G12509


Basic Information

Item Value
gene id G12509
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 13811936 ~ 13813273 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU14851
actactactactaaccactactactactactactaccactactaacactactactactaacactactactactactactactaccactactactactaaccactactactgctactactactaacacacctactactactactgctactactactactaccactactactactaacactactactactactactaccaccactactactaaaactactactactactactactactactactactaccactactactaccaccactactactactaacactactactactaccactactactactaccactactactactaccactactactacagctactactaacactactactactactactgctacaactactactaacactactactactactgctactactactactaacactactactactactgctactactactactaacactactactactaaccactactactactactaccactactaacactactactactactactactaccactactactactaaccactactactactactaacactactactgctactactactaacacacctactactactactgatactactactactaacactactactactaccactactactactaacactactactactaccactactactactactactaccattactactactactaaaactactactactactactactactaacactactactactaccactactactactaccactactactactaccactactactacagctactactaacactactactactaacactactactactaccactactactactaacacacctactactactactgctactactactaaccactactactactactaccactactaacactactactactaccactactactactaccactactactactaccactactactacagctactactaacactactgctactactactactaattactactaacaatactactactactactactactgctactactaacactactactaacactactactactactactactactactaacactactactactactactactactactaacactactgctactactactactaccactactactactaccactactgctactactaacactactgctactactaacgctactactactgcttctggTACTAcctacactactgctactactaccactactaaacACACACCAATGGGAACGGAGGCCACagtatgtagg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU14851 True 1275 lncRNA 0.45 2 13811936 13813273

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
tm2d1 LOC106574044 coding upstream 58261 13734763 ~ 13753675 (+)
pdzk1ip1 LOC106574040 coding upstream 370408 13436016 ~ 13441528 (+)
LOC110485322 LOC106574039 coding upstream 380819 13425566 ~ 13431117 (+)
LOC110485223 LOC106574083 coding upstream 400646 13409282 ~ 13411290 (+)
LOC110538561 LOC106574035 coding upstream 516484 13238613 ~ 13295452 (+)
LOC110508285 LOC106574085 coding downstream 327223 14140496 ~ 14144946 (+)
LOC110485648 LOC106574045 coding downstream 349112 14162385 ~ 14171600 (+)
LOC110485979 LOC106574047 coding downstream 359246 14172519 ~ 14185257 (+)
LOC110486057 NA coding downstream 379194 14192456 ~ 14214939 (+)
axdnd1 axdnd1 coding downstream 406894 14220167 ~ 14244412 (+)
G12504 NA non-coding upstream 12639 13795935 ~ 13799297 (+)
G12499 NA non-coding upstream 23074 13779607 ~ 13788862 (+)
G12497 NA non-coding upstream 36065 13775533 ~ 13775871 (+)
G12411 NA non-coding upstream 142908 13617745 ~ 13669028 (+)
G12410 NA non-coding upstream 145065 13617059 ~ 13666871 (+)
G12535 NA non-coding downstream 40218 13853491 ~ 13853770 (+)
G12573 NA non-coding downstream 120827 13934100 ~ 13994776 (+)
G12580 NA non-coding downstream 134056 13947329 ~ 13952338 (+)
G12587 NA non-coding downstream 147182 13960455 ~ 13960886 (+)
G12644 NA non-coding downstream 219963 14033236 ~ 14034005 (+)
LOC110523899 LOC106574090 other upstream 2297554 11433102 ~ 11514427 (+)
gipc3 LOC106574151 other upstream 3650650 10140230 ~ 10162948 (+)
LOC110510920 LOC106574155 other upstream 3820394 9980527 ~ 9991542 (+)
G13380 NA other downstream 866077 14679350 ~ 14679578 (+)
G13381 NA other downstream 866425 14679698 ~ 14680027 (+)
G13391 NA other downstream 886903 14700176 ~ 14700730 (+)
G13434 NA other downstream 998498 14811771 ~ 14812624 (+)

Expression


Co-expression Network