LOC110537588


Basic Information

Item Value
gene id LOC110537588
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 21395164 ~ 21411507 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

NR:

description
carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021623739.2 False 3461 mRNA 0.42 9 21395164 21411507
XM_021623740.2 False 3458 mRNA 0.42 9 21395164 21411507
XM_036941709.1 True 3383 mRNA 0.41 9 21395164 21411507

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110534415 grik5 coding upstream 83915 21148322 ~ 21311249 (+)
LOC110509776 LOC106576357 coding upstream 258433 21105500 ~ 21136731 (+)
LOC110509817 LOC106576382 coding upstream 291465 21075240 ~ 21103699 (+)
LOC110509768 LOC106576258 coding upstream 336308 20990131 ~ 21058856 (+)
erfl3 LOC106576393 coding upstream 417683 20900204 ~ 20977481 (+)
LOC110537581 LOC106605559 coding downstream 66135 21477642 ~ 21491358 (+)
LOC110534436 LOC106605563 coding downstream 100833 21512340 ~ 21530893 (+)
LOC118944067 LOC106597946 coding downstream 119741 21531248 ~ 21533013 (+)
LOC118938333 LOC106605563 coding downstream 121480 21532987 ~ 21547038 (+)
LOC110537595 LOC106605558 coding downstream 144398 21555905 ~ 21570363 (+)
G120646 NA non-coding upstream 14877 21380076 ~ 21380287 (+)
G120641 NA non-coding upstream 18597 21376234 ~ 21376567 (+)
G120632 NA non-coding upstream 32143 21362619 ~ 21363021 (+)
G120627 NA non-coding upstream 35671 21352155 ~ 21359493 (+)
G120624 NA non-coding upstream 45654 21349310 ~ 21349510 (+)
G121618 NA non-coding downstream 52922 21464429 ~ 21464811 (+)
G121616 NA non-coding downstream 64307 21475814 ~ 21548364 (+)
G121624 NA non-coding downstream 75464 21486971 ~ 21545894 (+)
G121676 NA non-coding downstream 175084 21586591 ~ 21594643 (+)
G121726 NA non-coding downstream 254776 21666283 ~ 21667174 (+)
G120169 NA other upstream 976036 20407862 ~ 20419128 (+)
G120259 NA other upstream 1074908 20319739 ~ 20320256 (+)
LOC110537348 LOC106575899 other upstream 1210539 20179254 ~ 20185414 (+)
G121677 NA other downstream 173914 21585421 ~ 21586101 (+)
LOC110537735 LOC106595974 other downstream 409707 21821165 ~ 21825285 (+)
G122030 NA other downstream 605155 22015130 ~ 22018815 (+)
LOC110537939 apoc1 other downstream 931020 22342491 ~ 22346615 (+)

Expression


Co-expression Network