G94259


Basic Information

Item Value
gene id G94259
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 83669522 ~ 83675928 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU103900
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>TU103901
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Function

NR:

description
transposase

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU103900 False 6293 lncRNA 0.40 2 83669522 83675928
TU103901 True 6312 lncRNA 0.40 2 83669522 83675928

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110530724 anx11 coding downstream 260222 83386983 ~ 83409300 (-)
LOC110530648 LOC106577192 coding downstream 294899 83272529 ~ 83374623 (-)
LOC100301648 LOC106577193 coding downstream 402359 82949609 ~ 83267163 (-)
LOC110530617 zn503 coding downstream 1227197 82439142 ~ 82442325 (-)
LOC110532782 LOC106577197 coding downstream 1367655 82291777 ~ 82301867 (-)
LOC110532793 lox5 coding upstream 136 83676064 ~ 83701456 (-)
LOC110530770 slc25a16 coding upstream 37424 83713352 ~ 83721914 (-)
LOC110530866 nfu1 coding upstream 151021 83814162 ~ 83851846 (-)
si:ch211-198a12.6 LOC106577248 coding upstream 275129 83951057 ~ 83956958 (-)
LOC110532804 NA coding upstream 290237 83966165 ~ 83967505 (-)
G94314 NA non-coding downstream 2604 83666572 ~ 83666918 (-)
G94313 NA non-coding downstream 3640 83665655 ~ 83665882 (-)
G94312 NA non-coding downstream 3928 83665080 ~ 83665594 (-)
G94311 NA non-coding downstream 5298 83663356 ~ 83664224 (-)
G94310 NA non-coding downstream 6351 83662849 ~ 83663171 (-)
G94316 NA non-coding upstream 10977 83686905 ~ 83687211 (-)
G94333 LOC106577185 non-coding upstream 47980 83723908 ~ 83725485 (-)
G94334 NA non-coding upstream 50801 83726729 ~ 83727048 (-)
G94336 LOC100194703 non-coding upstream 55899 83731827 ~ 83732179 (-)
G94201 NA other downstream 183585 83484056 ~ 83485937 (-)
G92566 NA other downstream 1507779 82160407 ~ 82161743 (-)
LOC110530475 eif4ebp2 other downstream 2052198 81607478 ~ 81629726 (-)
G94613 NA other upstream 125404 83801332 ~ 83802471 (-)
LOC110531033 LOC106577242 other upstream 482895 84157529 ~ 84256949 (-)
G94821 NA other upstream 527559 84203487 ~ 84204464 (-)
LOC110532813 LOC106613040 other upstream 615832 84291760 ~ 84331700 (-)
G95494 NA other upstream 1052936 84728864 ~ 84729423 (-)

Expression


Co-expression Network