G98510


Basic Information

Item Value
gene id G98510
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 88218829 ~ 88220804 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU109129
CTTCTTATGAAAGAAAAGCAATATCATGAAGGAATATTCCACCCACTCTCTGGAAGCTGCTCAGCACTTCCTGGTTCCTCTGAAGCTCCACCGACATTAACATATAGAGACCAATCCAGTTCTGTTACTTATCAGCTGCTCAGAGTCGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTCGCGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTGGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTCGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTCGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTGGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTCGTGTGGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTcgtgtggtgtggtggtatatTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTCGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTcgtgtggtgtggtggtatatTCTGTTACTCATCAGCTACTCAGAGTCGTGTGGTGTGGGGGTATATTCTCAGAGTCGTGTGGGGGTATATTCTGTGGGGGTA
>TU109132
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>TU109139
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>TU109140
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>TU109134
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>TU109136
CTTCTTATGAAAGAAAAGCAATATCATGAAGGAATATTCCACCCACTCTCTGGAAGCTGCTCAGCACTTCCTGGTTCCTCTGAAGCTCCACCGACATTAACATATAGAGACCAATCCAGTTCTGTTACTTATCAGCTGCTCAGAGTCGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTCGCGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTGGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTCGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTCGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTGGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTCGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTCGTGTGGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTCGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTCATGTGGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTGCTCAGAGTcgtgtggtgtggtggtatatTCTGTTACTCATCAGCTACTCAGAGTCGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTACTCAGTCGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTACTCAGTCGTGTGGTGGTATATTCTGTTACTCATCAGCTACTcagagtggtgtggtgtggtggtatatTCTGTTACTCATCAGCTACTCAGAGTTGTGTGGTGGTATATTCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU109129 False 627 TUCP 0.38 4 88218829 88220804
TU109132 False 487 TUCP 0.34 4 88218829 88220804
TU109139 False 861 TUCP 0.46 4 88218829 88220804
TU109140 False 407 TUCP 0.46 2 88218829 88220804
TU109134 False 676 TUCP 0.40 4 88219771 88220804
TU109136 True 795 TUCP 0.35 5 88219771 88220804

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
papolg papolg coding downstream 16671 88178952 ~ 88202158 (-)
LOC118966733 NA coding downstream 54218 88159117 ~ 88164611 (-)
LOC100499622 alb1 coding downstream 74363 88131038 ~ 88144466 (-)
LOC118936685 LOC106577316 coding downstream 94102 88092044 ~ 88124727 (-)
pex13 LOC106592834 coding downstream 153706 88054545 ~ 88065123 (-)
LOC118966057 NA coding upstream 7084 88224741 ~ 88230342 (-)
LOC118966058 NA coding upstream 11137 88231941 ~ 88234672 (-)
LOC118936686 LOC106594327 coding upstream 15777 88236581 ~ 88270980 (-)
LOC118966063 NA coding upstream 494069 88714598 ~ 88715755 (-)
LOC118966064 NA coding upstream 495514 88716318 ~ 88717077 (-)
G98502 actr2a non-coding downstream 6628 88210961 ~ 88212201 (-)
G98501 NA non-coding downstream 14220 88204290 ~ 88204609 (-)
G98499 NA non-coding downstream 20898 88197610 ~ 88197931 (-)
G98488 NA non-coding downstream 51517 88165837 ~ 88167312 (-)
G98478 NA non-coding downstream 104547 88111666 ~ 88114282 (-)
G98505 NA non-coding upstream 2527 88223331 ~ 88224678 (-)
G98514 NA non-coding upstream 17196 88238000 ~ 88238331 (-)
G98522 NA non-coding upstream 32942 88253746 ~ 88254060 (-)
LOC110531505 LOC106597820 other downstream 302929 87911053 ~ 87919678 (-)
G97535 NA other downstream 923830 87294357 ~ 87294999 (-)
G97308 NA other downstream 1430777 86787057 ~ 86788052 (-)
G97251 NA other downstream 1595518 86566477 ~ 86623311 (-)
G98549 NA other upstream 93472 88314276 ~ 88314696 (-)
G98616 NA other upstream 331170 88551974 ~ 88644067 (-)
LOC118966065 NA other upstream 556735 88757265 ~ 88782119 (-)
G98878 NA other upstream 855043 89075847 ~ 89076238 (-)
ghitm LOC100136239 other upstream 1002346 89223150 ~ 89270371 (-)

Expression


Co-expression Network