XLOC_019990 (si:dkey-15h8.17)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_019990
gene name si:dkey-15h8.17
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 1868983 ~ 1897752 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00039845
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>TCONS_00039848
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>TCONS_00039849
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Function

symbol description
si:dkey-15h8.17 Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane.

GO:

id name namespace
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-141222-9 Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane.

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000099428

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00039845 False 791 mRNA 0.43 5 1868983 1891553
TCONS_00039848 False 3169 mRNA 0.38 8 1882942 1897752
TCONS_00039849 True 2893 mRNA 0.35 3 1887750 1894577

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_019989 znf1174 coding upstream 7084 1853999 ~ 1861899 (+)
XLOC_019988 znf1182 coding upstream 19573 1846147 ~ 1849410 (+)
XLOC_019987 znf1183 coding upstream 30407 1836782 ~ 1838576 (+)
XLOC_019986 znf1002 coding upstream 43169 1821718 ~ 1825814 (+)
XLOC_019985 znf1184 coding upstream 50420 1815408 ~ 1818563 (+)
XLOC_019992 znf1158 coding downstream 1390 1899142 ~ 1901705 (+)
XLOC_019993 si:dkey-15h8.10 coding downstream 6794 1904546 ~ 1909424 (+)
XLOC_019994 znf1156 coding downstream 13517 1911269 ~ 1919599 (+)
XLOC_019995 znf1181 coding downstream 24541 1922293 ~ 1925346 (+)
XLOC_019996 znf1153 coding downstream 32837 1930589 ~ 1935844 (+)
XLOC_019977 BX649416.3 non-coding upstream 136873 1725568 ~ 1732110 (+)
XLOC_019971 NA non-coding upstream 203512 1660187 ~ 1665471 (+)
XLOC_019970 BX649416.2 non-coding upstream 215045 1650128 ~ 1653938 (+)
XLOC_019963 AL954741.1 non-coding upstream 291237 1576863 ~ 1577746 (+)
XLOC_019947 BX322657.1 non-coding upstream 484914 1377331 ~ 1384069 (+)
XLOC_020000 NA non-coding downstream 109489 2007241 ~ 2290657 (+)
XLOC_020006 BX640537.2 non-coding downstream 262287 2160039 ~ 2163446 (+)
XLOC_020007 BX640537.1 non-coding downstream 278105 2175857 ~ 2178463 (+)
XLOC_020013 NA non-coding downstream 339400 2237152 ~ 2239093 (+)
XLOC_020033 NA non-coding downstream 648334 2546086 ~ 2546878 (+)

Expression


Co-expression Network