XLOC_020644 (CABZ01101813.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_020644
gene name CABZ01101813.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 76469 ~ 80533 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00040841
ATGACCGAAGCATCTGCAGGAGAGCAGCGGCCGCCGGGCTTTCTGGAGCGGCTGCGCGCGAGCACTGGAGGCGTGATTGCGGGCGCGTGCCTGTTCGCGCTCTCGCTGTATGTGCTGTTCACCAAcgagggGCGTGCTCTGCGCATCGCCGCGGCTCTGGATGAGGGTCTCTCCCAGCTGGTGTGTGTGCAGTCGGATGCGCAGCCAGAGCTCAGGAATGATGGACGGCTGGTTCACCTGAGTGGAGATCTGCGCACcgcacagCCGCTGCATGACCCCAACTACAGTGTGTCTGTGCATGCAGTGAAGCTGCAGAGGCAGGTGGAGATGTACCAATGGGTGGAGTACAGCGACAGCAGGACCGTTGAGGAGAACGGAGAGAAGAAAACAGAAACCACATACTCATACAACACTGAGTGGAGGTCAGAGGTCATCAGCAGCAGGCACTTTGACCAGGAGGTTGGACACATGAACCCCAGGTGAGCGCCGgtactggagtgtgtgtgtgtgtgtttatctgtgttgtacatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcatatctacgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttagtgtgtgtgtgtgtgtgtgttagtgttagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttagtgtgtgtgtgtgttgacctcTGGGTGTCGGGGGTTGGGTGTGTGATAGTAGTAGTCGTCCTGCACGGTGAGGAAACCGGCAACAGGAACAGGAAGTGCGGAGAGGCTGAGTGTGTGGAACTCACTGATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACACACACTCGTTTACCTGTGGACAGGAGGAAGTTCCCGACCCACACTTCTGGAGCCACAACCGTCACACTCTCCACCGCCAtctcactgcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacagccgtgCAGGGCTCAGTGAGAGTggagatctgctgtgtaaagcctgatttatacttctgcatcaagtgaccagactcgtcagcgctaccaagccgaccaatcacagagcttgcgctacgcatcgatgtgacgtgtagttaaattttttgagaggtgcacatcagtgccgtagcatacgctggcgtttgacgcagacgtataaatcagccttaacggaGCTGAAGCAGAGCTGCTCTCATATGATCGTCTCTCAGTTCTAGAAGCGCTCTAGCGGCAGCGTCTGAACAGCTGGAGTTAGAgcattagcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacataataacaCATTACAGTAGTGTGATGCTGCGtcacaccagatgcagatgaAGCGCCGAGCGCCAGTCATTTACGTGTTAAGTGAATGCAAAGACACGAACAGACGTCCTGCGGCGCGATGCATCCCACTGAGACGAGCGGACGCCGTGATTTGTGCAAATGATGCGGTGCGCGTGTATCAGGCGGTGCGAATGTCACAGTGCGAACGATAGGAGAGGTGCGAATGATGCGGTGTGATTGGCGCGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGCGGTGTTGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGCGGTGTTGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGACGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGACGTGTGGATGAGGACGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGACATGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGAGGTGTTGATGAGGACATGTGGATGAGGAGGTGTTGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTTGATGAGGACGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGATGTGATTGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGACGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGAGGTGTTGATGAGGAGGTGTTGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGACGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGACGTGTGGATGAGGACGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGACATGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGAGGTGTTGATGAGGACATGTGGATGAGGAGGTGTTGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTTGATGAGGACGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGATGTGATTGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGACGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGAGGTGTTGATGAGGAGGTGTTGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGACGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGCGGTGTTGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGACGTGTGGATGAGGACGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGAGGTGTTGATGAGGAGGTGTTGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTTGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTTGATGAGGAGGTGTTGATGAGGAGGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTTGATGAGGAGGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATAAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGATGTGATTGATGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGCGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGGAGGTGTGGATGAGG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000115428

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00040841 True 3388 mRNA 0.54 6 76469 80533

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_020643 CABZ01085139.1 coding downstream 19292 56644 ~ 57177 (-)
XLOC_020642 CABZ01085140.1 coding downstream 25591 44365 ~ 50878 (-)
XLOC_020641 NA coding downstream 40353 27146 ~ 36116 (-)
XLOC_020640 mrpl20 coding downstream 65643 9165 ~ 10826 (-)
XLOC_020639 atad3 coding downstream 69419 5156 ~ 7050 (-)
XLOC_020645 ndufaf3 coding upstream 5064 85597 ~ 94519 (-)
XLOC_020646 NA coding upstream 20549 101082 ~ 101447 (-)
XLOC_020647 si:ch1073-335m2.2 coding upstream 50434 130967 ~ 155627 (-)
XLOC_020648 fblim1 coding upstream 77579 158112 ~ 164944 (-)
XLOC_020649 slc25a34 coding upstream 104137 184670 ~ 188112 (-)
XLOC_020657 NA non-coding upstream 233177 313710 ~ 315380 (-)
XLOC_020664 NA non-coding upstream 312086 392619 ~ 395900 (-)
XLOC_020672 NA non-coding upstream 579384 659917 ~ 697504 (-)
XLOC_020673 NA non-coding upstream 619680 700213 ~ 704907 (-)

Expression


Co-expression Network