LOC110506952 (LOC106606100)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110506952
gene name LOC106606100
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 9701990 ~ 9742723 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036937386.1
CACGGTTCTGTTCCACCACGCCACATTCTTACGCATACAGTCAATACGGAACTGTTGTCTGCTGTCCACTACAACTACAGTATTCATACAGTTATTGACATATCGCGTTTTGCAATCCCAACTTCCTCTTGCTCTCTATGACAGTGTGATGTTTGGCAATAGTGGGCATGTGTTATAGCTGCCTGCAAAGTAGGCTAGACGTCAAATGAATCTAGAGCTCTGAAGATCGGCGATATCATGGAAGAAACAGGGGCCCTTATCCGCAAAAGAAGAGCCACTATATCCACTGGAAAATGTGTTCCTTTGAAACAAGTGAATGGGCGGTCAGAAGTTGATGAAAGTGTTAACGGCCGCAGTGACAGCGGCAACATTGTAACTAAGCGAAACGTGTCCGATTTGCCTTCTACCACGTCAAAAGAAAGGAAGAAACGAATAAATGTTCCTAGTGATAGACAGAGTTGCCACAGGTTGCAGGAGTCCCTGTTGAGCTCTGCCAGTGGTTATAGAAACTACAGAGGAGTCCTCAACTGGTGTGTTGTCATGCTGGTCTTAAGCAATGCCCGTCTGTTCTTGGAAAACCTTTTGAAGTATGGAATTCTAGTGGACCCAATACAAGTGGTTTCTCTATTCATAAAGGACCCCTACAACATGCCTGCAGCGTGCCTTGTTATCGtgtCCAACGTGTTTATTGTGGCAGCTTTGTACACAGAACGAAGGCTCTCAGTGGGCTGCATCAGTGAACGTGTTGGGCTGCTGGTTCATTCCATTAACCTGTCAGTCACACTGTGCTTCCCGGTGACTATCGTACTAATGGTGAAGTCCATTACTCCAGTGGGTGGAGCGTCTGCTCTGGGAGTGTACACCGTCCTCTTCCTGAAGCTCTACTCCTACAAAGATGTGAACAAGTGGTGTAGAGAGATGAGCCATGCTAAAGCCCGTAGCCTGGCCCGCTCCCTCTCATGTTCCTCTATACCACGGTCTAGGGAAAGTGGACAGGATTATCAGGTCTCCTATCCTGGAAATGTCACCCTCAGAGATTTGTATTATTTTGTTTTTGCACCAACCCTCTGCTATGAATTAAACTTCCCCCGGTCTCCACGGATTCGAATGAGCTTCCTGCTAAGGAGGCTTTTTGAGATGCTGTTCTTCACCCAgttattggtgggattaacacaGCAGTGGATGATACCCATTATTCAGAGTTCTATGAAGCCATTGGAGGATATGGACCTGCCTATGATGATGGAGCGTCTACTCAGACTAGCCGTGCCCAATCATCTTCTATGGTTGATATTCTTCTACTGGTTCTTCCACTCGTCCTTGAACTTTATTGCTGAGCTCCTGCAATTTGGAGACCGAGAGTTTTACAGAGACTGGTGGAACTCTGAGACCATCACATACTTTTGGCAAAACTGGAATATTCCAGTACACAAATGGTGCCTTCGcCACTTCTACAAGCCCCTGCTGAAGAGTGGAGTCAGTAAGTGGCTTGGCCAATCAGCAGTGTTCCTGGCTTCAGCCTTCTTTCATGAGTACCTGGTCAGTGTTCCACTGAAGATGTTGAGGCCATGGGCTTTTATGGGCATGATGGCTCAGCTTCCGCTGGCCTGGTTCGTGGCGCGTTTTCTCCGAGGTAACTATGGCAACGCAGCCGTATGGCTCTCTCTCATCATTGGCCAGCCAATCGCCGTGCTCATGTACGTCCACGACTACTATGTACTTCACTACAGAGAGGGGTCAGCGGGAGGTGGACCTGAATGACCTCCTCAGGGGAATATATACCAGACCAGCCTTTTATAGGAAAGACAAATAGAGCTAGAAATGTACTGTACGCTACTTTATGGAAGCACCTTAAAGGGGCCATCAGcatttgctacatccatttttggactcatacattaatgatatgtacccatcgATTCTTGAGGaacataacttataaatgcctcaccAGCTTAGTTCGACTGTCGTTCCCCATCACAAACCAAAATATAGGAttgttttactccaatatttgtaaacaaatcaaatgtaaacagacactatatagcctcaaaacatggttaaaactatacttGTTTTTAATCATGGATGGTCAATCGTTGCATCCATATCTCTGTCCACGAATTTGAAAGTGATTccatttctccagtcccatccctcagctttttactgaacCAGGGGTGGGGAGgcagctttgttattgtttcaactgctgattgccactttaaaGATAACACACTTGTTATAGAAACAATCAATTTAGTTAGTGAATATTAGAATATGCCTTATTGAAACATGTCTGACAAGTGCAATTTTCAAAAAGTGCCAGTTTCTCAGAAAATGTACACAACCAGTACATTTGTGTTTGTaagatttgtgtgtatttatgcCACTCAAGCCTCAATATTTTGTCATCTTGTTTTACTTGGGTACGTATAGAGGGATATGTATAGATACGAAAATGGCAGCTGTTGATTCTTGACTTTATTCCATTAATTGGGTCATTATTATGTTGCCGACAGAACTACATGGACAAGTAAATATATTTCTCTA
>TU127811
ACTGTTGTCTGCTGTCCACTACAACTACAGTATTCATACAGTTATTGACATATCGCGTTTTGCAATCCCAACTTCCTCTTGCTCTCTATGACAGTGTGATGTTTGGCAATAGTGGGCATGTGTTATAGCTGCCTGCAAAGTAGGCTAGACGTCAAATGAATCTAGAGCTCTGAAGATCGGCGATATCATGGAAGAAACAGGGGCCCTTATCCGCAAAAGAAGAGCCACTATATCCACTGGAAAATGTGTTCCTTTGAAACAAGTGAATGGGCGGTCAGAAGTTGATGAAAGTGTTAACGGCCGCAGTGACAGCGGCAACATTGTAACTAAGCGAAACGTGTCCGATTTGCCTTCTACCACGTCAAAAGAAAGGAAGAAACGAATAAATGTTCCTAGTGATAGACAGAGTTGCCACAGGTTGCAGGAGTCCCTGTTGAGCTCTGCCAGTGGTTATAGAAACTACAGAGGAGTCCTCAACTGGTGTGTTGTCATGCTGGTCTTAAGCAATGCCCGTCTGTTCTTGGAAAACCTTTTGAAGTATGGAATTCTAGTGGACCCAATACAAGTGGTTTCTCTATTCATAAAGGACCCCTACAACATGCCTGCAGCGTGCCTTGTTATCGtgtCCAACGTGTTTATTGTGGCAGCTTTGTACACAGAACGAAGGCTCTCAGTGGGCTGCATCAGTGAACGTGTTGGGCTGCTGGTTCATTCCATTAACCTGTCAGTCACACTGTGCTTCCCGGTGACTATCGTACTAATGGTGAAGTCCATTACTCCAGTGGGTGGAGCGTCTGCTCTGGGAGTGTACACCGTCCTCTTCCTGAAGCTCTACTCCTACAAAGATGTGAACAAGTGGTGTAGAGAGATGAGCCATGCTAAAGCCCGTAGCCTGGCCCGCTCC
>TU127818
GGGAAAGTGGACAGGATTATCAGGTCTCCTATCCTGGAAATGTCACCCTCAGAGATTTGTATTATTTTGTTTTTGCACCAACCCTCTGCTATGAATTAAACTTCCCCCGGTCTCCACGGATTCGAATGAGCTTCCTGCTAAGGAGGCTTTTTGAGATGCTGTTCTTCACCCAgttattggtgggattaacacaGCAGTGGATGATACCCATTATTCAGAGTTCTATGAAGCCATTGGAGGATATGGACCTGCCTATGATGATGGAGCGTCTACTCAGACTAGCCGTGAGTACACAAGAGAACACCGGGGTAATGCGGTCATGGTAACATGGTTGATAGTAACCTTAGGCCTTGAGAGATATGACATAAACATTGTATTGGGCCGTTCCGTTCTTCTATTGTTGTTTTATGTTGTCCTGGACACAGTATTAttcccctgtcttctctctcccatcAGGTGCCCAATCATCTTCTATGGTTGATATTCTTCTACTGGTTCTTCCACTCGTCCTTGAACTTTATTGCTGAGCTCCTGCAATTTGGAGACCGAGAGTTTTACAGAGACTGGTGGAACTCTGAGACCATCACATACTTTTGGCAAAACTGGAATATTCCAGTACACAAATGGTGCCTTCGcCACTTCTACAAGCCCCTGCTGAAGAGTGGAGTCAGTAAGTGGCTTGGCCAATCAGCAGTGTTCCTGGCTTCAGCCTTCTTTCATGAGGTAAGGTGCTCTGCTCCTAGCTGGGTGAAAGCAGACTGACCGCTGCGCTCATCTGTACTATTCCTTGTGAAGTGAAACAGAGTGTTAGCTTCATCAGGTGGTTTTTAACCAGGATGCTCTGCTGCCACTGCAGCTCATATCATCATAGTCTGACCCAAACATTCAATCGCCAAAACATAAACTTTTCAAAGAGAAAAGAcaagaaaaaacatgttttccatcAACGAATATAGAATTATGACCATTTAGAAGCTATTTTGAATGTTCTTGATTCTAAAGACATGAAATGTTCAGAGTACATTGAGGTTAGATACCACTTTCAATAAATGTAAAACAATTTAAATTGGCAAAACATGTAGTTACAAGGTTTTCATCAGACaatgactatatacagtatgtataccaTTTGTGAAGAAATCCTGCATTCTATCAGACTACAGTTTCATAATTGCTGAGATTGCTAGTCAGATTAGACTTTAAAGGCCACAGATATAGTTATTGCATGACAGTACAGTGAatatactacacagtggctatactacacagtgactatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtgactatactacacaatgactatactacacagtggctatactacaccgtggctatactacacagtgactatactacaccgtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatactacaccgtggctatactacacagtgactatactacaccgtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacaatgactatactacacagtgactatactacacaATCTCTATACTatacagtggctatactacaccgtggctatactacacagtggctatactacacagtgactatactacacaatgactatactacacagtgactatactacacaATCTCTATACTatacagtggctatactacaccgtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtgactatactacaccgtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtggcaacactacacagtgactatactacacagtgactatactacacagtgactatactacacaATCTCTATACTatacagtggctatactacaccGTGGCTATGCTACgcagtggctatactacacagtggctatactacacagtgactatactacacagtggctatactacacagtgactatactacacagtggctatacaCACAGTGACTATACACACAGTGACTATGCTACAAAGTGActactacacagtggctatactacacaatgactatactacacagtggctatactacacaatgactatactacacagtgactatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtgactatactacacagtgactatactacacagtgactatactacacaatgactatactacacaatgactatactacacagtgactatactacacagtgactatacaCACAGTGACTATGCTACAAAGTGACTATACTACAAagtgactatactacacagtgactatactacacagtgactatacacacagtgactatactacacagtgaccatactacacagtgactatactacacaatgactatactacacaatgactatactacacaatgactatactacacagtgactatactacacagtgactatacaCACAGTGACTATGCTACAAagtgactatactacacagtggctatactacacaatgactatactacacagtgactatactacaccgtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtggcaacactacacagtgactatactacacagtgactatactacacagtgactatactacacaATCTCTATACTatacagtggctatactacaccGTGGCTATGCTACgcagtggctatactacacagtggctatactacacagtgactatactacacagtggctatactacacagtgactatactacacagtggctatacaCACAGTGACTATACACACAGTGACTATGCTACAAAGTGActactacacagtggctatactacacaatgactatactacacagtggctatactacacaatgactatactacacagtgactatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatgctatactacacagtgactatactacacagtggctgtactacacagtggctatactacaccgtggctatactacacagtgactgtactacacagtgactatacacacagtggctatactacaccgtggctatactacacagtgactatacaCACAGTGACTATGCTACAAAGTGACtactacacagtgactatactacacagtggctatactacacaatgactatactacacagtgactatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatactacacagtggctatgctatactacacagtgacaGTACTACACAGTGGCTgtactacacagtggctatactacaccgtggctatactacacagtgactgtactacacagtggctatactacacagtgactatactacacagtggctatacacacagtgactatactacacagtgactatactacacagtggctatactacacagtgactatactacacagtggctatacacacagtgactatactacacagtgactatactacacagtgactatacacacagtgactatactacacagtgactatacacacagtgactatactacacagtgactgtactacacagtggctatactacacagtgactatactacacagtggctatacaCACAGTGACTATACacacagtgactatactacacagtgactatacacacagtgactatactacacagtgactatactacacagtggctatacacacagtgactatactacacagtgactatacaCACAGTGGCTATACACACAGTGACTATACacacagtgactatactacacagtgactatacacacagtgactatactacacagtgactatacacacagtgactatactacacagtggctatactacacaatgactatactacacagtgactatactacacagtggctatactacacagtggctatactgcacagtgactatactacacagtggctatgCTATAttacacagtggctatactacacaatgactatactacacagtggctatacacacagtgactatactacacagtgactatacacacagtgactatactacacagtgactatactacacagtgactatactacacagtggctatacacacagtgactatactacacagtgactatactaaacagtgactatactacacagtgactatactaaacagtgactatactacacaatgactatactacacagtgactatactacacagtggctatacacacagtgactatactacacagtgactatactaaacagtgactatactacacagtgactatactacacagtgactatactacacagtggctatacaCACAGTGACTATAGtacacagtgactatactacacagtggctatactacacaatgactatactacacagtggctatactacacagtgactatactacacagtgactatactacacagtggctatactacacaatgactatactacacagtggctatactacacagtggctatatTACACcgtgactatactacacagtggctatactgCACAGTGGCAAcactacacagtggctatactacactGTGGCTATATTACACCATGACTATACTACACAatgactatactacacagtggctatgctatactatacagtGGCTATGCTACACAGTGACAGTACTACACAGTGGCCatgctatactacacagtggctatgctatactacacagtggctatactgCACAGTGACTATACCGcacagtgactatactacacaATGGCTATACTGcacagtgactatactacacagtgactatactgcacagtgactatactacacagtggctatactgcacagtgactatactacacagtggctatgTTATACTATACAGTGGCTATGCTACACAGTGACAGTACTACACAGTGGCTatgctatactacacagtggctatgctatactacacagtggctatgctatactacacagtgactataccgcacagtgactata

Function

NR:

description
diacylglycerol O-acyltransferase 1-like, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036937386.1 False 2556 mRNA 0.44 17 9701990 9742723
TU127811 False 904 TUCP 0.47 7 9702040 9723871
TU127818 True 5150 lncRNA 0.39 7 9725563 9739707

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110506885 LOC106573706 coding upstream 150346 9548702 ~ 9551644 (+)
LOC110519250 mroh1 coding upstream 219490 9445190 ~ 9482500 (+)
LOC118944051 LOC106573691 coding upstream 343568 9355022 ~ 9358422 (+)
LOC110520731 LOC106605982 coding upstream 386299 9309984 ~ 9315691 (+)
LOC110535231 LOC106573472 coding upstream 458378 9239896 ~ 9243612 (+)
LOC110520736 LOC106605972 coding downstream 2143 9744866 ~ 9757901 (+)
LOC110520735 LOC106573422 coding downstream 15605 9758328 ~ 9785173 (+)
LOC118937659 NA coding downstream 30851 9773574 ~ 9776807 (+)
LOC110520749 LOC106606080 coding downstream 78407 9821130 ~ 9845619 (+)
LOC110507293 LOC106606028 coding downstream 106411 9847951 ~ 9983302 (+)
G111998 NA non-coding upstream 7313 9694367 ~ 9694677 (+)
G111990 NA non-coding upstream 16712 9684809 ~ 9685278 (+)
G111978 NA non-coding upstream 24613 9677177 ~ 9677377 (+)
G111968 yo84 non-coding upstream 47634 9654052 ~ 9654356 (+)
G111956 NA non-coding upstream 64380 9636125 ~ 9637610 (+)
G112013 NA non-coding downstream 9381 9752104 ~ 9752340 (+)
G112081 NA non-coding downstream 47392 9790115 ~ 9790613 (+)
G112082 NA non-coding downstream 49886 9792609 ~ 9792883 (+)
G111788 NA other upstream 257949 9440309 ~ 9444041 (+)
G111453 NA other upstream 370374 9330269 ~ 9331616 (+)
LOC110535224 aif1 other upstream 472965 9221418 ~ 9229025 (+)
LOC110518388 LOC106598833 other upstream 664089 8820359 ~ 9072449 (+)
G110674 NA other upstream 1598070 8073366 ~ 8103920 (+)
G112697 NA other downstream 1068795 10811518 ~ 10826063 (+)
fbxo32 fbxo32 other downstream 1498009 11227497 ~ 11243074 (+)
elovl4a LOC106606161 other downstream 1518831 11260912 ~ 11275480 (+)
G113285 NA other downstream 1672208 11414931 ~ 11415178 (+)
G112008 NA non-coding upstream 183 9725171 ~ 9725380 (+)
LOC110506952 LOC106606100 other upstream 1692 9701990 ~ 9742723 (+)

Expression


Co-expression Network