G96002


Basic Information

Item Value
gene id G96002
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 85346858 ~ 85351766 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU105926
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>TU105927
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>TU105928
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>TU105929
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Function

NR:

description
collagen alpha-1(IX) chain

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU105926 False 2199 lncRNA 0.44 7 85346858 85351766
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TU105929 True 2592 TUCP 0.51 10 85346858 85351766

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110510598 LOC106594326 coding downstream 47217 85247338 ~ 85299641 (-)
LOC110510599 LOC106613623 coding downstream 102417 85213382 ~ 85244441 (-)
LOC110516660 tarbp1 coding downstream 139589 85171944 ~ 85207269 (-)
LOC118966724 LOC106613591 coding downstream 175003 85161750 ~ 85171855 (-)
LOC110522386 LOC106577258 coding downstream 564979 84760098 ~ 84781879 (-)
LOC110519057 col19a1 coding upstream 6456 85358222 ~ 85624716 (-)
LOC118964521 NA coding upstream 278835 85630601 ~ 85632159 (-)
LOC110531925 adgrb3 coding upstream 539811 85891577 ~ 86047176 (-)
LOC110513354 LOC106569852 coding upstream 870430 86222196 ~ 86223952 (-)
LOC110531234 LOC106563028 coding upstream 883473 86235239 ~ 86287517 (-)
G95973 NA non-coding downstream 118736 85227653 ~ 85228122 (-)
G95968 NA non-coding downstream 128652 85218005 ~ 85218206 (-)
G95965 NA non-coding downstream 133794 85212864 ~ 85213064 (-)
G95808 NA non-coding downstream 135100 85211546 ~ 85211758 (-)
G96062 NA non-coding upstream 100666 85452432 ~ 85456627 (-)
G96234 NA non-coding upstream 334642 85686408 ~ 85686727 (-)
G96239 NA non-coding upstream 342770 85694536 ~ 85699631 (-)
G96261 NA non-coding upstream 391647 85743413 ~ 85743933 (-)
G96294 NA non-coding upstream 457277 85809043 ~ 85810106 (-)
G95784 NA other downstream 187545 85157742 ~ 85159313 (-)
G95624 NA other downstream 366586 84979733 ~ 84980272 (-)
G95494 NA other downstream 617435 84728864 ~ 84729423 (-)
G97047 LOC106577388 other upstream 794243 86146009 ~ 86153321 (-)
G97176 NA other upstream 1040795 86392561 ~ 86393089 (-)
G97251 NA other upstream 1214711 86566477 ~ 86623311 (-)
G97308 NA other upstream 1435291 86787057 ~ 86788052 (-)
G97535 NA other upstream 1942591 87294357 ~ 87294999 (-)

Expression


Co-expression Network