plekhf2 (plekhf2)


Basic Information

Item Value
gene id plekhf2
gene name plekhf2
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 30821776 ~ 30844299 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

symbol description
plekhf2 Predicted to enable phosphatidylinositol binding activity. Predicted to act upstream of or within protein transport. Predicted to be located in early endosome membrane and endoplasmic reticulum. Orthologous to human PLEKHF2 (pleckstrin homology and FYVE domain containing 2).

NR:

description
pleckstrin homology domain-containing family F member 2-like isoform X1

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KEGG:

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LOC110534679 LOC106605381 coding downstream 6998 30851297 ~ 30856046 (+)
LOC110534689 LOC106605368 coding downstream 29434 30873733 ~ 30891386 (+)
LOC110486784 NA coding downstream 292509 31136808 ~ 31146454 (+)
sri sorcn coding downstream 355036 31199335 ~ 31202392 (+)
LOC110486889 NA coding downstream 364686 31208985 ~ 31222079 (+)
G131527 NA non-coding upstream 6443 30814506 ~ 30815333 (+)
G131502 NA non-coding upstream 59862 30747628 ~ 30761914 (+)
G131494 NA non-coding upstream 112055 30709496 ~ 30709721 (+)
G131493 NA non-coding upstream 112292 30708874 ~ 30709484 (+)
G131448 NA non-coding upstream 210856 30610691 ~ 30610920 (+)
G131540 NA non-coding downstream 16257 30860556 ~ 30861094 (+)
G131556 NA non-coding downstream 58505 30902804 ~ 30908231 (+)
G131719 NA non-coding downstream 211761 31056060 ~ 31056286 (+)
G131720 NA non-coding downstream 254901 31099200 ~ 31099445 (+)
G131721 NA non-coding downstream 256449 31100748 ~ 31100965 (+)
G131517 ccne2 other upstream 71822 30748055 ~ 30749954 (+)
G131491 NA other upstream 121153 30700182 ~ 30700623 (+)
G130414 NA other upstream 1031945 29789576 ~ 29789831 (+)
LOC110486279 LOC106605442 other upstream 1127925 29685855 ~ 29697686 (+)
G130308 NA other upstream 1180680 29600026 ~ 29641096 (+)
LOC110534710 LOC106605356 other downstream 447171 31262054 ~ 31294577 (+)
eaf1 LOC106581241 other downstream 516137 31360408 ~ 31366322 (+)
G132342 LOC100136303 other downstream 1013349 31834170 ~ 31887572 (+)
G133473 LOC106605294 other downstream 2323139 33167438 ~ 33169378 (+)
G133663 LOC106605282 other downstream 2652155 33496454 ~ 33497285 (+)

Expression


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