LOC110486462


Basic Information

Item Value
gene id LOC110486462
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 30097171 ~ 30103693 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

NR:

description
interleukin enhancer-binding factor 2 homolog

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036944998.1 True 3082 mRNA 0.44 6 30097710 30103693

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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gnrh-r LOC106605452 coding upstream 166817 29925736 ~ 29930354 (+)
LOC110486403 LOC106580236 coding upstream 182430 29900857 ~ 29914741 (+)
LOC110486369 LOC106605449 coding upstream 263366 29815780 ~ 29833805 (+)
LOC110486333 LOC106605448 coding upstream 328544 29765682 ~ 29768627 (+)
LOC110486473 LOC106605459 coding downstream 11842 30115535 ~ 30168611 (+)
gon4l LOC106605460 coding downstream 76292 30179985 ~ 30205554 (+)
LOC110534650 LOC106580339 coding downstream 102007 30205700 ~ 30209797 (+)
LOC110486492 LOC100194668 coding downstream 106790 30210483 ~ 30214827 (+)
LOC118944173 NA coding downstream 110585 30214278 ~ 30214413 (+)
G130773 NA non-coding upstream 103031 29993917 ~ 29994140 (+)
G130451 NA non-coding upstream 164352 29855976 ~ 29932819 (+)
G130879 NA non-coding downstream 51603 30155296 ~ 30156840 (+)
G130906 NA non-coding downstream 125722 30229415 ~ 30229738 (+)
G130907 NA non-coding downstream 126745 30230438 ~ 30230681 (+)
G130921 NA non-coding downstream 150790 30254483 ~ 30254722 (+)
G130414 NA other upstream 307340 29789576 ~ 29789831 (+)
LOC110486279 LOC106605442 other upstream 403320 29685855 ~ 29697686 (+)
G130308 NA other upstream 456075 29600026 ~ 29641096 (+)
G129155 NA other upstream 612041 29484633 ~ 29485130 (+)
LOC110534631 LOC106580029 other upstream 619041 29424822 ~ 29478401 (+)
G131491 NA other downstream 596489 30700182 ~ 30700623 (+)
G131517 ccne2 other downstream 644362 30748055 ~ 30749954 (+)
LOC110534710 LOC106605356 other downstream 1187777 31262054 ~ 31294577 (+)
eaf1 LOC106581241 other downstream 1256743 31360408 ~ 31366322 (+)
G132342 LOC100136303 other downstream 1753955 31834170 ~ 31887572 (+)

Expression


Co-expression Network