XLOC_020664


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_020664
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 392619 ~ 395900 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00042230
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>TCONS_00042233
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>TCONS_00042232
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>TCONS_00042231
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Function

GO:

id name namespace
GO:0022402 cell cycle process biological_process
GO:0007049 cell cycle biological_process
GO:0051301 cell division biological_process
GO:0008608 attachment of spindle microtubules to kinetochore biological_process
GO:1903047 mitotic cell cycle process biological_process
GO:1901988 negative regulation of cell cycle phase transition biological_process
GO:0000278 mitotic cell cycle biological_process

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00042230 False 1597 lncRNA 0.43 4 392619 394738
TCONS_00042233 False 3071 lncRNA 0.41 3 392619 395900
TCONS_00042232 False 3074 lncRNA 0.41 3 392619 395900
TCONS_00042231 True 2756 lncRNA 0.40 4 392619 395900

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_020663 CABZ01072989.1 coding downstream 395 387073 ~ 392224 (-)
XLOC_020662 ora3 coding downstream 9664 381143 ~ 382955 (-)
XLOC_020661 FNDC10 coding downstream 19896 370915 ~ 372723 (-)
XLOC_020660 ssu72 coding downstream 25050 359273 ~ 367569 (-)
XLOC_020659 tmem240b coding downstream 38027 349121 ~ 354592 (-)
XLOC_020665 dstyk coding upstream 76427 472327 ~ 506522 (-)
XLOC_020666 ccnd3 coding upstream 141817 537717 ~ 547760 (-)
XLOC_020667 bysl coding upstream 154928 550828 ~ 557965 (-)
XLOC_020668 tmcc2 coding upstream 195909 591809 ~ 600016 (-)
XLOC_020669 cdkn1a coding upstream 207482 603382 ~ 607812 (-)
XLOC_020657 NA non-coding downstream 77239 313710 ~ 315380 (-)
XLOC_020646 NA non-coding downstream 291172 101082 ~ 101447 (-)
XLOC_020641 NA non-coding downstream 356503 27146 ~ 36116 (-)
XLOC_020672 NA non-coding upstream 264017 659917 ~ 697504 (-)
XLOC_020673 NA non-coding upstream 304313 700213 ~ 704907 (-)
XLOC_020675 NA non-coding upstream 337344 733244 ~ 735244 (-)
XLOC_020676 NA non-coding upstream 343400 739300 ~ 760886 (-)
XLOC_020684 NA non-coding upstream 622445 1018345 ~ 1023531 (-)

Expression


Co-expression Network