G36588


Basic Information

Item Value
gene id G36588
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 34713205 ~ 34808214 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU41377
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>TU41376
CATGACAAGGCAGtttttatgtgtttttattttacattttgacAAGTCCCCCTAATGATACAAGATAGATTGTGTTTTTGTCACATACTGATGCTCTAGTTATACAGTGAATAATATTGTTTATGGATTAAAAAAAGGAGATGAACTGTTAACTGGATGTCTGAGCTGCTATACATGACTAGGGGATACTTGGTGGTTGGTTGGTGTACTTTAGCTATCAGGGAAGTTCAAAGGACTTCAATTAAGCTGTTATAAGACAGTGAAAATACACGAAACAAACTGGTACAGTTAAGAGATGGCACACATCTGGAGCTCAAAGCCAGAGGTGTGGACTTGAGTCACATGACTTTGACTCAATTCACAAATTTGATGACTTGAGACTCAGCctgatagaaaataaaataccTTGATTATCTGGCCAGGTTTTGGAACGATTTGACTCCGTGGAGAGCCAGAGACAGTATCGCACttgcaaaaaacaacaacatattggCTAGTGAAACGCACACATGGACCTATGATTGGACCAGCAAAGTCACCCAACACTGGGTGAGTTAGCGTAGTGAGAAGGTTTTAGGGAGTTTAAACTGAAtgggcaaaatatatatatatattttttatacatatTTTAATAGGCTATCTATAGCCTACCATTTGTATTGTATATTTATACAATTGCTTATTCGATCTGGTCATTAACATAGGCCTACGGCATTGAACAATTATTTGTAAAACATATCATCTGTGCTTCAGAACCAAAAAGCTGCGGGTCTTGACTGTTGACCAATGTCCAGTCATCAGCATTGGTGCGCAAAGGCGGTCGCACACATCCAAATAGTGACCAAAAAAGCACTTGTTTAATTTTCTCCGATTTTGCCTGGTAACAACAGAGTAGCCTGCCTACATTAATATGATCCATATAAAGTACCGTTTAGCAATGGTGATTTCATTTATCATTTTCAAATTTCAGATATGGCTTAGTTTGGGTGGGTTATAATTATACAGCTCAGTGGTAACATCACACTACCTTCAATACTTATGGGATGAAGATGTAACATATTCTGGCGAATTAATTACTTATTTGTGAGGAAGAAAAAGGCTAGACAGATCATGCTTTCCATCCGATCCGGCAGCCTCTGCTGCATACAGGTATGCCATTTGATCCTGCTAGCTCTGGACTCCAGCGAAGTGACAATGACCACGTTTACATGCGCACAGTAGTCCGGATAGGAGCTCATATCCCGCTTAAAATCTTATTCGGCTAAATTGTTTACATGCACCTCTGATATCCCGCTCACGAGTAACCGTGAATAAACAGAATATTCCCAATTTAAATTAATATGGGCTAAATGGGATAGTAACTGAAatatggacactgactgtaggcctaTTACCTCTCACACGTAGCGGAGTgagtataatttgtggaacgttccaactttgtaaataacaaggttgccaacaaacaacgcattCAAAGTTCTATAGTGGCAGAATAAGATACCGGGTAGGTTGTTGGCAGTTTGGTTAAATTTTTCACTCACCACATTTATTCAGAAGAATGTATATCCTTGATCTGGTATCCTATggacaaacattaagaataaTCTATGTGGTGAGTTGATGCCTATTTAGCAGCTAGATAGCTAGGTGAATTGATCGTGCaactttgtatgcgttgtttgttggcatCCTTGTACTTCAcgaagtttttggaacagattcaTGTTGGAAgtggaacgttccacaaattatacccacaaCATATAGCATAATAAAATATTAACTCCTTCAGAATTATGCATTTATTGCAGTAAAATTATACAACAAATGTTAATTTCGTCATGGGAACAGGAATGgagaaatattatttatttattttagcatCTCGAGAAAATACAAATGCCAGGGTAATGTGTTATCTTTGACACTGTAATGCAAGCAGACATATGCACCCAAGCCAAACTGAAGTCTTATCAGAAATGTGTTTAATTGTTCTCAGCTTTTCTTTTCCTTAAAACCAGTCAAACTGATTACATTTTGCACAGGACCAATCTTTCCACTGTTTTGGAGTTGTTGCATTTTCTTTCAGGTACCTAAACAAAACAGACAACTTTACCGGTATTTACTAGATTACTAATGCATTCATTCTATCAATGTaagacattattctggtgagcactactttatttagtcttctgGGGCAACAAtttatgacagaagagaagctgcatgtaggCCTATCTAACCATAGTTGACAAACAATTGGCCTACCAAATGTAGTAAAttatatggcctaccaaatgtcagaagTTATAAGCAGAAAGTTGTCTAAATTAGTGGTGAATGTAGCTAGTCGGCTATACGGTCCAGTATGGAGTAGCGGCAAAATACATTATTATGGAATTATGGTGGATTGAATTTGACAGGTAGCCCACCCTTTGAAGTGATTTGACAATCTGACGAAAACGTCATCGTAGAACCCCATGGTCTGCACAACACAACATATGCGCAACTGAGCCTGCGCAGACAGCGAAAAATAACAGTTAAGGGTATAAGTTGTTTACATCCCGTCTAAAATCAGCATATCCCAGACATTTTATCTGGGTTTCTCATAACCGGGACAAAAGCTTTTTTGGGTTATTGTAATTGGGATATGATGTTTATATGCACCATCTCAAAAACAGAATACTTGAGTATCCTGAATAATAACGggatattggtgtgcatgtaaacgtGGTCACTGTGACATGATATCCCTAGTTGATATCGACAGCTAACATGAATGACTTTCAGCTCAAAATGCAGGTGTAAAAGGGTTCTGACTTATGTTTATTTGTGTATCTTTCGTTTTGAAAATGCATCACCGTTTTTTGGCCGTAATGATAGGCTAAATTTGAGCAGCGATTCTGCGCACCTTTGCGTGGGGGGGGGGTCTCGAACTTTGAACCATTCCTTTTTGGGGGTTGCGGGTCAAACAGTTAGAAAACCACTGAGCTGGCAAACAGATTGCTGATTTGCTGAACAAGCTATAGGATCGTGTGCAGCGCAAACGTCAAATTGTAGGGACAGAGGATTGTCATAAATTAATATACATCTCATTTTTTTTTGCTGAAGCTCATCAGCAATGGGGCATCAAGCAACAATTTctagcataggcctactggtGTTTTGGTATGTCAAAATTGCTTGAAATGTATAATTTACTTATAAGGCTTGCATTTGGAATTTGGTAAAATAAATTATTACATAATCAAAATGTGATGTtgacaaaataatgaaaagggctgtctggtagcctacattttttttaaacaagcctttgcctgtatattttttatttttttacttgatTTGAGACACAAAAAAAACTTGCGACTCGACTCGCTCTTAGAATGCAAGACTAGGACTTGACTCAAGACTCAacccgttctacttgggactcGATTTGAACCTTGTGACTTGAGATTTGCAGTGACTCGAATAatagtgacttggtcccacctctagTTCCCGTGTGAAAGCAGAGTTTGAAAGCTATTTTAATTGGTTAATCTTTACTACTCTGCTCTATCAGCGGATTGGCCAGCACTTGAGTGGGTGTGGCATTGGATATCAGCAAGGTGACACTTTACGTGTGTCCCCTAATGACAATGTCACAGATTTGCCTAAAAGCGGTGCTGCTGAAGCCTGTCTGTGGGGTGAATGTCTGAGTTAGCAAGAACTTAGTGGTTCACAAAACATAGTGGTTTGATGTAGAGACAGTGACGTGTATGGAAACGCAACACGATCAAATTAAAACAAATGATAAAAGGAAATGTACAatgttttctctctttccatTGTGGTTTTCATGGTTCTTTTTTGAATAGGTCTCCTTTTATTTGACATATTCCATTTCAATAACATCCTTAACGTAAAGGACACAGCACTATCTTGTTGACTCTCTATAGTATTTACAGGATCTAACCGACAGCAATACACATTTAGATtataccctctctcccctcctactGACACCACTCTCACAAATAATAAACTGGTCACCATGGAGGTCCCATGACTCCTCATCACCAGCGGATCAACAATGCTCTCCTCTACAAGATCTTCTTCTTGCTGTTTGATACTTGTTGAAGAATAAAAGCAGTAGAAGAAGTAGACAAGCATCCCTCGCCTTCTACACTCAACCTGATATTGGGGATTGCAGTATGACACCTGTTATTTCAATTCATTCTGTGTTGGCCACCTCTCTACTCCCTTCATCTGTTTAGATGTtatactgtaggctacagtatgcTATGTGAACTGGAAAAGACAACTGTAGAAAGTAAAATGTCCTATCATAAGTACGCAAAcgatgtactgtatattacctatGATAAGAGTGAAATCAAGGAGTATATGTGGAAAGGTCAACTTCTCAGGACATGTATCAGGCAGAATATGAGCCATTAGACATTGTAAAGTCAACTTCTAAAACTGTTGGACGGACCAAAGCAAGCCTATTATATCCAAGAAACTACCAGTCTTTCAATGGTGGCACTTCAATATCAAATCTTTTTCTAACTTAAAGGGGAACTCCTCTCAAAAACGATCTTTTTGTATTTTTCCATAAATGATTAGCATTTTGCATCATCATCATGGTGGCCGGTGACATCTTGAAAGTCTAATATCTTGAAAACTTAAATGCTTAAACTGTCTATCCTCATTTTGACTTGATCCACCTTAAAGAGAAGGTAGAAGGACACAGAAGGCACCACTACTTTCTTAGTCAGCATTATCGATGTCATGACTTTACTTTCCTTGTCGCCTTATGGACAGTCAACCAAGGCCAATCTGGCCTTATTCTCAGTGGACTCAACTCAAACAGGGACGGACACCCACCTGTACAACAGTGCTTCCTGTGAGGGAGTAGTGTTGAACAGTCAGAACCGTGGGATTATGGCTTCTCCTGAAGAGGACCTTCAACTGTCCTCAACCTGATATTCAGACTGATTATCTCTGTACATGTACATTAGGACACTTCACAGTTGGACCAGATGGAAAGGAATATAACATTGGATTGTTTCTGTAATACTGTATTTGCATCATTAGAAGTCCAGAAGCTGAatgattctctctctttttttatctttttttaaaaatctttctCTGTTCACAAAGCACTGACAGTTATCGCTGTTTCCATAGCAACCTCTTCCTGCCACTGCTGTGTTTGGAGATTTGATCAGAGGAGCTGTTGTCCAATGACAGATGACTACTGAGACAGTTATGGACCATGGTGGACGGGGCTTACTATCAGGTCAACATCATCAACATAAGTCAGAACCCTTTCAATGTCAAAATGACCAATATGATGAAGAGCCTCCATTGCAAAACTGAGGCTTCATTCCATTTTAGcccctagtcccttcccctagctcCTGCTCAGTGTTCACACCCACAGATCTGAAAGGATCTGGATAGGTGTAATAAATATGATGGCAACTCCATTTAGCTTAATTGAAGGGCTAACTGTGGCCATCACCACGTCGCTTACACCTGCTCGGTCCTTTGAGATCTGACGCCAGTACATTTTCAAACTATGAATAAAAAAATGGTGGACTTCAAAGCTGGGGAAGGAACTAGAGAAGAGAACTGGAACCAGGCATAAGCCACATAACACAACCAGTGAAAGGATAAGCTCTCTGAAATAGGTCCAAGTCCCACCAATTGTTCCTGACCCACCATTTGGTAAATACTGGTCTAAAacatcatccctctcttcctttctatttctttatttttccttTCGTCACTTCCTCTTGTTTGATTATTGGTTGTGGATGCTACTTTCATAGTTTGTATGTGAGTCATCTGTATTTGTCTACTGCCTATAcataggtgttcctaatgtgtaTATTTACAGATCACACTTTCTTGTACACGATACAGGTGTTAGCTCGGACCAATCACATCAatgtactctctctcttcttcgaTCTTtgaacaaaaacatatttacacCAAACCTCACCTGACCAAATAATATGCTTCATGTCCTCTTGATTTTTGCGCCATTTGTGTGTCCtaattttgtgtgtgtgattgtgtgtgcatTACCCTCCTAGCCATGCATTGGAACATGTGAAATAGCAGTAGTAGGAATttcattgttgttattgttttttaAACCGAGGAGGATACATAATATCTAAAATACGGTACCAAGACTTATTCCTAGAACCGTATCATAGAAAAAGAAACAGGCAATCCATCTAGAAGAtggaaaataaatgtataaaCAAATGAATCATTAAATAAgtcaataaattaataaaacacgTCGCATACTGTAGAACGGAAATTAACATTCCAGTTTTAGAGGGATACTGTATATATGGGGTATTTTACAATGGAAAGAAGAGCCACCAGTACCCCCTGGTGGTGTGATTGATGAACCTACACAAGCAGCAGCAGGAAGAAGCGGAGATGGTTGTCATGGCAACACTTCCTACTTCCTGCCTGCTTTACTCCAGGTAGATGTCTTCGGTGGGGCAAGCGTATTCCAGGTGCTCCTGGTAATACTCCTGGAAAGCCCGTc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU41377 False 4433 lncRNA 0.39 2 34713205 34808214
TU41376 True 6583 lncRNA 0.39 2 34801602 34808214
Loading

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
zp2.3 zp2.3 coding downstream 22246 34686750 ~ 34690959 (-)
LOC110521923 LOC106573414 coding downstream 48734 34659087 ~ 34664471 (-)
cpt1 cpt1 coding downstream 53052 34647385 ~ 34660153 (-)
LOC110521764 LOC106573421 coding downstream 223026 34473968 ~ 34490179 (-)
LOC110521742 LOC105022204 coding downstream 246494 34459428 ~ 34466711 (-)
LOC118947385 NA coding upstream 48247 34856461 ~ 34868295 (-)
LOC110521966 rabl2a coding upstream 473071 35281285 ~ 35285817 (-)
odf3b odf3b coding upstream 478327 35286541 ~ 35287452 (-)
LOC110520384 LOC106573404 coding upstream 505739 35313953 ~ 35316192 (-)
LOC110532260 NA coding upstream 626581 35433794 ~ 35694776 (-)
G36585 NA non-coding downstream 7042 34705900 ~ 34706163 (-)
G36579 NA non-coding downstream 9388 34698799 ~ 34703817 (-)
G36491 NA non-coding downstream 158448 34552678 ~ 34554757 (-)
G36471 NA non-coding downstream 191636 34521306 ~ 34521569 (-)
G36438 NA non-coding downstream 242159 34469826 ~ 34471046 (-)
G36674 NA non-coding upstream 10115 34818329 ~ 34819021 (-)
G36680 NA non-coding upstream 15025 34823239 ~ 34823474 (-)
G36701 NA non-coding upstream 31188 34839402 ~ 34839649 (-)
G37053 NA non-coding upstream 73587 34881801 ~ 34882129 (-)
G37061 LOC106568688 non-coding upstream 88919 34897133 ~ 34897464 (-)
G36196 NA other downstream 331973 34341562 ~ 34381232 (-)
G36141 NA other downstream 350469 34277700 ~ 34362736 (-)
G35628 NA other downstream 845160 33867558 ~ 33868045 (-)
G35299 NA other downstream 1260792 33442368 ~ 33452413 (-)
G35075 LOC106573452 other downstream 1604708 33107119 ~ 33108497 (-)
G37310 LOC106573403 other upstream 465495 35273709 ~ 35278005 (-)
G37907 NA other upstream 632704 35440918 ~ 35441328 (-)
G37976 NA other upstream 775078 35583292 ~ 35583608 (-)
G38045 LOC106573386 other upstream 913226 35721440 ~ 35722056 (-)
LOC110522187 LOC106573361 other upstream 1561880 36370091 ~ 36409064 (-)

Expression

G36588 Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 6.
End of interactive chart.

G36588 Expression in each Bioproject

Bar chart with 20 bars.
G36588 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 300.
End of interactive chart.

Co-expression Network