LOC110490388 (LOC106604983)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110490388
gene name LOC106604983
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 44464974 ~ 44472924 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021563788.2
TACCAGAAATAGTTATTAAAATAGGAAGATAAGAAAAAAAATCGGAATTTCTTGCCATAGACAGGTTTGTGTTGTGTGGACTTAAATTAACTAGTTTAAAACATGGGGAGATAGTGTTTGTTTTGTCAGTTTCACGGTCCTTACGACGACAGTGCAGACCCAGAGAGAGGCCCCACCGTCTGGCAGATTATGACCCAGTGCCACCCACTGTCCAACCACTCCAACTTCTTCACCGTGAAAGCCGAGGCCTCCTCAACACTACCTCTCGCCACCAGCATGGCCAATTGCAACACCGCCGCCGTTCCAGGGAAGGTGATGGGCACACCTGGCCCTGCCGGCAGAATCAGCCCAGAAGGAAGTCAGGTGTTGAGTAAAAAGAAGCTGCAGGACCTCGTAAGAGAGATTGACCCCAATGAGCAGCTCGATGAGGATGTGGAGGAGATGCTGCTACAGATTGCAGATGACTTCATTGACAGTGTGGTGACGGCTGCCTGTCAGCTGGCCCGCCATCGCAAATCCAACACCTTAGAAGTGAAGGACGTCCAGCTACACCTGGAGCGCCAATGGAACATGTGGATTCCTGGCTATGGTTCAGATGAGATTCGGCCGTATAAGAAGGCTTGTACCACAGAGGCCCACAAACAGGTTTTGTGTGTGATTTGTCAGCTCCATCATCACACAAGTATTTTGATCTTCAGTCCGTTTTAATGCTTTTCACCACAGACTGGCCAAAATCACACATTCCTCATTCAGTGTAAATGTACACTCTGGTATGGAGTGTTGTTTTGGGACAGTGTTTTGTTTTTGGAATTATCTGTTCAACTTTACTTTTTTGTTAAGGGGGTAACCACCAAACACGCACATCTTCAATATGGTGGTGTCTTCCATACTCTTTCCCAAatttttttaaaaaaactttttttttattttattttattttgtctggCATGTGTTTGCTGTTGTGTGTTTAGTTTTTGTCACACAAACAAACCCCCTTCATCTAACATCAGAAATATACACCATTTGCATTTAGTTGGTTTCCAGGATACTGTCATGGCACAATGTTTTTGTGTGGTGTAGGGATCTGATGTCATCTCCACAGTTCATTAGAAATGTACCCAGGACATTGTTTTTCATAAGATGTCAACAATTAACAACAAATGACTGACTATTATTCAAAAAATAATAAGTATGTGAAGTATGTCTTGTGTCGCCAGACTGCAGTGAGATGTGGTTAGGTAATGGTCCTTATTTGGGGATGTGTGGGGAAGCTGTAACATTTGTTTTACTTTATATTGGCAGTGTTTTAGTTAAACCTGTTATTTTTATTCCATAAATAAGATTCATATTTCACTTG
>XM_021563780.2
ccttctcaaaaacacattggatgagaaagccagaggtcccgcgCTTCGGACCCTCTCCTCCAATAGGTTTTTGAGAAGGAGGCAAAGATAGATGACGTCTGCAATTGAGATCCTCCCCATGTCGTGTTAGCAGGTATCTAGCTGGCTATTAAGTTTCACGGTCCTTACGACGACAGTGCAGACCCAGAGAGAGGCCCCACCGTCTGGCAGATTATGACCCAGTGCCACCCACTGTCCAACCACTCCAACTTCTTCACCGTGAAAGCCGAGGCCTCCTCAACACTACCTCTCGCCACCAGCATGGCCAATTGCAACACCGCCGCCGTTCCAGGGAAGGTGATGGGCACACCTGGCCCTGCCGGCAGAATCAGCCCAGAAGGAAGTCAGGTGTTGAGTAAAAAGAAGCTGCAGGACCTCGTAAGAGAGATTGACCCCAATGAGCAGCTCGATGAGGATGTGGAGGAGATGCTGCTACAGATTGCAGATGACTTCATTGACAGTGTGGTGACGGCTGCCTGTCAGCTGGCCCGCCATCGCAAATCCAACACCTTAGAAGTGAAGGACGTCCAGCTACACCTGGAGCGCCAATGGAACATGTGGATTCCTGGCTATGGTTCAGATGAGATTCGGCCGTATAAGAAGGCTTGTACCACAGAGGCCCACAAACAGGTTTTGTGTGTGATTTGTCAGCTCCATCATCACACAAGTATTTTGATCTTCAGTCCGTTTTAATGCTTTTCACCACAGACTGGCCAAAATCACACATTCCTCATTCAGTGTAAATGTACACTCTGGTATGGAGTGTTGTTTTGGGACAGTGTTTTGTTTTTGGAATTATCTGTTCAACTTTACTTTTTTGTTAAGGGGGTAACCACCAAACACGCACATCTTCAATATGGTGGTGTCTTCCATACTCTTTCCCAAatttttttaaaaaaactttttttttattttattttattttgtctggCATGTGTTTGCTGTTGTGTGTTTAGTTTTTGTCACACAAACAAACCCCCTTCATCTAACATCAGAAATATACACCATTTGCATTTAGTTGGTTTCCAGGATACTGTCATGGCACAATGTTTTTGTGTGGTGTAGGGATCTGATGTCATCTCCACAGTTCATTAGAAATGTACCCAGGACATTGTTTTTCATAAGATGTCAACAATTAACAACAAATGACTGACTATTATTCAAAAAATAATAAGTATGTGAAGTATGTCTTGTGTCGCCAGACTGCAGTGAGATGTGGTTAGGTAATGGTCCTTATTTGGGGATGTGTGGGGAAGCTGTAACATTTGTTTTACTTTATATTGGCAGTGTTTTAGTTAAACCTGTTATTTTTATTCCATAAATAAGATTCATATTTCACTTG
>XM_021563811.2
ccttctcaaaaacacattggatgagaaagccagaggtcccgcgCTTCGGACCCTCTCCTCCAATAGGTTTTTGAGAAGGAGGCAAAGATAGATGACGTCTGCAATTGAGATCCTCCCCATGTCGTGTTAGCAGGTATCTAGCTGGCTATTAAGTTTCACGGTCCTTACGACGACAGTGCAGACCCAGAGAGAGGCCCCACCGTCTGGCAGATTATGACCCAGTGCCACCCACTGTCCAACCACTCCAACTTCTTCACCGTGAAAGCCGAGGCCTCCTCAACACTACCTCTCGCCACCAGCATGGCCAATTGCAACACCGCCGCCGTTCCAGGGAAGGTGATGGGCACACCTGGCCCTGCCGGCAGAATCAGCCCAGAAGGAAGTCAGGTGTTGAGTAAAAAGAAGCTGCAGGACCTCGTAAGAGAGATTGACCCCAATGAGCAGCTCGATGAGGATGTGGAGGAGATGCTGCTACAGATTGCAGATGACTTCATTGACAGTGTGGTGACGGCTGCCTGTCAGCTGGCCCGCCATCGCAAATCCAACACCTTAGAAGTGAAGGACGTCCAGCTACACCTGGAGCGCCAATGGAACATGTGGATTCCTGGCTATGGTTCAGATGAGATTCGGCCGTATAAGAAGGCTTGTACCACAGAGGCCCACAAACAGAGAATGGCATTGATCCGCAAAACAACCAAAAAGTAGCAAGACCTGGAACCAGCCTCGCACAAACACTCTGTGCTTTTTGTCTTTTCTCTGTGTATTTCTAATAATGGGGGACATTGTTTCACCCATGTCTTCATCTTCCCCAGGTTTTGTGTGTGATTTGTCAGCTCCATCATCACACAAGTATTTTGATCTTCAGTCCGTTTTAATGCTTTTCACCACAGACTGGCCAAAATCACACATTCCTCATTCAGTGTAAATGTACACTCTGGTATGGAGTGTTGTTTTGGGACAGTGTTTTGTTTTTGGAATTATCTGTTCAACTTTACTTTTTTGTTAAGGGGGTAACCACCAAACACGCACATCTTCAATATGGTGGTGTCTTCCATACTCTTTCCCAAatttttttaaaaaaactttttttttattttattttattttgtctggCATGTGTTTGCTGTTGTGTGTTTAGTTTTTGTCACACAAACAAACCCCCTTCATCTAACATCAGAAATATACACCATTTGCATTTAGTTGGTTTCCAGGATACTGTCATGGCACAATGTTTTTGTGTGGTGTAGGGATCTGATGTCATCTCCACAGTTCATTAGAAATGTACCCAGGACATTGTTTTTCATAAGATGTCAACAATTAACAACAAATGACTGACTATTATTCAAAAAATAATAAGTATGTGAAGTATGTCTTGTGTCGCCAGACTGCAGTGAGATGTGGTTAGGTAATGGTCCTTATTTGGGGATGTGTGGGGAAGCTGTAACATTTGTTTTACTTTATATTGGCAGTGTTTTAGTTAAACCTGTTATTTTTATTCCATAAATAAGATTCATATTTCACTTG
>XM_021563795.2
ttctcaaaaacacattggatgagaaagccagaggtcccgcgCTTCGGACCCTCTCCTCCAATAGGTTTTTGAGAAGGAGGCAAAGATAGATGACGTCTGCAATTGAGATCCTCCCCATGTCGTGTTAGCAGTTTCACGGTCCTTACGACGACAGTGCAGACCCAGAGAGAGGCCCCACCGTCTGGCAGATTATGACCCAGTGCCACCCACTGTCCAACCACTCCAACTTCTTCACCGTGAAAGCCGAGGCCTCCTCAACACTACCTCTCGCCACCAGCATGGCCAATTGCAACACCGCCGCCGTTCCAGGGAAGGTGATGGGCACACCTGGCCCTGCCGGCAGAATCAGCCCAGAAGGAAGTCAGGTGTTGAGTAAAAAGAAGCTGCAGGACCTCGTAAGAGAGATTGACCCCAATGAGCAGCTCGATGAGGATGTGGAGGAGATGCTGCTACAGATTGCAGATGACTTCATTGACAGTGTGGTGACGGCTGCCTGTCAGCTGGCCCGCCATCGCAAATCCAACACCTTAGAAGTGAAGGACGTCCAGCTACACCTGGAGCGCCAATGGAACATGTGGATTCCTGGCTATGGTTCAGATGAGATTCGGCCGTATAAGAAGGCTTGTACCACAGAGGCCCACAAACAGGTTTTGTGTGTGATTTGTCAGCTCCATCATCACACAAGTATTTTGATCTTCAGTCCGTTTTAATGCTTTTCACCACAGACTGGCCAAAATCACACATTCCTCATTCAGTGTAAATGTACACTCTGGTATGGAGTGTTGTTTTGGGACAGTGTTTTGTTTTTGGAATTATCTGTTCAACTTTACTTTTTTGTTAAGGGGGTAACCACCAAACACGCACATCTTCAATATGGTGGTGTCTTCCATACTCTTTCCCAAatttttttaaaaaaactttttttttattttattttattttgtctggCATGTGTTTGCTGTTGTGTGTTTAGTTTTTGTCACACAAACAAACCCCCTTCATCTAACATCAGAAATATACACCATTTGCATTTAGTTGGTTTCCAGGATACTGTCATGGCACAATGTTTTTGTGTGGTGTAGGGATCTGATGTCATCTCCACAGTTCATTAGAAATGTACCCAGGACATTGTTTTTCATAAGATGTCAACAATTAACAACAAATGACTGACTATTATTCAAAAAATAATAAGTATGTGAAGTATGTCTTGTGTCGCCAGACTGCAGTGAGATGTGGTTAGGTAATGGTCCTTATTTGGGGATGTGTGGGGAAGCTGTAACATTTGTTTTACTTTATATTGGCAGTGTTTTAGTTAAACCTGTTATTTTTATTCCATAAATAAGATTCATATTTCACTTG
>XM_021563818.2
aaacacattggatgagaaagccagaggtcccgcgCTTCGGACCCTCTCCTCCAATAGGTTTTTGAGAAGGAGGCAAAGATAGATGACGTCTGCAATTGAGATCCTCCCCATGTCGTGTTAGCAGTTTCACGGTCCTTACGACGACAGTGCAGACCCAGAGAGAGGCCCCACCGTCTGGCAGATTATGACCCAGTGCCACCCACTGTCCAACCACTCCAACTTCTTCACCGTGAAAGCCGAGGCCTCCTCAACACTACCTCTCGCCACCAGCATGGCCAATTGCAACACCGCCGCCGTTCCAGGGAAGGTGATGGGCACACCTGGCCCTGCCGGCAGAATCAGCCCAGAAGGAAGTCAGGTGTTGAGTAAAAAGAAGCTGCAGGACCTCGTAAGAGAGATTGACCCCAATGAGCAGCTCGATGAGGATGTGGAGGAGATGCTGCTACAGATTGCAGATGACTTCATTGACAGTGTGGTGACGGCTGCCTGTCAGCTGGCCCGCCATCGCAAATCCAACACCTTAGAAGTGAAGGACGTCCAGCTACACCTGGAGCGCCAATGGAACATGTGGATTCCTGGCTATGGTTCAGATGAGATTCGGCCGTATAAGAAGGCTTGTACCACAGAGGCCCACAAACAGAGAATGGCATTGATCCGCAAAACAACCAAAAAGTAGCAAGACCTGGAACCAGCCTCGCACAAACACTCTGTGCTTTTTGTCTTTTCTCTGTGTATTTCTAATAATGGGGGACATTGTTTCACCCATGTCTTCATCTTCCCCAGGTTTTGTGTGTGATTTGTCAGCTCCATCATCACACAAGTATTTTGATCTTCAGTCCGTTTTAATGCTTTTCACCACAGACTGGCCAAAATCACACATTCCTCATTCAGTGTAAATGTACACTCTGGTATGGAGTGTTGTTTTGGGACAGTGTTTTGTTTTTGGAATTATCTGTTCAACTTTACTTTTTTGTTAAGGGGGTAACCACCAAACACGCACATCTTCAATATGGTGGTGTCTTCCATACTCTTTCCCAAatttttttaaaaaaactttttttttattttattttattttgtctggCATGTGTTTGCTGTTGTGTGTTTAGTTTTTGTCACACAAACAAACCCCCTTCATCTAACATCAGAAATATACACCATTTGCATTTAGTTGGTTTCCAGGATACTGTCATGGCACAATGTTTTTGTGTGGTGTAGGGATCTGATGTCATCTCCACAGTTCATTAGAAATGTACCCAGGACATTGTTTTTCATAAGATGTCAACAATTAACAACAAATGACTGACTATTATTCAAAAAATAATAAGTATGTGAAGTATGTCTTGTGTCGCCAGACTGCAGTGAGATGTGGTTAGGTAATGGTCCTTATTTGGGGATGTGTGGGGAAGCTGTAACATTTGTTTTACTTTATATTGGCAGTGTTTTAGTTAAACCTGTTATTTTTATTCCATAAATAAGATTCATATTTCACTTG
>XM_021563762.2
GACCCTCTCCTCCAATAGGTTTTTGAGAAGGAGGCAAAGATAGATGACGTCTGCAATTGAGATCCTCCCCATGTCGTGTTAGCAGGTATCTAGCTGGCTATTAAGGTATTTATTTACTATATGTAAATATGCTTGCTTGGACCATTCCATGTTTCACGGTCCTTACGACGACAGTGCAGACCCAGAGAGAGGCCCCACCGTCTGGCAGATTATGACCCAGTGCCACCCACTGTCCAACCACTCCAACTTCTTCACCGTGAAAGCCGAGGCCTCCTCAACACTACCTCTCGCCACCAGCATGGCCAATTGCAACACCGCCGCCGTTCCAGGGAAGGTGATGGGCACACCTGGCCCTGCCGGCAGAATCAGCCCAGAAGGAAGTCAGGTGTTGAGTAAAAAGAAGCTGCAGGACCTCGTAAGAGAGATTGACCCCAATGAGCAGCTCGATGAGGATGTGGAGGAGATGCTGCTACAGATTGCAGATGACTTCATTGACAGTGTGGTGACGGCTGCCTGTCAGCTGGCCCGCCATCGCAAATCCAACACCTTAGAAGTGAAGGACGTCCAGCTACACCTGGAGCGCCAATGGAACATGTGGATTCCTGGCTATGGTTCAGATGAGATTCGGCCGTATAAGAAGGCTTGTACCACAGAGGCCCACAAACAGGTTTTGTGTGTGATTTGTCAGCTCCATCATCACACAAGTATTTTGATCTTCAGTCCGTTTTAATGCTTTTCACCACAGACTGGCCAAAATCACACATTCCTCATTCAGTGTAAATGTACACTCTGGTATGGAGTGTTGTTTTGGGACAGTGTTTTGTTTTTGGAATTATCTGTTCAACTTTACTTTTTTGTTAAGGGGGTAACCACCAAACACGCACATCTTCAATATGGTGGTGTCTTCCATACTCTTTCCCAAatttttttaaaaaaactttttttttattttattttattttgtctggCATGTGTTTGCTGTTGTGTGTTTAGTTTTTGTCACACAAACAAACCCCCTTCATCTAACATCAGAAATATACACCATTTGCATTTAGTTGGTTTCCAGGATACTGTCATGGCACAATGTTTTTGTGTGGTGTAGGGATCTGATGTCATCTCCACAGTTCATTAGAAATGTACCCAGGACATTGTTTTTCATAAGATGTCAACAATTAACAACAAATGACTGACTATTATTCAAAAAATAATAAGTATGTGAAGTATGTCTTGTGTCGCCAGACTGCAGTGAGATGTGGTTAGGTAATGGTCCTTATTTGGGGATGTGTGGGGAAGCTGTAACATTTGTTTTACTTTATATTGGCAGTGTTTTAGTTAAACCTGTTATTTTTATTCCATAAATAAGATTCATATTTCACTTG
>XM_036949447.1
CACGTGAGTGTTGATATGCCCATACGCAATAATTTTCACGGTCCTTACGACGACAGTGCAGACCCAGAGAGAGGCCCCACCGTCTGGCAGATTATGACCCAGTGCCACCCACTGTCCAACCACTCCAACTTCTTCACCGTGAAAGCCGAGGCCTCCTCAACACTACCTCTCGCCACCAGCATGGCCAATTGCAACACCGCCGCCGTTCCAGGGAAGGTGATGGGCACACCTGGCCCTGCCGGCAGAATCAGCCCAGAAGGAAGTCAGGTGTTGAGTAAAAAGAAGCTGCAGGACCTCGTAAGAGAGATTGACCCCAATGAGCAGCTCGATGAGGATGTGGAGGAGATGCTGCTACAGATTGCAGATGACTTCATTGACAGTGTGGTGACGGCTGCCTGTCAGCTGGCCCGCCATCGCAAATCCAACACCTTAGAAGTGAAGGACGTCCAGCTACACCTGGAGCGCCAATGGAACATGTGGATTCCTGGCTATGGTTCAGATGAGATTCGGCCGTATAAGAAGGCTTGTACCACAGAGGCCCACAAACAGGTTTTGTGTGTGATTTGTCAGCTCCATCATCACACAAGTATTTTGATCTTCAGTCCGTTTTAATGCTTTTCACCACAGACTGGCCAAAATCACACATTCCTCATTCAGTGTAAATGTACACTCTGGTATGGAGTGTTGTTTTGGGACAGTGTTTTGTTTTTGGAATTATCTGTTCAACTTTACTTTTTTGTTAAGGGGGTAACCACCAAACACGCACATCTTCAATATGGTGGTGTCTTCCATACTCTTTCCCAAatttttttaaaaaaactttttttttattttattttattttgtctggCATGTGTTTGCTGTTGTGTGTTTAGTTTTTGTCACACAAACAAACCCCCTTCATCTAACATCAGAAATATACACCATTTGCATTTAGTTGGTTTCCAGGATACTGTCATGGCACAATGTTTTTGTGTGGTGTAGGGATCTGATGTCATCTCCACAGTTCATTAGAAATGTACCCAGGACATTGTTTTTCATAAGATGTCAACAATTAACAACAAATGACTGACTATTATTCAAAAAATAATAAGTATGTGAAGTATGTCTTGTGTCGCCAGACTGCAGTGAGATGTGGTTAGGTAATGGTCCTTATTTGGGGATGTGTGGGGAAGCTGTAACATTTGTTTTACTTTATATTGGCAGTGTTTTAGTTAAACCTGTTATTTTTATTCCATAAATAAGATTCATATTTCACTTG
>XM_036949493.1
ACGGTGTAATGTTTACTGGTTTGCCAGCCGCAATTTTCACGGTCCTTACGACGACAGTGCAGACCCAGAGAGAGGCCCCACCGTCTGGCAGATTATGACCCAGTGCCACCCACTGTCCAACCACTCCAACTTCTTCACCGTGAAAGCCGAGGCCTCCTCAACACTACCTCTCGCCACCAGCATGGCCAATTGCAACACCGCCGCCGTTCCAGGGAAGGTGATGGGCACACCTGGCCCTGCCGGCAGAATCAGCCCAGAAGGAAGTCAGGTGTTGAGTAAAAAGAAGCTGCAGGACCTCGTAAGAGAGATTGACCCCAATGAGCAGCTCGATGAGGATGTGGAGGAGATGCTGCTACAGATTGCAGATGACTTCATTGACAGTGTGGTGACGGCTGCCTGTCAGCTGGCCCGCCATCGCAAATCCAACACCTTAGAAGTGAAGGACGTCCAGCTACACCTGGAGCGCCAATGGAACATGTGGATTCCTGGCTATGGTTCAGATGAGATTCGGCCGTATAAGAAGGCTTGTACCACAGAGGCCCACAAACAGAGAATGGCATTGATCCGCAAAACAACCAAAAAGTAGCAAGACCTGGAACCAGCCTCGCACAAACACTCTGTGCTTTTTGTCTTTTCTCTGTGTATTTCTAATAATGGGGGACATTGTTTCACCCATGTCTTCATCTTCCCCAGGTTTTGTGTGTGATTTGTCAGCTCCATCATCACACAAGTATTTTGATCTTCAGTCCGTTTTAATGCTTTTCACCACAGACTGGCCAAAATCACACATTCCTCATTCAGTGTAAATGTACACTCTGGTATGGAGTGTTGTTTTGGGACAGTGTTTTGTTTTTGGAATTATCTGTTCAACTTTACTTTTTTGTTAAGGGGGTAACCACCAAACACGCACATCTTCAATATGGTGGTGTCTTCCATACTCTTTCCCAAatttttttaaaaaaactttttttttattttattttattttgtctggCATGTGTTTGCTGTTGTGTGTTTAGTTTTTGTCACACAAACAAACCCCCTTCATCTAACATCAGAAATATACACCATTTGCATTTAGTTGGTTTCCAGGATACTGTCATGGCACAATGTTTTTGTGTGGTGTAGGGATCTGATGTCATCTCCACAGTTCATTAGAAATGTACCCAGGACATTGTTTTTCATAAGATGTCAACAATTAACAACAAATGACTGACTATTATTCAAAAAATAATAAGTATGTGAAGTATGTCTTGTGTCGCCAGACTGCAGTGAGATGTGGTTAGGTAATGGTCCTTATTTGGGGATGTGTGGGGAAGCTGTAACATTTGTTTTACTTTATATTGGCAGTGTTTTAGTTAAACCTGTTATTTTTATTCCATAAATAAGATTCATATTTCACTTG
>XM_036949486.1
CTGGTTTGCCAGCCGCAATGTGTgatatttgtttttttaactaCCCATTTCACGGTCCTTACGACGACAGTGCAGACCCAGAGAGAGGCCCCACCGTCTGGCAGATTATGACCCAGTGCCACCCACTGTCCAACCACTCCAACTTCTTCACCGTGAAAGCCGAGGCCTCCTCAACACTACCTCTCGCCACCAGCATGGCCAATTGCAACACCGCCGCCGTTCCAGGGAAGGTGATGGGCACACCTGGCCCTGCCGGCAGAATCAGCCCAGAAGGAAGTCAGGTGTTGAGTAAAAAGAAGCTGCAGGACCTCGTAAGAGAGATTGACCCCAATGAGCAGCTCGATGAGGATGTGGAGGAGATGCTGCTACAGATTGCAGATGACTTCATTGACAGTGTGGTGACGGCTGCCTGTCAGCTGGCCCGCCATCGCAAATCCAACACCTTAGAAGTGAAGGACGTCCAGCTACACCTGGGTCCACTGGTGCTTCTCAATAAAAATTCCAGGTGCATATGTGAGTAAAATAGTCGCACCGTA
>XM_036949444.1
CTGGTTTGCCAGCCGCAATGTGTgatatttgtttttttaactaCCCATTTCACGGTCCTTACGACGACAGTGCAGACCCAGAGAGAGGCCCCACCGTCTGGCAGATTATGACCCAGTGCCACCCACTGTCCAACCACTCCAACTTCTTCACCGTGAAAGCCGAGGCCTCCTCAACACTACCTCTCGCCACCAGCATGGCCAATTGCAACACCGCCGCCGTTCCAGGGAAGGTGATGGGCACACCTGGCCCTGCCGGCAGAATCAGCCCAGAAGGAAGTCAGGTGTTGAGTAAAAAGAAGCTGCAGGACCTCGTAAGAGAGATTGACCCCAATGAGCAGCTCGATGAGGATGTGGAGGAGATGCTGCTACAGATTGCAGATGACTTCATTGACAGTGTGGTGACGGCTGCCTGTCAGCTGGCCCGCCATCGCAAATCCAACACCTTAGAAGTGAAGGACGTCCAGCTACACCTGGAGCGCCAATGGAACATGTGGATTCCTGGCTATGGTTCAGATGAGATTCGGCCGTATAAGAAGGCTTGTACCACAGAGGCCCACAAACAGGTTTTGTGTGTGATTTGTCAGCTCCATCATCACACAAGTATTTTGATCTTCAGTCCGTTTTAATGCTTTTCACCACAGACTGGCCAAAATCACACATTCCTCATTCAGTGTAAATGTACACTCTGGTATGGAGTGTTGTTTTGGGACAGTGTTTTGTTTTTGGAATTATCTGTTCAACTTTACTTTTTTGTTAAGGGGGTAACCACCAAACACGCACATCTTCAATATGGTGGTGTCTTCCATACTCTTTCCCAAatttttttaaaaaaactttttttttattttattttattttgtctggCATGTGTTTGCTGTTGTGTGTTTAGTTTTTGTCACACAAACAAACCCCCTTCATCTAACATCAGAAATATACACCATTTGCATTTAGTTGGTTTCCAGGATACTGTCATGGCACAATGTTTTTGTGTGGTGTAGGGATCTGATGTCATCTCCACAGTTCATTAGAAATGTACCCAGGACATTGTTTTTCATAAGATGTCAACAATTAACAACAAATGACTGACTATTATTCAAAAAATAATAAGTATGTGAAGTATGTCTTGTGTCGCCAGACTGCAGTGAGATGTGGTTAGGTAATGGTCCTTATTTGGGGATGTGTGGGGAAGCTGTAACATTTGTTTTACTTTATATTGGCAGTGTTTTAGTTAAACCTGTTATTTTTATTCCATAAATAAGATTCATATTTCACTTG
>XM_036949455.1
CTGGTTTGCCAGCCGCAATGTGTgatatttgtttttttaactaCCCATTTCACGGTCCTTACGACGACAGTGCAGACCCAGAGAGAGGCCCCACCGTCTGGCAGATTATGACCCAGTGCCACCCACTGTCCAACCACTCCAACTTCTTCACCGTGAAAGCCGAGGCCTCCTCAACACTACCTCTCGCCACCAGCATGGCCAATTGCAACACCGCCGCCGTTCCAGGGAAGGTGATGGGCACACCTGGCCCTGCCGGCAGAATCAGCCCAGAAGGAAGTCAGGTGTTGAGTAAAAAGAAGCTGCAGGACCTCGTAAGAGAGATTGACCCCAATGAGCAGCTCGATGAGGATGTGGAGGAGATGCTGCTACAGATTGCAGATGACTTCATTGACAGTGTGGTGACGGCTGCCTGTCAGCTGGCCCGCCATCGCAAATCCAACACCTTAGAAGTGAAGGACGTCCAGCTACACCTGGAGCGCCAATGGAACATGTGGATTCCTGGCTATGGTTCAGATGAGATTCGGCCGTATAAGAAGGCTTGTACCACAGAGGCCCACAAACAGAGAATGGCATTGATCCGCAAAACAACCAAAAAGTAGCAAGACCTGGAACCAGCCTCGCACAAACACTCTGTGCTTTTTGTCTTTTCTCTGTGTATTTCTAATAATGGGGGACATTGTTTCACCCATGTCTTCATCTTCCCCAGGTTTTGTGTGTGATTTGTCAGCTCCATCATCACACAAGTATTTTGATCTTCAGTCCGTTTTAATGCTTTTCACCACAGACTGGCCAAAATCACACATTCCTCATTCAGTGTAAATGTACACTCTGGTATGGAGTGTTGTTTTGGGACAGTGTTTTGTTTTTGGAATTATCTGTTCAACTTTACTTTTTTGTTAAGGGGGTAACCACCAAACACGCACATCTTCAATATGGTGGTGTCTTCCATACTCTTTCCCAAatttttttaaaaaaactttttttttattttattttattttgtctggCATGTGTTTGCTGTTGTGTGTTTAGTTTTTGTCACACAAACAAACCCCCTTCATCTAACATCAGAAATATACACCATTTGCATTTAGTTGGTTTCCAGGATACTGTCATGGCACAATGTTTTTGTGTGGTGTAGGGATCTGATGTCATCTCCACAGTTCATTAGAAATGTACCCAGGACATTGTTTTTCATAAGATGTCAACAATTAACAACAAATGACTGACTATTATTCAAAAAATAATAAGTATGTGAAGTATGTCTTGTGTCGCCAGACTGCAGTGAGATGTGGTTAGGTAATGGTCCTTATTTGGGGATGTGTGGGGAAGCTGTAACATTTGTTTTACTTTATATTGGCAGTGTTTTAGTTAAACCTGTTATTTTTATTCCATAAATAAGATTCATATTTCACTTG
>XM_021563803.2
TAAATGGATAACTGCCTAGATGTGATATGATATGACTAGGTTTTAAGATCTGTAGAATTTTTTTCCCAAATTATGTTTGTTTTTCAGGTTTTCATGCTCAAAATCACActtaaagcattgttgtggactacAATATTAACTACATCAGGAGAcgacttttgagTTTCACGGTCCTTACGACGACAGTGCAGACCCAGAGAGAGGCCCCACCGTCTGGCAGATTATGACCCAGTGCCACCCACTGTCCAACCACTCCAACTTCTTCACCGTGAAAGCCGAGGCCTCCTCAACACTACCTCTCGCCACCAGCATGGCCAATTGCAACACCGCCGCCGTTCCAGGGAAGGTGATGGGCACACCTGGCCCTGCCGGCAGAATCAGCCCAGAAGGAAGTCAGGTGTTGAGTAAAAAGAAGCTGCAGGACCTCGTAAGAGAGATTGACCCCAATGAGCAGCTCGATGAGGATGTGGAGGAGATGCTGCTACAGATTGCAGATGACTTCATTGACAGTGTGGTGACGGCTGCCTGTCAGCTGGCCCGCCATCGCAAATCCAACACCTTAGAAGTGAAGGACGTCCAGCTACACCTGGAGCGCCAATGGAACATGTGGATTCCTGGCTATGGTTCAGATGAGATTCGGCCGTATAAGAAGGCTTGTACCACAGAGGCCCACAAACAGGTTTTGTGTGTGATTTGTCAGCTCCATCATCACACAAGTATTTTGATCTTCAGTCCGTTTTAATGCTTTTCACCACAGACTGGCCAAAATCACACATTCCTCATTCAGTGTAAATGTACACTCTGGTATGGAGTGTTGTTTTGGGACAGTGTTTTGTTTTTGGAATTATCTGTTCAACTTTACTTTTTTGTTAAGGGGGTAACCACCAAACACGCACATCTTCAATATGGTGGTGTCTTCCATACTCTTTCCCAAatttttttaaaaaaactttttttttattttattttattttgtctggCATGTGTTTGCTGTTGTGTGTTTAGTTTTTGTCACACAAACAAACCCCCTTCATCTAACATCAGAAATATACACCATTTGCATTTAGTTGGTTTCCAGGATACTGTCATGGCACAATGTTTTTGTGTGGTGTAGGGATCTGATGTCATCTCCACAGTTCATTAGAAATGTACCCAGGACATTGTTTTTCATAAGATGTCAACAATTAACAACAAATGACTGACTATTATTCAAAAAATAATAAGTATGTGAAGTATGTCTTGTGTCGCCAGACTGCAGTGAGATGTGGTTAGGTAATGGTCCTTATTTGGGGATGTGTGGGGAAGCTGTAACATTTGTTTTACTTTATATTGGCAGTGTTTTAGTTAAACCTGTTATTTTTATTCCATAAATAAGATTCATATTTCACTTG

Function

NR:

description
transcription initiation factor TFIID subunit 12-like isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0006352 DNA-templated transcription, initiation biological_process
GO:0006413 translational initiation biological_process
GO:0005669 transcription factor TFIID complex cellular_component
GO:0003743 translation initiation factor activity molecular_function
GO:0046982 protein heterodimerization activity molecular_function

KEGG:

id description
K03126 TAF12; transcription initiation factor TFIID subunit 12

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021563788.2 False 1357 mRNA 0.42 6 44464974 44472924
XM_021563780.2 False 1381 mRNA 0.44 6 44465223 44472924
XM_021563811.2 False 1524 mRNA 0.44 6 44465223 44472924
XM_021563795.2 False 1359 mRNA 0.44 6 44465225 44472924
XM_021563818.2 False 1495 mRNA 0.44 6 44465232 44472924
XM_021563762.2 False 1379 mRNA 0.43 6 44465271 44472924
XM_036949447.1 False 1261 mRNA 0.43 6 44465700 44472924
XM_036949493.1 False 1405 mRNA 0.44 6 44465746 44472924
XM_036949486.1 False 536 mRNA 0.53 5 44465761 44467932
XM_036949444.1 False 1275 mRNA 0.43 6 44465761 44472924
XM_036949455.1 False 1418 mRNA 0.43 6 44465761 44472924
XM_021563803.2 True 1391 mRNA 0.42 6 44465874 44472924

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110490326 LOC106605007 coding upstream 503982 43955049 ~ 43960992 (+)
LOC110490316 LOC106584327 coding upstream 514627 43947088 ~ 43950347 (+)
LOC110490231 LOC106605011 coding upstream 813222 43630465 ~ 43651752 (+)
LOC110501593 pigv coding upstream 865547 43597314 ~ 43599427 (+)
LOC110490199 NA coding upstream 868615 43570290 ~ 43596359 (+)
LOC110490437 LOC106584212 coding downstream 78239 44551163 ~ 44553979 (+)
LOC110490546 LOC106560730 coding downstream 730385 45203309 ~ 45255843 (+)
tsg101a tsg101 coding downstream 971149 45444073 ~ 45468845 (+)
brsk2a LOC106560719 coding downstream 1123079 45596003 ~ 46132114 (+)
LOC118940395 NA coding downstream 1226273 45699197 ~ 45755983 (+)
G146850 NA non-coding upstream 22787 44441870 ~ 44442187 (+)
G146848 NA non-coding upstream 29248 44435086 ~ 44435726 (+)
G146845 NA non-coding upstream 32073 44432693 ~ 44432901 (+)
G146843 NA non-coding upstream 33829 44430885 ~ 44431145 (+)
G146676 NA non-coding upstream 246908 44217617 ~ 44218066 (+)
G147346 NA non-coding downstream 134749 44607673 ~ 44608027 (+)
G147347 NA non-coding downstream 136784 44609708 ~ 44612919 (+)
G147348 NA non-coding downstream 138298 44611222 ~ 44611884 (+)
G147349 NA non-coding downstream 142138 44615062 ~ 44617145 (+)
G147353 NA non-coding downstream 155195 44628119 ~ 44628374 (+)
G146841 NA other upstream 35581 44429153 ~ 44429393 (+)
G146226 NA other upstream 467909 43996780 ~ 43997065 (+)
G146165 NA other upstream 575365 43886596 ~ 43889609 (+)
G146114 NA other upstream 665121 43799404 ~ 43799853 (+)
G146091 NA other upstream 695812 43768707 ~ 43769162 (+)
G147510 NA other downstream 397876 44870800 ~ 44871500 (+)
G148191 NA other downstream 999158 45472082 ~ 45492379 (+)
uevld uevld other downstream 2508795 46981686 ~ 47007672 (+)
G150997 NA other downstream 3025024 47497948 ~ 47547579 (+)
G152167 NA other downstream 4083858 48556782 ~ 48557686 (+)

Expression


Co-expression Network