G14120 (antithrombin)


Basic Information

Item Value
gene id G14120
gene name antithrombin
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 15114926 ~ 15174030 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU16697
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>TU16695
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>TU16696
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Function

NR:

description
antithrombin-III-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU16697 False 4000 lncRNA 0.56 5 15114926 15174030
TU16695 False 4336 TUCP 0.42 6 15166181 15174030
TU16696 True 4330 lncRNA 0.39 6 15166181 15174030

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118940256 NA coding downstream 17321 15087990 ~ 15097605 (-)
LOC110487829 LOC106574071 coding downstream 44028 15069112 ~ 15070898 (-)
LOC110487509 LOC106574066 coding downstream 126423 14962746 ~ 14988503 (-)
LOC110487385 LOC106574065 coding downstream 155613 14955950 ~ 14959313 (-)
LOC110486932 LOC106574064 coding downstream 256363 14637195 ~ 14858563 (-)
LOC110488330 LOC106613586 coding upstream 1267 15175297 ~ 15183693 (-)
LOC110488417 LOC106573949 coding upstream 13943 15187973 ~ 15191816 (-)
LOC110488514 slc30a7 coding upstream 69590 15243620 ~ 15272539 (-)
vcam1b vcam1 coding upstream 120562 15294592 ~ 15307175 (-)
LOC110488652 LOC106573980 coding upstream 135913 15309943 ~ 15316397 (-)
G14107 NA non-coding downstream 29632 15084979 ~ 15085294 (-)
G14104 NA non-coding downstream 32255 15079864 ~ 15082671 (-)
G14105 LOC106574072 non-coding downstream 38563 15075934 ~ 15076363 (-)
G14102 NA non-coding downstream 41719 15072988 ~ 15073207 (-)
G14096 NA non-coding downstream 50870 15063737 ~ 15064056 (-)
G14162 NA non-coding upstream 10391 15184421 ~ 15184721 (-)
G14183 NA non-coding upstream 39266 15213296 ~ 15213764 (-)
G14185 NA non-coding upstream 41755 15215785 ~ 15216058 (-)
G14188 NA non-coding upstream 46735 15220765 ~ 15221079 (-)
G13196 LOC106574055 other downstream 746593 14366290 ~ 14368501 (-)
G13195 fam163a other downstream 765448 14347082 ~ 14349478 (-)
G13000 NA other downstream 941583 14141880 ~ 14173343 (-)
G12845 NA other downstream 1249455 13863817 ~ 13865471 (-)
LOC110488740 cdc14a other upstream 160049 15325555 ~ 15394233 (-)
LOC110531395 LOC106613616 other upstream 1014974 16181514 ~ 16295527 (-)
G15470 NA other upstream 1357017 16531047 ~ 16531476 (-)
LOC110492105 homer3 other upstream 1686619 16838135 ~ 16871992 (-)
G14138 NA non-coding downstream 44019 15119520 ~ 15122162 (-)

Expression


Co-expression Network