G24541


Basic Information

Item Value
gene id G24541
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 24228039 ~ 24231869 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU28300
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>TU28293
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>TU28299
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>TU28301
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Function

NR:

description
PREDICTED: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1-like isoform X7

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU28300 False 3369 lncRNA 0.37 3 24228039 24231869
TU28293 False 3328 lncRNA 0.36 2 24228113 24231869
TU28299 False 3229 lncRNA 0.37 2 24228113 24231869
TU28301 True 3526 lncRNA 0.46 2 24228113 24231869

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ccdc113 ccdc113 coding downstream 101411 24119224 ~ 24126628 (-)
LOC118948024 NA coding downstream 125115 24091604 ~ 24102924 (-)
uba2 sae2 coding downstream 155629 24050309 ~ 24072410 (-)
LOC110512077 LOC106573636 coding downstream 178606 24034225 ~ 24049433 (-)
LOC110511826 LOC106573635 coding downstream 212262 23981215 ~ 24015777 (-)
LOC110513500 LOC106573646 coding upstream 1347 24233216 ~ 24288176 (-)
LOC110513605 LOC106573647 coding upstream 65829 24297698 ~ 24343156 (-)
LOC110513914 LOC106573648 coding upstream 176176 24408045 ~ 24410610 (-)
LOC110514811 ccl8 coding upstream 320523 24552392 ~ 24554074 (-)
ciapin1 LOC106573658 coding upstream 364216 24596085 ~ 24611535 (-)
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G24507 NA non-coding downstream 110249 24116799 ~ 24117790 (-)
G24504 NA non-coding downstream 115391 24111044 ~ 24112648 (-)
G24515 NA non-coding downstream 123589 24103548 ~ 24104450 (-)
G24514 NA non-coding downstream 131147 24096576 ~ 24096892 (-)
G24621 NA non-coding upstream 76730 24308599 ~ 24308889 (-)
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G24672 NA non-coding upstream 185084 24416953 ~ 24417509 (-)
G24675 NA non-coding upstream 194454 24426323 ~ 24426650 (-)
G24679 NA non-coding upstream 208953 24440822 ~ 24441043 (-)
G24542 NA other downstream 1549 24222907 ~ 24226490 (-)
LOC110511130 LOC106573631 other downstream 401548 23821656 ~ 23861029 (-)
G23394 NA other downstream 603690 23624026 ~ 23624349 (-)
G22350 LOC106573623 other downstream 1384734 22839845 ~ 22843305 (-)
G21993 NA other downstream 1845831 22381870 ~ 22382208 (-)
znf276 znf276 other upstream 632218 24853824 ~ 24865158 (-)
LOC118956210 NA other upstream 696479 24910984 ~ 24938701 (-)
LOC110518671 klhl36 other upstream 713039 24944908 ~ 24972465 (-)
G25115 zfpm1 other upstream 1048723 25280592 ~ 25281030 (-)

Expression


Co-expression Network