G72866


Basic Information

Item Value
gene id G72866
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 65657325 ~ 65662302 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU80537
gagggagggagagagagagaaagagagaaagagagagaggggtatttgTATTGTTCGGTCTGAGTTTGTGTGTCAGACAGGAGCAACATCTCAACTTCTCTGGGAGGAAACTAGAGAGTGTGAGAGTATTTGTGTAGAAGTAGTGtcgtagggtagtagtagtgtgatggtagtgtagtagtagtgtgatagTGGTGTGATAGTAGTGtactagtagtgtagtggtggtgtagtagtcgtttgatagtagtgtagtagtagtagtagtgtgatagtagtggtggtagtagtggtaagatagtattgtagtagtagtgtagtggtggtgtagtagtgATGGGATATTAGTGTTAtaatgtggtggtagtagtagtagtagttgtgtgagagtagtgttgtagtagtagtagtttaataGTAGTGTGATTGTAGCATAGTACTAGTGCAGTAGTAGCATGAtagcagtgtagtagtagtgtgatactagtgtagtagtagcagtagtatttgtgtagtagtgATGTGATATTAGTGTTAtaatgtggtggtagtagtagtagtagttgtgtgaGAGTAGtgttttagtagtagtagtagtgtgatagtagtggtggtagtagcggtGTGATagctgtgtagtagtagtagtgtgatagTAGTGGTGTTAGAAGTGATGTgatagtagtgcagtagtagtgtagtggtggtagtagcggtgtgatagtagtagtgtggtagtagtggtggtagtagcggtgtgatagtagtagtgtggtagtagtggtggtagtagcggtGTGATagctgtgtagtagtagtagtgtgatagTAGTGGTGTTAGAAGTGATGTgatagtagtgcagtagtagtgtagtggtggtgtagtagtgatgtgatatcagtgttataatgtggtggtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagcggtgtgatagtagtgtagtagtagtagtagtagtagtagtagtattgtagttgtagtagtagtgtgatagtggtagtagtagtagtggtgtaatagcagtgtagtagtgtgatagtagtagtgtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtgtgatagtagtaatagtagtagtagtagaagtggtgtgatagcagtgtagtagtagtgtgagATTGGTAGTGtgatagtggtgtagtagtagtgtagtagtagcagcagtagtagtagtggtgtgatagcagtgtagtagtagtgtgagAGTAGTAGTGTGATAGTGTTGtgatagtggtgtagtagtagtgtagtagtagaagcagtagtagtagtgtgatagcagtgtagtagtagtgtagttgtAGTGTGATAGTAGTAGTGTGATAGTGTTGTAATCGTAGCAATAGTAGTGTGAtagcagtgtagtagtagtgtagtagtagtgtgatagTAGTAGTGTGATAGTGGTGTAatcgtagcagtagtagtgtgatagggGTGtgatagtggtgtagtagtagtgtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtgtgatagtagtgtagtagtggtgtgatagtggtgtgatagtagtgtagtagtagtagtgtagtagtagtggtggaatatcagtgtagtagtagtgtgatagTGGTGTGATAGAGGTGTAGAAGtagcgtagtagtagcagtagtagtagtagtagtagtgtgatagtagtggtgtgatagtagtgtagtagtagtagtagtagtagtgtgatagtagtagtagtagtggtgtgatAGCAGTGTAGTATTAGTGTGATAGTAGTGTgacagtggtgtagtagtggtgtgatagtggtgtgatagtagtgtagtagtagtagtgtgatagcagtagcagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtgtgatagtagtgtagtagtggtgtgataGGGGTGTGATAGTAGTTTAGTAGTAGTGTgatagtaggagtagtagtagtgtagtagtagtggtggaatAGCAGTgcagtagtagtgtgatagtgGTGtgatagtggtgtagtagtagtgtagtagtagcagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtgtgatagtagtagtagtagtagcagtgtgatAGCAGTGGATAGTGGTGTGATAGTAgtttagtagtagtgtagtagtcgtgtgatagtagtagtgtgatagtggtgtagtagtggtgtgagAGTAATAGTGtgatagtggtgtagtagtggtgtgatagtggtgtgatagtagtgtagtagtagtgtagtagtagcagtagtagtagtagtagtagtagtagtgtgatagtagtagtagtagtagtagtggtgtgatAGCAGTGTGATAGTGGTgtgatagtagtgtagtagtagtgtagtagtcgtgtgatagtagtagtgtggtagtagtggtggtagtagcggtGTGATagctgtgtagtagtagtagtgtgatagTAGTGGTGTTAGAAGTGATGTgatagtagtgcagtagtagtgtagtggtggtatagtagtgaTGTGGTATCAGTGTTAtaatgtggtggtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagctgggtgatagtagtgtagtattagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtgtagttgtagtagtagtgtgatagtagtagcagtagtagttgtgtaatagcagtgtagtagtgtgatagtagtagtgtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtgtgatagtagtaatagcagtagtagtagaagtggtgtgatagcagtgtagtagtagtgtgatagTGTTGTAATCGTAGCAATAGTACTGTGAtagcagtgtagtagtagtgtagtagtagtgtgataATAGTAGTGTGATAGTGGTGTAATCGTAGCAGTGGTAGTGTGAtagcagtgtagtagtagtgttgtggtcatgtgatagtagtagtgtgatagtggtgtagtagtagtgtgatagTATTGTGATAGGGGTGtgatagtggtgtagtagtagtgtagtagtagtagtagttgtagcagtagtagtagtagtagtgtgatagcagtgtagtagtggtgtgatagtaggagtagtagtagtgtagtagtagtggtggaatatcagtgtagtagtagtgtgatagTGGTGTGATAGTGGTGTAGAAGtagcgtagtagtagcagtagtagtagtagtagtagtagtgtgatagtagtgtagtagtggtgtgatagtagtgtagtagtagtagttgtagtgtgatagtagtagtagtagtagtggtgtgatACCAGTGTAGTATTAGTGTGATAGTAGTGtgatagtggtgtagtagtggtgtgataGTGGTGTGATAGTAGCGTTGTAGTGCTAGTGTgaaagcagtagcagtagtagtagttgtagtagtagtagtattagtagtgtgatagtagtgtagtagtggtgtgataGTGGTGTGATAGTAGTTTAGTAGTAGTGTgatagtaggagtagtagtagtgtagtagtagtggtggaatagcagtgtagtagtagtgtgatagTGGTGtgatagtggtgtagtagtagtgtagtagtagcagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagcagtagtagtagtgtgatagtagtagtagtagtagtagtggtgtgatAGCAGTGTGATAGTGGTgtgatagtagtgtagtagtagtgtagtagtcgtgtgatagtagtagtgtgatagtggtgtagtagtggtgtgatagtggtgtgatagtagtgtagtagtagtagtgtgatagtagtagtagtagtagttgttgtgtGCTAGCAGTGTAGTAGTTGTGTAGTAGTACTGTTATAGTTGTGTACTAGTAGTGTGACAGTAGTTGTGTAATGGTATTGTGATAGTAGTGTACTAGTATTTgtgtactagtagtagtagtagtagtagtttgatAGTAGTGCAgaggtagtgtagtagtagtgtagtggtggtgtagtagtgtgatATTGGTGTTAtaatgtggtggtagtagtagtagtagtagtgtgatagagtgtagtagtagtagtattagtgtgatagtagtggtggtagtagtggtgtgataatgatgtagtagtagtattagtgtgatagtagtggtggtagtagtggtgtgatagtagtgtagtagtagtagtgcgatagtagtggtggtagtagtggtatgatagtagtgtagtagtggtgtagtagtgataTGATATTAGTGTTAtaatgtggtggtagtagtagttgtgtgatagtagtgtagtagtagtgtgatagtagtggtgtgatagtagtgtagtagtagtagtggtgtgaaagtagtagtagtggtgtgatAGTAGTGTATTAGAAGTAGTATTgtgatagtagtgtagtagtggtggtgtgatagtagtgtagtagtagtgtgatagtagtggtggtagtagtggtgtgaTAGTCgtgtagtagtagtgtgatagtagtagtagtgtagtagtagtgtgatagTAGTGTGATAGTGGTGTGATAGTAGTCTAGTAGTTatgtaatattagtagtagtagtagtagtagta

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU80537 True 4648 lncRNA 0.39 3 65657325 65662302

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110527092 tisd coding upstream 175100 65478933 ~ 65482225 (+)
thada LOC106576760 coding upstream 180810 65372299 ~ 65476515 (+)
LOC110527082 epcam coding upstream 361221 65291708 ~ 65296104 (+)
LOC110527046 LOC106576764 coding upstream 435638 65173289 ~ 65221687 (+)
prop1 LOC100192335 coding upstream 489448 65161658 ~ 65167877 (+)
LOC110527114 LOC106576759 coding downstream 17722 65680024 ~ 65697328 (+)
LOC110527123 NA coding downstream 132685 65794987 ~ 65799491 (+)
hcar1-3 LOC106576755 coding downstream 164045 65826347 ~ 65828743 (+)
LOC110527154 LOC106576753 coding downstream 236125 65898427 ~ 65911535 (+)
LOC110527164 LOC106576754 coding downstream 253279 65915581 ~ 65922285 (+)
G72812 NA non-coding upstream 93870 65563113 ~ 65563455 (+)
G72047 NA non-coding upstream 212652 65406430 ~ 65444673 (+)
G71997 plekhh2 non-coding upstream 328813 65327593 ~ 65328512 (+)
G71935 NA non-coding upstream 400850 65194818 ~ 65256475 (+)
G71945 NA non-coding upstream 425922 65230164 ~ 65231403 (+)
G72858 LOC100136012 non-coding downstream 24447 65686749 ~ 65735864 (+)
G72954 NA non-coding downstream 143657 65805959 ~ 65806285 (+)
G72960 NA non-coding downstream 169077 65831379 ~ 65831608 (+)
G73321 NA non-coding downstream 319367 65981669 ~ 65981892 (+)
LOC110526969 stk32c other upstream 755701 64809255 ~ 64946164 (+)
G70011 NA other upstream 2382029 63274963 ~ 63275296 (+)
G67930 mcmbp other upstream 3923937 61729765 ~ 61733388 (+)
G67806 LOC106581772 other upstream 4342073 61314874 ~ 61315252 (+)
G66188 NA other upstream 5715261 59941486 ~ 59942064 (+)
G73515 NA other downstream 625377 66287679 ~ 66288469 (+)
LOC118965274 LOC106576739 other downstream 758193 66417495 ~ 66424081 (+)
G74067 LOC106576735 other downstream 1093905 66756207 ~ 66758984 (+)
G74139 NA other downstream 1122033 66784335 ~ 66784969 (+)

Expression


Co-expression Network