LOC110535935 (LOC106575347)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110535935
gene name LOC106575347
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 15671986 ~ 15681594 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021621339.2
GAGAGCGCACTTATtcgtcttcttttttttttggagAGCGCTTCACTCAAACCATCCCCATGCCCGCCCACCTGTCACGGTCcatgctatccgggatccttgggacgagCTTACCTCCCTTTGAAGTTGGTTAATAATGCTTAAGGTTAGGTAAGgattatggttaaggttagagtaagagtagggtttaaggttaggatttaggGTATGGACGTCCCAAGGCTCCCAGATAGCACTAGCATACCTGGCATTGCTACGCGGAAGTAAGTGGATGAATGCACTCCGGAATTCAAGGGAATATAAACGTAAAAAGTATGCGGGCTGTGTCTGCGCTAGTGTTCCTGGCCGTGggtgtgatggtggtgttgatgtacCAGGCGGTCCGCCAGGAGCTGACTCTGCAGGGTCTTAAAGCCCGCGCTCTGGAGAGCTCCTCTCAGGTCAAGCAGAAGGAGAACGACATCGTCCAGGTCAAGATGAAGATCCAGAAGCTGAATGGTGAGCTGGAGCCCATCAACACCCAGAGAGAGGAGCTGACTAAGAAGAAGGAGCAGTCTGCTAAAGCCACAGGCGAGGCGGACAAGAGTCTAAAGACCTGTCATACAGAGAAGGCCGATGCGGAGAAAAAGAAGACTGACGCGTCGGCGGCCCTTCAGAAAGTTAAAGATGATCAAGAAGCACAGAAGAAGAAAGCTCAGGAGGAGATCCAGGCGTTGAAACAGCAGATTCTGGAGCGGGACAAGGCACTGTGTGCCTTTGTGGACCAGACCAATGAGGAAGGACGGAAGCTGTGTGGAATCACAGAGGCCCCAAAATGAAGACTTGGACTAGACTATcagcctccatccctccctccctccctcatgcttGCCGTgatgcacacacacccatacacatcaTCGTTGTGCAGCTCATAACATTCCCCACCTACAACCACCTTCACTTCACTGTACCTCTCAATACTCaggaaaataaaaaacaagaaggGTTTGGAAAACCCAGTCTGAATGTCATGtcttcattacatacagtacactgtTAGTTTGTGTATGCAGGTAAGGAAGGGAgacattacattttttaattAGTGAGTTTCATCCTATGGTACAGGACATTAATGTAGGAATGACTGAAAGAGGTTAGGGCTAATTCCCTCAGAGATGGAGCAAGGTGTCTCTGAGGTGACTTCTGAATGTTGCAAAGGTTCTAGAGAAGAGTTCTAAAGAAGTGTGAAGGTGCATGCCCATCTGGTTCAATTGTCTATTAAATATTTATTATGCATAGATGTATGATTGACCTTTATAGTGCATCAATGTATGAATTACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATATTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTCATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTCATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTCATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTCATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATCGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAtttacctatatagtgcatagATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATCGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAtttacctatatagtgcatagATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATCGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGATTGACCTATATAGTGCATAGATGTATGATTGACCTTTATTGCATTTGGGTGTGGTGTGCGTTAATCAGAGTAGAACATTGCCCTGTGTGGGTGTGGGTAATGGGAAAATTTCAGATGAATAAAGTGAATATTCAGTTAACAGTAATTAACACAATGATTAGCATATGTATATGTTTTCCCTTTCTATAATACACATGATTTCCAATGTTCTATTTGTGAGACTCACTTTTGTATGGGTTAATGGTCACTAGACCTGAGCTACTGAAGGTACAAGGACCGAGAACACACATTATTATTGTATTGATGACATTATGAACACTGAGTGATTCTGTAGCAGACGGCAAAGTCACTGTCTTTGTATTGACTCCAAGCCTCTCTGGCTGATATTTTAGAGAACATTTGGTACTGTCTGATTAGAATATGAAGGTTCTGTCTCCAAAAGCCCCGTTGGACATTTTCTATGCTTCTGTTCTGGAGGTGTCTCCCTGAATGATTGTATTAAACTGGATGGATTTGATTGA
>XM_021621334.2
CCTTTGAAGTTGGTTAATAATGCTTAAGGTTAGGTAAGgattatggttaaggttagagtaagagtagggtttaaggttaggatttaggGTATGGACGTCCCAAGGCTCCCAGATAGCACTAGCATACCTGGCATTGCTACGCGGAAGTAAGTGGATGAATGCACTCCGGAATTCAAGGGAATATAAACGTAAAAAGCAGTATGCGGGCTGTGTCTGCGCTAGTGTTCCTGGCCGTGggtgtgatggtggtgttgatgtacCAGGCGGTCCGCCAGGAGCTGACTCTGCAGGGTCTTAAAGCCCGCGCTCTGGAGAGCTCCTCTCAGGTCAAGCAGAAGGAGAACGACATCGTCCAGGTCAAGATGAAGATCCAGAAGCTGAATGGTGAGCTGGAGCCCATCAACACCCAGAGAGAGGAGCTGACTAAGAAGAAGGAGCAGTCTGCTAAAGCCACAGGCGAGGCGGACAAGAGTCTAAAGACCTGTCATACAGAGAAGGCCGATGCGGAGAAAAAGAAGACTGACGCGTCGGCGGCCCTTCAGAAAGTTAAAGATGATCAAGAAGCACAGAAGAAGAAAGCTCAGGAGGAGATCCAGGCGTTGAAACAGCAGATTCTGGAGCGGGACAAGGCACTGTGTGCCTTTGTGGACCAGACCAATGAGGAAGGACGGAAGCTGTGTGGAATCACAGAGGCCCCAAAATGAAGACTTGGACTAGACTATcagcctccatccctccctccctccctcatgcttGCCGTgatgcacacacacccatacacatcaTCGTTGTGCAGCTCATAACATTCCCCACCTACAACCACCTTCACTTCACTGTACCTCTCAATACTCaggaaaataaaaaacaagaaggGTTTGGAAAACCCAGTCTGAATGTCATGtcttcattacatacagtacactgtTAGTTTGTGTATGCAGGTAAGGAAGGGAgacattacattttttaattAGTGAGTTTCATCCTATGGTACAGGACATTAATGTAGGAATGACTGAAAGAGGTTAGGGCTAATTCCCTCAGAGATGGAGCAAGGTGTCTCTGAGGTGACTTCTGAATGTTGCAAAGGTTCTAGAGAAGAGTTCTAAAGAAGTGTGAAGGTGCATGCCCATCTGGTTCAATTGTCTATTAAATATTTATTATGCATAGATGTATGATTGACCTTTATAGTGCATCAATGTATGAATTACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATATTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTCATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTCATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTCATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTCATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATCGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAtttacctatatagtgcatagATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATCGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAtttacctatatagtgcatagATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATCGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGATTGACCTATATAGTGCATAGATGTATGATTGACCTTTATTGCATTTGGGTGTGGTGTGCGTTAATCAGAGTAGAACATTGCCCTGTGTGGGTGTGGGTAATGGGAAAATTTCAGATGAATAAAGTGAATATTCAGTTAACAGTAATTAACACAATGATTAGCATATGTATATGTTTTCCCTTTCTATAATACACATGATTTCCAATGTTCTATTTGTGAGACTCACTTTTGTATGGGTTAATGGTCACTAGACCTGAGCTACTGAAGGTACAAGGACCGAGAACACACATTATTATTGTATTGATGACATTATGAACACTGAGTGATTCTGTAGCAGACGGCAAAGTCACTGTCTTTGTATTGACTCCAAGCCTCTCTGGCTGATATTTTAGAGAACATTTGGTACTGTCTGATTAGAATATGAAGGTTCTGTCTCCAAAAGCCCCGTTGGACATTTTCTATGCTTCTGTTCTGGAGGTGTCTCCCTGAATGATTGTATTAAACTGGATGGATTTGATTGA
>XR_005035193.1
CCTTTGAAGTTGGTTAATAATGCTTAAGGTTAGGTAAGgattatggttaaggttagagtaagagtagggtttaaggttaggatttaggGTATGGACGTCCCAAGGCTCCCAGATAGCACTAGCATACCTGGCATTGCTACGCGGAAGTAAGTGGATGAATGCACTCCGGAATTCAAGGGAATATAAACGTAAAAAGCAGTATGCGGGCTGTGTCTGCGCTAGTGTTCCTGGCCGTGggtgtgatggtggtgttgatgtacCAGGCGGTCCGCCAGGAGCTGACTCTGCAGGGTCTTAAAGCCCGCGCTCTGGAGAGCTCCTCTCAGGTCAAGCAGAAGGAGAACGACATCGTCCAGGTCAAGATGAAGATCCAGAAGCTGAATGGTGAGCTGGAGCCCATCAACACCCAGAGAGAGGAGCTGACTAAGAAGAAGGAGCAGTCTGCTAAAGCCACAGGCGAGGCGGACAAGAGTCTAAAGACCTGTCATACAGAGAAGGCCGATGCGGAGAAAAAGAAGACTGACGCGTCGGCGGCCCTTCAGAAAGTTAAAGATGATCAAGAAGCACAGAAGAAGAAAGCTCAGGAGGAGATCCAGGCGTTGAAACAGCAGATTCTGGAGCGGGACAAGGCACTGTGTGCCTTTGTGGACCAGACCAATGAGGAAGGACGGAAGCTGTGTGGAATCACAGAGGCCCCAAAATGAAGACTTGGACTAGACTATcagcctccatccctccctccctccctcatgcttGCCGTgatgcacacacacccatacacatcaTCGTTGTGCAGCTCATAACATTCCCCACCTACAACCACCTTCACTTCACTGTACCTCTCAATACTCaggaaaataaaaaacaagaaggGTTTGGAAAACCCAGTCTGAATGTCATGtcttcattacatacagtacactgtTAGTTTGTGTATGCAGGACATTAATGTAGGAATGACTGAAAGAGGTTAGGGCTAATTCCCTCAGAGATGGAGCAAGGTGTCTCTGAGGTGACTTCTGAATGTTGCAAAGGTTCTAGAGAAGAGTTCTAAAGAAGTGTGAAGGTGCATGCCCATCTGGTTCAATTGTCTATTAAATATTTATTATGCATAGATGTATGATTGACCTTTATAGTGCATCAATGTATGAATTACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATATTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTCATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTCATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTCATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTCATAGTGCATAGATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATCGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAtttacctatatagtgcatagATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATCGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAtttacctatatagtgcatagATCTATGATTGACCTTTATAGTGCATCGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGAATGACCTTTATAGTGCATAGATGTATGATTGACCTATATAGTGCATAGATGTATGATTGACCTTTATTGCATTTGGGTGTGGTGTGCGTTAATCAGAGTAGAACATTGCCCTGTGTGGGTGTGGGTAATGGGAAAATTTCAGATGAATAAAGTGAATATTCAGTTAACAGTAATTAACACAATGATTAGCATATGTATATGTTTTCCCTTTCTATAATACACATGATTTCCAATGTTCTATTTGTGAGACTCACTTTTGTATGGGTTAATGGTCACTAGACCTGAGCTACTGAAGGTACAAGGACCGAGAACACACATTATTATTGTATTGATGACATTATGAACACTGAGTGATTCTGTAGCAGACGGCAAAGTCACTGTCTTTGTATTGACTCCAAGCCTCTCTGGCTGATATTTTAGAGAACATTTGGTACTGTCTGATTAGAATATGAAGGTTCTGTCTCCAAAAGCCCCGTTGGACATTTTCTATGCTTCTGTTCTGGAGGTGTCTCCCTGAATGATTGTATTAAACTGGATGGATTTGATTGA

Function

NR:

description
restin homolog isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021621339.2 False 2793 mRNA 0.40 5 15671986 15681594
XM_021621334.2 False 2679 mRNA 0.40 5 15672103 15681594
XR_005035193.1 True 2624 mRNA 0.40 6 15672103 15681594

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
osgin2 osgin2 coding upstream 38183 15623977 ~ 15633803 (+)
LOC110535866 gtpbp10 coding upstream 57719 15482391 ~ 15614954 (+)
LOC110535823 LOC106576036 coding upstream 194031 15467158 ~ 15477955 (+)
LOC110535842 LOC106605985 coding upstream 220130 15448845 ~ 15451856 (+)
rundc3b LOC106576055 coding upstream 223452 15437892 ~ 15448698 (+)
LOC110534191 LOC105029233 coding downstream 9538 15691132 ~ 15694443 (+)
LOC110535950 LOC106575322 coding downstream 19592 15701186 ~ 15734894 (+)
ecm1b ecm1 coding downstream 60736 15742330 ~ 15755295 (+)
LOC110535970 LOC106575371 coding downstream 78355 15759949 ~ 15783001 (+)
LOC110535991 LOC100194679 coding downstream 102015 15783609 ~ 15787419 (+)
G116340 LOC106575260 non-coding upstream 22871 15644897 ~ 15649115 (+)
G116325 NA non-coding upstream 68048 15593195 ~ 15603938 (+)
G116323 NA non-coding upstream 96249 15567226 ~ 15575737 (+)
G116289 NA non-coding upstream 168141 15503282 ~ 15503845 (+)
G116368 NA non-coding downstream 17819 15699413 ~ 15699661 (+)
G116416 NA non-coding downstream 134844 15816438 ~ 15816979 (+)
G116429 NA non-coding downstream 157032 15838626 ~ 15840462 (+)
G116442 NA non-coding downstream 184328 15865922 ~ 15866182 (+)
LOC110535783 LOC106606004 other upstream 305197 15355848 ~ 15368210 (+)
G116224 NA other upstream 334284 15337430 ~ 15337702 (+)
LOC110535811 acbd7 other upstream 335628 15329572 ~ 15336358 (+)
G116207 NA other upstream 400377 15271202 ~ 15271609 (+)
G117048 NA other downstream 502092 16182890 ~ 16185784 (+)
LOC110536275 s10i other downstream 1314116 16995630 ~ 16998361 (+)
G117704 NA other downstream 1368538 17050132 ~ 17050839 (+)
G117714 LOC106605886 other downstream 1391607 17073201 ~ 17073701 (+)
LOC110520798 fam189b other downstream 1718419 17395343 ~ 17421816 (+)

Expression


Co-expression Network