LOC110487536


Basic Information

Item Value
gene id LOC110487536
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 33028873 ~ 33045721 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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AGTGTCTTTGGTGCAATGACGTAATTCCCAGGGATACACAGATATTTAATGAAAAAGTAAGCATAGCCTGGAAtgattgttttaaaaaatatattctttATGTTTCTTTATTTGGCTTTTCAATATTTTACCACCCTCAATCCCATTGCTCCATTGGCTGATTATATTCTCCCATCTGTGAATGAAACAGCATGGTACCTGAGTAAAGCCTCCAACATTTCAGTCCCTATTATCTAGCTGATGACCTTTGATAAATGCTACGACATTAATTGCAGAACAAGGTGACGTTGGTAAAAGGTTTTTGCCAAGGAAAGGACCTCTTCTTCAATGACAAAGGACTCCTACTCCCAGAATCCTACAAGATTGGCTGGATGGAGGCTATTGATGACGACAAATTAATCTCTGACATCACCATACCTGGTACCCATGACACCATGGCTCTCTATGGAGGCCCAGCGGCAGAGTGTCAGGCCTGGGATTTGGGGGATCAGCTGAGGGCTGGCATACGCTATCTGGACCTCAGGATATTCGCCTTTGAAAACAAACTCTATGTCATGCACTGGGTTGTCTACCAACACAAGTCCTTCTATGAGGTCCTTGATACGATCAGAGCATTTTTGTCTGAATTCAGAAGTGAGACGGTTCTCGTTAGAGTGAAGcctgatttgtttgataaagagaatgttgaggagctggttgGAAAAATGATTATTGATGATACAGATGTATGGGTGAAGTCTGACATGCCAACTATGGCTGAGGCAAGAGGAAAGATGATATTTGTACAGAAATCCAGCTTTAAGCTGGGCATTCCTCTCTTGGAAACAGACAGCAAAGGTGACTATGAAGTTACTCATATTGCAGACAAGGAGAACAAAATAGTGAAACACTTGACACAAGCTTCAGGTGATTGTGGTGGGGATTATATCGTTCTGAGCTACTCCAGTGGCACTGGCATTGGCACACTGTTGGGCATGTTTCTAACTCCCAAGAAGGTGGCTGAAAAGATTAACCCATGGCTCGATCAGTATCTGAGACAGTTCTCCAGGGACCACAGCAGTGTATGTTTCGGAGTGATTGCCATGGACTTTCCTGGTATCGACCTCATTCAAACAGTCATCAAGATCAATGATTGGTGAAGTGTTCACCCATGGAAGTCATGATTATATTGCTTTCTGAAATGTTAGTTGACGCCATTAGATTAAGTGCAGCAACAACACATGACACATACTATACTTGATTGTGCTCATATTGAAAAGGAGCGAGATAGAAGACTGACAAAGTAAAGAATTTAATGATTGGAACGTAGTATTGGCATGCGCTCTTAAACAATAATAATGAAGACTTGGCACTACACGTTTTTGTACTTTGCCCCTGCTTGCTGTATTAAAAACAAAGAAAATCATTAAAATTGTAAAGAACAA

Function

NR:

description
uncharacterized protein LOC110487536

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036946173.1 True 1424 mRNA 0.41 2 33044160 33045721

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110487447 LOC106605310 coding upstream 89063 32896415 ~ 32939810 (+)
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LOC110487428 NA coding upstream 153023 32873188 ~ 32875850 (+)
LOC110487398 LOC106605316 coding upstream 176730 32775600 ~ 32852143 (+)
tmem176l.1 m4a8a coding downstream 111 33045832 ~ 33049288 (+)
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LOC110487649 LOC106581815 coding downstream 270569 33316290 ~ 33321834 (+)
LOC110487688 LOC106605287 coding downstream 361088 33406809 ~ 33408519 (+)
ntrk1 LOC106605284 coding downstream 388977 33434698 ~ 33460997 (+)
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G132342 LOC100136303 other upstream 1141301 31834170 ~ 31887572 (+)
eaf1 LOC106581241 other upstream 1662551 31360408 ~ 31366322 (+)
LOC110534710 LOC106605356 other upstream 1735839 31262054 ~ 31294577 (+)
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G131491 NA other upstream 2328250 30700182 ~ 30700623 (+)
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G133663 LOC106605282 other downstream 450733 33496454 ~ 33497285 (+)
G133760 LOC106605274 other downstream 768312 33814033 ~ 33814483 (+)
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si:dkey-30e9.6 LOC106605205 other downstream 1642234 34687955 ~ 34692286 (+)

Expression


Co-expression Network