G39502


Basic Information

Item Value
gene id G39502
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 37077411 ~ 37196648 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>TU44623
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>TU44624
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>TU44620
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>TU44622
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>TU44619
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

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LOC110522333 NA coding upstream 15772 37212420 ~ 37248824 (-)
pdhx pdhx coding upstream 90908 37287556 ~ 37347643 (-)
LOC110522348 LOC106573397 coding upstream 183920 37380568 ~ 37397634 (-)
LOC118966683 NA coding upstream 474201 37670849 ~ 37675533 (-)
LOC118966685 NA coding upstream 479733 37676381 ~ 37681639 (-)
G39495 NA non-coding downstream 5529 37071634 ~ 37071882 (-)
G39284 NA non-coding downstream 6221 37070875 ~ 37071190 (-)
G39282 NA non-coding downstream 6733 37070468 ~ 37070678 (-)
G39270 NA non-coding downstream 15391 37061816 ~ 37062020 (-)
G39240 NA non-coding downstream 38544 37038505 ~ 37038867 (-)
G39572 NA non-coding upstream 510 37197158 ~ 37197436 (-)
G39575 NA non-coding upstream 2837 37199485 ~ 37202357 (-)
G39618 NA non-coding upstream 78814 37275462 ~ 37275700 (-)
G39706 NA non-coding upstream 212554 37409202 ~ 37409826 (-)
G39711 NA non-coding upstream 222514 37419162 ~ 37419471 (-)
G38855 NA other downstream 566582 36508538 ~ 36510829 (-)
LOC110522187 LOC106573361 other downstream 668392 36370091 ~ 36409064 (-)
G38045 LOC106573386 other downstream 1355355 35721440 ~ 35722056 (-)
G37976 NA other downstream 1493803 35583292 ~ 35583608 (-)
G37907 NA other downstream 1636083 35440918 ~ 35441328 (-)
G40079 NA other upstream 519892 37716540 ~ 37717033 (-)
G40732 NA other upstream 928632 38125280 ~ 38125725 (-)
G40768 LOC106573348 other upstream 990840 38187488 ~ 38191736 (-)
G41868 NA other upstream 1825157 39021805 ~ 39022025 (-)
tspan9a LOC106573177 other upstream 5842080 42852829 ~ 43129052 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) G25527 NA non-coding CI01000004 null 1332563 ~ 1333989 (-)
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) G24972 NA non-coding NC_048565.1 CM023219.2 24918667 ~ 24962734 (-)
bowfin (Amia calva) G22971 NA non-coding CM030123.1 CM030123.1 14184702 ~ 14189688 (-)
mexican tetra (Astyanax mexicanus) G21299 NA non-coding NC_035899.1 CM008302.1 24216524 ~ 24246057 (-)