znf592 (znf592)



Basic Information


Item Value
gene id znf592
gene name znf592
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 73378175 ~ 73385597 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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AATGTTGTTCACAACACACTGGTCTGGTGACGAAGGGGTGGACTGCCTTTTCTCATAACAATTACTGAAGCCTATCACATTGATAGCTTCCAATAGTTCATCAATTTGTGAATGATCAATACATTTTTACTACAGACTCGCTATATAACAGGACATGTTAGCGCCCGCGGGTTTCCTAGCAAGAAATCaataagctagctagctgttttGTTGCAAAGGAAGAAGTCCACCCGAAAAGAACGAGGCCTGGGGAGAATTATGGCAGCAACACCGGTAGCTAATCGATAGATAGAGGGAGCGTCCCATAATGACACCAACTGACAACCTTGCAGAATTTTAGCAACAAACATAAACAAGAGCCAAATGGTTTTGCAAGCATTCGAACATGGGTGACATGAAGACCCCTGATTTTGATGATCTTTTGGCTGCCTTTGACATCCCCGATGCCACCAGTTTGGATGCCAAAGAGAACATCCAGGAGAGTCACGATGAGGCAGAAGGTCAGCTGAAACACACAGGGATGTGTATGGATGACAGCTTATCTGTTCACCAAGCTGTGGGTGCATCTGATGTACCTGCTGTCAGTGTTATAGTGAAGAACACAAGTCGCCAGGAGTCGTCTgatagtggtggagagagagagggcccacACTTTGGACACCCATTGCAAAATGGTTTCAGGGGGTCAGGGGCCGCCATGGAGTCTCATCAGATAGACCACAGTGGTTCTAAGTCTTTTGTGTCTGCTTTGAATGGGGGTGGCTCAAGAGGGCTCTTAGGGAAGACCCCCGTCCAGCACAAACTTGAAGGAACGCCATCCTTCTCACAGTCCTTTTCCCAGTTCAGCCCCATCTCTAGTCCAGAATCTGAAGACAGCCGAAGCAATGGAGTTGATATCCGTCCAAAACAAGAGAGACCCTACTTCCCTGCTGCCTCTATATTTATGTCTGCAGAACCCCCAATGTCAGACAATCAGAAAAAACAGCTGTCTTACAGCATGTTTGACAAGTGCCATGAAGTAGACTGTGACGTACCTGAGAACCTTCCAAGGAGCAAAGGAGAATCTATCAAAGCAGAGGATACCAGGACAGAGAAGCCTGACAGTAATGTCAGTGACCAGAAGGTAAAGGGAGATTGTCATAGTAGTGCAATGCTCCTTACAAATGATCATAACAATATTGTGTCAAGCAGTAACGTTAATATAGTGGCAGCGTCTAATATGCCCACCTCTCATCCATGTGTCAAAACTCCAACATCAAAACTATCGTCATGCCTTGAGGCATTAGTGGCTCTAAATGCCAGAAAGGATCCCAGTGAACAACCAAACTATCAAGATCTATCATTGGCTCATGATGACAACATAAAGGTTAGTCCTAAAGTGCCCATGTCACCACAAAGTCCCAGGAGTCCTCTTGAAGCTGTGAAGCGGTTAATGAAACCACCTGACAGTCCTGTAAGCATTTGCAGTAACAGCAGTGGCAAGGGATCCCCTGCACTGGCATCTGGCTCACCCCCAGCCATACCGAGGGTCAGGATAAAGACCATTAAAACCACGACTGGGCAAATCCAGCGCACTGTTACCAGTGTAGTACCTGATTCAGAAAACGAGGACGTTCACTCTGTTGAGTCCTCTCCATCCCAGAGTATGATTGTTGAGGATGCCTACCCTAGTTTGTCTCCCTATCCCTCTCATAATGTGATAAGTGATATTATTGTTGATATGCCCATCAAAAGTACACCAGTTGGTGCTCTGCCCTCAAAGGTTACTGATACTAAATTAGAGGGGAACTCCAAGAGGCCAGGACAAATGCAGTCCGCAACTATTTTTCATAATACAAGTAGTCCTGTTATGAGGTCTATGCCAGTTGCCCAGCATGGGCCTTCTACACAAAAGAGGATTTCATCAGTTCAAACAGGCAACTCTCCCAATACAAGCTTGCTTCCCAAGGCAATGCACTTAGCTAACCTGAACCTAGTCCCTCACAGTGTTGCTGCCTCAGTCGCAGCACGCTCCACCTCCCATCAACAGAGCCAACAACACACGCTTTCCTCTTCTATGGTGTGCAGCACTGTCCCATTGGTACACCAAGTGAAAAAAGCTGCCCCTAATCCACGTGCTGCCATTCCTAGCACAGCAGCAGGAACTTTAAACAGACTGTTAAATAATGCCAACCCTGTACCCACATATGTACCCAACCTAAACCCACCACCTGAGAGCAACATCAACTTGCCACCACGTGGATATTGTTGCCTGGAGTGTGGGGACTCCTTTGGGGTAGAGAGGAGTCTTGTTTATCATTATGGCAGGAGGAGTGTGCACATTGAAGTAGCCTGCACCCACTGTGCTAAGACCATGGTATTCTTCAACAAGTGTGCCCTGCTGGCACATGCACGGGAACATAAGAACAAAGGTGTGGTGATGCAGTGCACACAGCTCTCCATGAAGCCCATAGCAGAGGGACAGATGTTTGCACCCTTGATCACTGAATCCTCTGTGCATGTGGGCTCCCATGTGCCCCCATTATCCTCACCTAAAAGCCAACCAGTCATGCCCCTCTATCCAGACAAAGTCATCCGCCACAGACTCCGCTGCCTCGAGTGTAACAAGCAGCTATCGGACTACAAAGGTCTCGCAGGCCATTACCAGAGGTTGTCGGAAGAAATGGAGGGACTGATGTGTAAGGTGTGCTCAATGCTGCTACCCAACAAGTGCAGCTACCGGGCTCACCAGCGTATTCATGCCCACAAGTCCCCTTATTGCTGCCCTGAGTGTGGTGCGCTGAGTCGCTCTGTGGATATACAGAAGCATGTGAAGGAGAACTGTCTTCACTATGCACGCAAGGCTGGCTATAAGTGTCTTCATTGTGATATGGTTTTCATGTCATTTAATGTGCAGAAGAGTCACATTGAGGAGAAACACTGTGAGGTCTTCTATAAGTGCACCATCTGTCCTGTTGCTTTCAAGTCTTCTGGTGGATGTGAAATGCATTTGACAACTAAGCACAATGCCAGCAAAGTGTCCCCTCAGTTAATCTTCAAGTGTTCTTGTGAGACAGTGTTCAAGAAAAAGCAGTTATTGCTTCAGCACTTCTATCAGAATGCCAAAAAGCGTGCTACCTGTGTGTTCAAGTGCCCTGAGTGCACTTCAATCTTCACCCAAAAGCAGCCTTTAATGCAGCACTTCAAGGGGGTACATGGAGGAATCTtcaaagaggaggtggagaaaagCACAAAACCACCTGAGATGACCGCACAGCACCAAGATGTTACCTCGGGATTCCACCAGCCAAAGTCATTGAAGAGTTATCCATGCCGGCAGTGTGAGAGGTCTTTCAATTCCTCTACAAGTTTGAGAAGACACATTCGCAATGACCACGATGGAAAGAAAAATACATTTACCTGCTGGTATTGCACAGATGAGAGGACAACATTCACTACAAACATCTTGTTGAAGAACCACATCAGTTTGATGCATGGGATCAAAAATCCAGACTTCAGTCTGTTAAAATCAGCCCCTCTGGATAGCAGTAAAGCCTTGGGAGAGGTGATTTTTCTTTTAAAAGGACCTGTTTCAAAGAGACCTGCTGTTGAGtctgagggagaggggcaggaagGCGCTGCCCTAGAAGGCTCCCCCGCCAAGCGTCTGAAACATCAGTTTCGCTGCTCAAAGTGTGGCTTCACCACAGAGGATGGCACACAGTTCCAGAAGCACATACCTCAGCATAAAACTGATGAAAACACTCCCCAATGCCTGCACTGTGGATTATGTTTTGCGTCCCAGCTATCTCTCAACAGACACCTGTTTATTGTGCACAAAGTCAAAGAGCCcgaagaagagaggaaagaaaggatgGACATGGAGTACGAGTGCAGAAAGAAGCAGGAAGAGGACGTGGGGAAAGCAGTGggtgtgaatgagagagaggactTGCCACCACCATTAGTTAAATCTGACCCCCAACGGGCAGAGGATCCAACCAGGTTGCACTGTGAGCCTGCAGTAAGACTGACTGTAAATCCACATACAGCTTTCACCTAGAGTTTCATGGATAGTGTCATCAGCAGGCAAAATAAAATCAATGAGAGCAATTTTGAACTTCATAAAAGCTGCGATTTCCATTTCCTTGGGTAATAGTAGTTTAACTTCAGATGCTTGACATGCTGCACTAAAGTGGtacctttttttttatttcattttttgcCTTTAAACTAAATGCTTTTTGTGTTTCTCAAAGCCTTGGGACTGGCAGTTGTTCCAAATCAATTGGATAATTTTGGAAAAAGATtataatgaattatttactttgtTTTACCTTTTGAAGCTTGCATGTTTTGTATTGTAATTCATGTATTAAAATGCCTCTGGTACATAACCACACCCACCTGTAAAGGCACAGGGTTTGGTTCATCAGTATTCTGTAGTGACCCCAGTTATATCAGTTACGTCCCTCAGGCTTACCTCACATTTAGTTTCATATCATGATGACTTTGCTTTAGTTTATGACAGCCATATCATATGCTTGGTTTCATATTTTTGGCCTTATAAAATACATAATAATAGATGGCGCTTCAAGCAGGTCGTGGCTATACTGGTGTCATGTAACAGTATTACAACTTctatcatactgtatgttgaaatATTTACTCTTACCTAGGTACCATTTAGCAcagattatatattttatatccaTTCCATACCAAAAATAGTTTCACATTCATTTATTATGAAAGCCGGCTAAACTACCCAAATAGCACTTTTCTACAAGATCAAATACAGGTGTTGGAGTTAAATGCCTTGCTAAAAGATATTACCTTTTTTTACTACTGATTTTGTAGCTTGGTAAAAGTGAGCTTTCATTCATTTAAAATGCTCTTATATCTATATTCATAGTAGTGGTGACTTGTCTTAGTGATGTCATTGATGTTTTTCTTGGTTAATTGTAATCTTTGGTGAGTGTGAGAAAGCATCTGTTTTGCaagataatgcagggtgttggaAGTGGCTCATTGCCAGCAGTGTACTAAGGCAATTAAAAGAGCAGTGATTTAAATGTAAAGGGTTAGAGCATGTCTGAGTGCATGGGAACATGTTGAAATAAGCTGATGATGGAGACCTGTGCAGCTGTATCTACCTCCATGGTGTATGGCAGTGATTGTTAAACTTGGGATGTTTTGGGAGATTTCACTTTTGTTGCAAGCAATGTAAAATTAATTGTTATTATTCTCAATGTATATCTCCCACAATATTAAATTTTATAAATTACTTTGGAGATTATTTATAGTCACATTGACTTATCCTGTAAACTTTCTATTAAAGTGCTGTATGAACTGTTCATTTTCTAGTGGTTATCTGATAGTGTTCATCCCAAACAGAGCCACTGTTAAAACGCAGTGTCTATGAAACTTCACATCTCAGTGTTTTTATATAGCCTGTCAAGAGAAACTTTGTACTTTTGATAATATGTACAATATTATGGACATGTAAGCTAATCCATGTACACAGTAGCTAATGAACCCTTTATATTTGCAGCATTTCTTAATCCTTCACATATATATTCAACCTGCATCGGCCATTGTGCCTTGCTGTAATGTTTACTTAAAATAACTGCAAATAAACACGAACGTGTCAGCATAAG

Function


symbol description
znf592 Predicted to enable metal ion binding activity. Predicted to be located in nucleus. Orthologous to human ZNF592 (zinc finger protein 592).

NR:

description
zinc finger protein 592 isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036955163.1 False 5807 mRNA 0.44 10 73378175 73385597
XM_036955169.1 False 5733 mRNA 0.44 9 73378175 73385597
XM_036955180.1 True 5639 mRNA 0.44 10 73378175 73385597

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
kti12 kti12 coding downstream 4497 73365566 ~ 73373678 (-)
LOC100653450 LOC106561160 coding downstream 49297 73324175 ~ 73328878 (-)
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etfa LOC100194695 coding downstream 220864 73146221 ~ 73157311 (-)
LOC110495704 nrg4 coding downstream 300066 73076020 ~ 73078379 (-)
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si:ch211-107o10.3 LOC106561176 coding upstream 353585 73739182 ~ 73749958 (-)
G182648 NA non-coding downstream 112477 73233202 ~ 73265698 (-)
G182553 NA non-coding downstream 264295 73107475 ~ 73113880 (-)
G182554 NA non-coding downstream 264730 73107133 ~ 73113445 (-)
G182552 NA non-coding downstream 264834 73107045 ~ 73113341 (-)
G182494 NA non-coding downstream 311451 73011478 ~ 73066724 (-)
G182734 LOC106561167 non-coding upstream 23169 73408766 ~ 73410961 (-)
G182820 NA non-coding upstream 176318 73561915 ~ 73562219 (-)
G182821 NA non-coding upstream 177335 73562932 ~ 73563178 (-)
G182824 NA non-coding upstream 179685 73565282 ~ 73565492 (-)
G182826 NA non-coding upstream 181412 73567009 ~ 73567506 (-)
G182708 NA other downstream 32328 73344950 ~ 73345847 (-)
c2cd4a LOC106561196 other downstream 504430 72833292 ~ 72877678 (-)
G180716 NA other downstream 1266512 72110968 ~ 72111663 (-)
G182882 NA other upstream 290615 73676212 ~ 73676423 (-)
G183096 NA other upstream 607481 73993078 ~ 73993545 (-)
G183538 NA other upstream 721286 74106883 ~ 74110791 (-)
G184006 LOC106561202 other upstream 1345275 74730872 ~ 74732637 (-)
LOC110496186 LOC106561212 other upstream 2220630 75595366 ~ 75607735 (-)

Expression



Co-expression Network