XLOC_020684


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_020684
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 1018345 ~ 1023531 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00042238
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>TCONS_00042240
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>TCONS_00042239
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00042238 False 2119 lncRNA 0.39 2 1018345 1022428
TCONS_00042240 False 3872 lncRNA 0.38 2 1018345 1023531
TCONS_00042239 True 4544 lncRNA 0.37 2 1018345 1023531

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_020683 cacna1sa coding downstream 49861 912450 ~ 968484 (-)
XLOC_020682 KCTD20 coding downstream 107419 898131 ~ 910926 (-)
XLOC_020681 cept1b coding downstream 136620 866681 ~ 881725 (-)
XLOC_020680 dram2b coding downstream 152149 856869 ~ 866196 (-)
XLOC_020679 cry4 coding downstream 184239 819656 ~ 834106 (-)
XLOC_020685 si:ch1073-15f12.3 coding upstream 49882 1073413 ~ 1079773 (-)
XLOC_020686 NA coding upstream 132899 1156430 ~ 1168291 (-)
XLOC_020687 NA coding upstream 158553 1182084 ~ 1182479 (-)
XLOC_020688 ampd2a coding upstream 182256 1205787 ~ 1245226 (-)
XLOC_020689 CU570769.4 coding upstream 206375 1229906 ~ 1230022 (-)
XLOC_020676 NA non-coding downstream 257459 739300 ~ 760886 (-)
XLOC_020675 NA non-coding downstream 283101 733244 ~ 735244 (-)
XLOC_020673 NA non-coding downstream 313438 700213 ~ 704907 (-)
XLOC_020672 NA non-coding downstream 320841 659917 ~ 697504 (-)
XLOC_020664 NA non-coding downstream 622445 392619 ~ 395900 (-)
XLOC_020690 NA non-coding upstream 237419 1260950 ~ 1269440 (-)
XLOC_020691 NA non-coding upstream 243460 1266991 ~ 1290856 (-)

Expression


Co-expression Network