XLOC_002050 (igsf9a)



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_002050
gene name igsf9a
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 19026988 ~ 19093808 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00003968
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TCONS_00003971 False 9402 mRNA 0.41 20 19039507 19093808
TCONS_00003970 False 9273 mRNA 0.41 21 19039507 19093808
TCONS_00003969 True 9263 mRNA 0.41 21 19039507 19093808

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_002049 tmem230a coding upstream 5412 19017146 ~ 19021576 (+)
XLOC_002048 dpysl2b coding upstream 34517 18952271 ~ 18992471 (+)
XLOC_002047 bnip3lb coding upstream 91043 18911152 ~ 18935945 (+)
XLOC_002046 ppp2r2ab coding upstream 120316 18877362 ~ 18906672 (+)
XLOC_002045 AL928714.1 coding upstream 224553 18798927 ~ 18802435 (+)
XLOC_002051 lrrtm4l1 coding downstream 216880 19310688 ~ 19394491 (+)
XLOC_002052 vsig8a coding downstream 432031 19525839 ~ 19551118 (+)
XLOC_002053 atp6v1b2 coding downstream 460796 19554604 ~ 19566474 (+)
XLOC_002054 CABZ01059627.1 coding downstream 475244 19569052 ~ 19570346 (+)
XLOC_002055 CABZ01059627.2 coding downstream 479983 19573791 ~ 19575962 (+)
XLOC_002043 NA non-coding upstream 744553 18240550 ~ 18282435 (+)
XLOC_002042 NA non-coding upstream 955482 18007123 ~ 18071506 (+)
XLOC_002040 BX927277.1 non-coding upstream 1136785 17890089 ~ 17890203 (+)
XLOC_002035 dre-mir-218b non-coding upstream 1331648 17695265 ~ 17695340 (+)
XLOC_002056 CABZ01059627.3 non-coding downstream 489481 19583289 ~ 19589733 (+)
XLOC_002058 CABZ01059623.1 non-coding downstream 508526 19602334 ~ 19725594 (+)
XLOC_002063 NA non-coding downstream 1283280 20377088 ~ 20381313 (+)
XLOC_002065 NA non-coding downstream 1354659 20448467 ~ 20452630 (+)
XLOC_002066 NA non-coding downstream 1407968 20501776 ~ 20502178 (+)

Expression



Co-expression Network