ptdss1a (LOC106595791)


Basic Information

Item Value
gene id ptdss1a
gene name LOC106595791
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 6653202 ~ 6684816 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

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RNA

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XM_036936407.1 False 1596 mRNA 0.51 12 6653202 6679166
XM_036936359.1 False 1660 mRNA 0.51 13 6653204 6679166
XM_036936370.1 False 1422 mRNA 0.52 13 6653442 6679122
XM_036936414.1 False 1350 mRNA 0.53 13 6653442 6679122
XM_036936384.1 False 1422 mRNA 0.52 14 6653442 6679496
XM_036936394.1 False 2739 mRNA 0.46 14 6653442 6681557
XM_036936378.1 False 3724 mRNA 0.45 14 6653442 6681562
XM_036936400.1 True 4541 mRNA 0.46 13 6653442 6684816

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110505995 LOC106573077 coding upstream 3408 6645216 ~ 6649794 (+)
zgc:158766 LOC106590969 coding upstream 23733 6545368 ~ 6629469 (+)
LOC118937387 NA coding upstream 31606 6619110 ~ 6621596 (+)
nkd2b LOC106574162 coding upstream 153504 6402676 ~ 6499698 (+)
trip13 LOC106590995 coding upstream 263414 6378373 ~ 6389788 (+)
LOC110505984 LOC106574154 coding downstream 1084 6685900 ~ 6688012 (+)
kif13a kif13a coding downstream 4075 6688891 ~ 6839464 (+)
LOC110506079 NA coding downstream 156216 6841032 ~ 6842093 (+)
rbm24b LOC106596654 coding downstream 171048 6855864 ~ 6868976 (+)
grinab grina coding downstream 191171 6875987 ~ 6889713 (+)
G109019 NA non-coding upstream 27189 6624956 ~ 6626013 (+)
G109018 NA non-coding upstream 28991 6623670 ~ 6624211 (+)
G109015 NA non-coding upstream 53036 6598923 ~ 6600166 (+)
G109011 NA non-coding upstream 64574 6588164 ~ 6588628 (+)
G108930 NA non-coding downstream 24308 6709124 ~ 6753929 (+)
G108934 NA non-coding downstream 107195 6792011 ~ 6793179 (+)
G109072 NA non-coding downstream 127978 6812794 ~ 6813416 (+)
G109080 NA non-coding downstream 159060 6843876 ~ 6844930 (+)
G109070 NA non-coding downstream 174856 6859672 ~ 6863903 (+)
G109020 NA other upstream 19289 6633078 ~ 6633913 (+)
G108874 LOC106573552 other upstream 367262 6282071 ~ 6285940 (+)
G108805 LOC106594197 other upstream 453861 6151712 ~ 6199341 (+)
G108775 LOC106606109 other upstream 594867 6056996 ~ 6058335 (+)
LOC110505679 LOC106579367 other upstream 651008 5976200 ~ 6002265 (+)
malsu1 malsu1 other downstream 223731 6908511 ~ 6911256 (+)
LOC110535156 LOC106606167 other downstream 256700 6941465 ~ 6944043 (+)
G109821 NA other downstream 450431 7135247 ~ 7140979 (+)
pde11al LOC106573285 other downstream 618212 7282430 ~ 7304709 (+)

Expression


Co-expression Network