGCTGTTATTATGTTGTAGCAGAGGCCTATGAATGGGCTGCTAttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgctattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgctattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgctattatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGTTGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGCTAAtatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaATGGGTTGTTATAATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATAATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATAATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGATGTTGTTGCATAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGTTGTTCGATGTTGACTATTAGCAGAGAAAAGGCCAAACCTATTGCAGACCCCTGCTATCCTACACTGTACTAGTTTAGCTGCAATTTATTGTTTTGGGTGCATACACAGGAGGTCCCATACCGGGAAGTAATGACATCTAATATCAGCCCTGTTTTAAACCAAACCCTTTCCTccaaccctcactctcccattctcctcctctcctcccatagtctggtgtgtgtgtgggctgaaGGGCGAGGGTTCATGGGGTCATGGTGTAGGGGTCAGGCGTGGTCTTCGATGGGAAAGACAAGGCGTGTGCTGCGGGACAGGAATTCctggtccatctctctctctagtgcctCTTCAGATGTGCTGCTGCTCCTCTTCCCGTTGACCCCCCAGCCCCCCGCGTCCGCCCCTCCACTGGACGCTCCTTTAGCCGTGATGGCCGTGTCGTCGTAGGTCAGCGCCAAGTCGCCGTCATTCAGGATCAGGTCGGAGTCGTCGTCTCTCAGCTGCT
>TU1693
agcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagagGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGctattatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGTTGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGCTAAtatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaATGGGTTGTTATAATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATAATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATAATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGATGTTGTTGCATAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGTTGTTCGATGTTGACTATTAGCAGAGAAAAGGCCAAACCTATTGCAGACCCCTGCTATCCTACACTGTACTAGTTTAGCTGCAATTTATTGTTTTGGGTGCATACACAGGAGGTCCCATACCGGGAAGTAATGACATCTAATATCAGCCCTGTTTTAAACCAAACCCTTTCCTccaaccctcactctcccattctcctcctctcctcccatagtctggtgtgtgtgtgggctgaaGGGCGAGGGTTCATGGGGTCATGGTGTAGGGGTCAGGCGTGGTCTTCGATGGGAAAGACAAGGCGTGTGCTGCGGGACAGGAATTCctggtccatctctctctctagtgcctCTTCAGATGTGCTGCTGCTCCTCTTCCCGTTGACCCCCCAGCCCCCCGCGTCCGCCCCTCCACTGGACGCTCCTTTAGCCGTGATGGCCGTGTCGTCGTAGGTCAGCGCCAAGTCGCCGTCATTCAGGATCAGGTCGGAGTCGTCGTCTCTCAGCTGCT
>TU1694
tgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGCTATTATGTTGTAGCAGAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgctattatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGCTATTATGTTGTAGCAGAGGCCTATGAATGGGCTGCTAttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttattatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGTAGCATAGGCCTATGAATGGGCTGttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgctattatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGTTGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGCTAAtatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaATGGGTTGTTATAATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATAATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATAATGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTATGATGATGTTGTTGCATAGGCCTATGAATGGGCTGTTATGatgatgtagcagaggcctatgaATGGGCTGTTATGATGTTGTTCGATGTTGACTATTAGCAGAGAAAAGGCCAAACCTATTGCAGACCCCTGCTATCCTACACTGTACTAGTTTAGCTGCAATTTATTGTTTTGGGTGCATACACAGGAGGTCCCATACCGGGAAGTAATGACATCTAATATCAGCCCTGTTTTAAACCAAACCCTTTCCTccaaccctcactctcccattctcctcctctcctcccatagtctggtgtgtgtgtgggctgaaGGGCGAGGGTTCATGGGGTCATGGTGTAGGGGTCAGGCGTGGTCTTCGATGGGAAAGACAAGGCGTGTGCTGCGGGACAGGAATTCctggtccatctctctctctagtgcctCTTCAGATGTGCTGCTGCTCCTCTTCCCGTTGACCCCCCAGCCCCCCGCGTCCGCCCCTCCACTGGACGCTCCTTTAGCCGTGATGGCCGTGTCGTCGTAGGTCAGCGCCAAGTCGCCGTCATTCAGGATCAGGTCGGAGTCGTCGTCTCTCAGCTGCT
>TU1689
ccggagcagtttaattccAACGGCATAAAGAAATAACCagcatgggtacaaaacccgacgtGCACCAGTCACTTACAGCAAACAATccaacacaaagacatggggggaacagagggttaaatacacaacatgtaatgagggaatgagaaccaggtgtgtgggaaaacaagacaaaacaaatgggaaATGAAAAGGGGAATCGACGATGGCAAGAAGACCGGTGACCCgaccgccacccgaacaaggagaggaaccgacttcggaggaagtcgtgacagacaCACTGTTTTGACATTTGAGAAATATGGCAAGGCCCGTTTCTCTGTCCATTCTTCCCTGAAACTTATATTTTCATTATTCACCTTTCTTTTGAGACTTTTTCAGAGGACATTTTCTCTTGAATGCTGTTTTTCCCCAATCAATGcacaaagaaaaataaaaaaacaaatctaATATAGACATTGGTGATTTTATCAGTGTAATCAGAGTGAAAGTATTAGGATATGTTATTGACACTGGACTGATAATATAGCCTCTAACCAGATGTGTTTACGTATAGTTTAATTTGTAGCAGAGGGCTATGAATGGGCTGTTAttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttatgatgtagcagaggcctatgaatgggctgttat

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1695 False 1464 TUCP 0.39 2 970185 976099
TU1688 False 3089 lncRNA 0.36 4 970406 976099
TU1690 False 3248 lncRNA 0.35 2 970406 976099
TU1693 False 1233 TUCP 0.40 3 970406 974095
TU1694 False 1628 TUCP 0.53 2 970406 972696
TU1689 True 695 lncRNA 0.43 2 972942 976099

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
rp2 LOC106574114 coding downstream 199090 749441 ~ 771316 (-)
LOC110520928 jade3 coding downstream 233615 702526 ~ 736791 (-)
plcxd1 LOC106574112 coding downstream 288489 631974 ~ 681917 (-)
LOC118964585 NA coding downstream 466152 502752 ~ 504254 (-)
tmem45a tmem45a coding downstream 664359 260364 ~ 306047 (-)
chst7 chst7 coding upstream 39643 1015742 ~ 1040056 (-)
nipa2 nipa2 coding upstream 324470 1300569 ~ 1311792 (-)
nipa1 nipa1 coding upstream 337407 1313506 ~ 1317525 (-)
LOC100135976 LOC100135976 coding upstream 806228 1782327 ~ 1821060 (-)
si:ch211-201h21.5 LOC106574205 coding upstream 993420 1969519 ~ 1973362 (-)
G1351 NA non-coding downstream 2852 965062 ~ 967554 (-)
G1337 NA non-coding downstream 24525 945567 ~ 945881 (-)
G1336 NA non-coding downstream 25454 944023 ~ 944952 (-)
G1321 NA non-coding downstream 93523 875930 ~ 876883 (-)
G1320 NA non-coding downstream 113315 856681 ~ 857091 (-)
G1365 NA non-coding upstream 13812 989911 ~ 1012938 (-)
G1367 NA non-coding upstream 22617 998716 ~ 1000339 (-)
G1373 NA non-coding upstream 42298 1018397 ~ 1021689 (-)
G1382 NA non-coding upstream 77588 1053687 ~ 1060337 (-)
G1398 NA non-coding upstream 120378 1096477 ~ 1098591 (-)
sft2d2a sft2b other downstream 726983 237111 ~ 243619 (-)
G202 NA other downstream 944733 25269 ~ 25673 (-)
G1651 LOC106574119 other upstream 777146 1753245 ~ 1760430 (-)
G1788 NA other upstream 1116311 2092410 ~ 2097715 (-)
G1954 NA other upstream 1557931 2534030 ~ 2534513 (-)
G2192 NA other upstream 1766788 2742887 ~ 2743574 (-)
G2605 NA other upstream 2002516 2978615 ~ 2978916 (-)

Expression


Co-expression Network