LOC110492340 (LOC106561069)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110492340
gene name LOC106561069
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 57536947 ~ 57546176 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>XM_021566576.2
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>XM_036951382.1
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>TU185895
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036951382.1 False 3763 mRNA 0.40 6 57540676 57546176
TU185895 True 270 lncRNA 0.43 1 57536952 57537221

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110492265 dennd5a coding upstream 9864 57467108 ~ 57527083 (+)
LOC110492368 LOC106561072 coding upstream 78861 57454370 ~ 57458086 (+)
LOC110492381 LOC106561071 coding upstream 82851 57449413 ~ 57454096 (+)
LOC110492347 LOC106561068 coding upstream 87683 57440643 ~ 57449264 (+)
LOC110492386 LOC106561075 coding upstream 104840 57430187 ~ 57432107 (+)
LOC110492398 LOC106561074 coding downstream 4776 57550952 ~ 57556023 (+)
LOC110492308 LOC106561065 coding downstream 10629 57556805 ~ 57560839 (+)
LOC110492452 ccdc34 coding downstream 28072 57574248 ~ 57579830 (+)
LOC110492461 LOC106561056 coding downstream 33978 57580154 ~ 57583524 (+)
ush1c LOC106561052 coding downstream 60684 57606860 ~ 57655596 (+)
G163049 NA non-coding upstream 2704 57533948 ~ 57534243 (+)
G163048 NA non-coding upstream 4779 57531949 ~ 57532168 (+)
G163047 NA non-coding upstream 5772 57530950 ~ 57531175 (+)
G162955 NA non-coding upstream 190458 57346238 ~ 57346489 (+)
G162944 NA non-coding upstream 218267 57318470 ~ 57318680 (+)
G163352 NA non-coding downstream 115776 57661952 ~ 57664441 (+)
G163362 NA non-coding downstream 243531 57789707 ~ 57792414 (+)
G163438 NA non-coding downstream 248373 57794549 ~ 57794862 (+)
G163464 NA non-coding downstream 298947 57845123 ~ 57845437 (+)
G163473 LOC106613263 non-coding downstream 309108 57855284 ~ 58335346 (+)
G162130 NA other upstream 483305 57048314 ~ 57053642 (+)
G161687 NA other upstream 1284349 56245044 ~ 56252598 (+)
G160569 NA other upstream 1589702 55946143 ~ 55947245 (+)
G159889 LOC106562215 other upstream 2808087 54728296 ~ 54728860 (+)
G159415 NA other upstream 3183559 54352983 ~ 54353388 (+)
G163513 LOC106561046 other downstream 381974 57928150 ~ 57931991 (+)
G163660 LOC106561040 other downstream 669501 58215677 ~ 58216383 (+)
G166131 lmod2 other downstream 2399532 59945708 ~ 59953165 (+)
G166878 NA other downstream 2969456 60515632 ~ 60515880 (+)
LOC110493059 LOC100194658 other downstream 3305256 60851417 ~ 60866455 (+)

Expression


Co-expression Network