XLOC_002070


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_002070
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 20665016 ~ 20667861 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00005874
CTTCCTGGTGAACTGAGTCTGAGCCTGAAGCTGCTCTAGACCCTCAGGCTGATGGCGAACAGCGGACAGTTCCAGCTCACTGTCAGTGCTGTCTGTCAGAGAGAGAGACCACTGACACAAGGCCGAAAACAAGCACAACACatagaacacacacacacacggctgattCTACAACTGCAGGAAAACTTGCTTTCTAGTGCCTTCGTTTTATCACAATATGTTACAGGCCTTAACAATATAATATGTTTATGCAAAATAATGTCTTATGTATACTATAGGCAAATGTGTAGGATCATAATGTTTTTGAGAGAAGCTTATTTTAGTCTGTGCTTTTGATTCGaactacaaaaaaagtgtaaaactgCACACTGTTATTACAATTTATAAACCGTTTCCTTTTTGAATGTagttgaaaatgtattattaataagaTCTGAAGCTGTATTTTTGGTAGAAAAGGTTATTTCAAAAAGATAAAGTTCACAAACCTTTGACTAGTAGTGTAGATGAAAATCATGATTtcttattgttttcatttgtgtACTTTCTCCATCCATTTGTGGAATGTAAACATTTTGTTGTGCTTTTCTTTTGACAACATTATTAAATGTCTAAATAGTAAATTGATACAAATTTGTGTCCATTAATCTTGCAATAGCTCTTTTATTGTACCAAAAGCCAAGGCAACAAATGTGGCAACACTAGTATTAGTTGTGGCTGTATAAGTTAATGTTAgattatgcatttactaacataaacaaacaaagaacaatacGTTAATTACAGCATCTATACttatttgttattgttagtttattaaaaaacagtagttcgttgttagttcatgttacctCACGGTGTGGTAACTAAAGTaaacaagcatgactttggatgtcaataatgcattagtaaatattgaattatgattattaaatgctgtattgttaataattacttcatgttggtaaatacattaactaacattaactaatcaaactttattgtaaagtgtgaccacaaatgtttgaatttttttattttttatttcacggCTCTTAGTATGCCAGTCGAACCACTTCTCTGAATTTTCATTGCCAATCTTAGCCTATCGTAATGGTTTGTATTGGGTCAATTTTGAATTCTTTTTTACCATTGTAAAGCCATGGGGATCAGACAGACAAATGTTAtgttactttaacacattttaataagttaattatgTCTTaacatgatatatatttttttcaattataacACGTTTACCCTAAATATTTTAGTTAGTTTGACTGATGTAACATGGGatgactagaaaaaaaaaaacagttcacatTGTTTCATTACTGCTGCCACAAGatcaaaagaaaaatagaataaatcacTGATTACATTGGCTTGTTGAATTCTTTTTAAATAcatgatttatttttgtcatgtgtCTCTCAGCATTTATGCTGATGATGTGGGATTTCTGACTTAAAGCTGGTTATGAAGGCTAAGTAACAGCACTGTAAACAAAAATAAGTTGACTCAACTCAGAATTGAAAGGCAATTTGCTAcagagcttttttgagttgactcaactttcaacccaagtactgcttgacttgatttaagttgagtaaactcaaagcTGATCGCCTTACTTAGCCTTTATAACCGGCTTTATGTCAGAAATCCCACATTACCAGCAAAAATGCTAAGAGACACATGACAAAAATGAAATcatgtatttaaaaagtattataaaaGTAACAAGAGTGTAAAAGTAAAAGCTGACAATAACAGAATTGACAAAATACTCCAAAGAAGTCTAAACATAAAAAAGGAAGTTGTTTCAATAAGATACTGATACACCAAggctgatctcacaaggaaatttttacgtcacacacacacaaaaaaaaggctttttggtacaaaaaaaaattggtacaaattcatttgatttaatttgtatgGGGGATCCTTgttaggggatgagcaaatcatactaaaatatatGAATGAGACAAATTAATGCAAACTAGCCAGTTTAAAAGCCAAGTTAAAAGCTGCCTGAGATTGTGTCGAAAACACTTGTGAACAggttttttacttacattttaaaaagcaaaattgaTCTTCAATCATAGAATCAGCCACATATTTGGGGTTGAAAGACAAAAGTGCAGGAAAGGATCATTTGAAAAGACGGACAAATGGGAGACTGGGAGAATTCAGATATCAGTGATTCTCAACTGATTTTAGTTCACAGGACAGAAATTTCACTGGAGTCAAGTAGGGACAATGCACTCAATACCTACTCTAAATGGTTTAACTTTTCAATTGAATCAGACATCCTTAAGAGATAGTTCCAAACCTGCTGAGTTTCTTCTGAATgtctcaaaagaagatattttgattgtGAATGTTGGAAAACGGTAGCCACTGACttacaatattgtattttttttatacttgtaATATTgctaacattcttcagaatttcttgttttttgtattttaaaaatactcatgGTGGTTTGGAACTTAATTCAGGTCAGTTAATGCAAACTGCTTTGACTGAGATCTGCCTAAATTGGCTTTAAATAGCAAGCTATTTTTTTCGTGCAACTTTTAAGAGACGTCGGTTGAGAAGCGctgatttatttgacatttactCACCATCTGTGATACACGAGACAACATAAAGAAGAATGGGAAGAGATTTGGAGAGGAAATAAATAGAAAGCaatgggaaaaaaacaacaacaacatgttaGTTGGATTGTTCAAAGATGgcattaaatgaa

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00005874 True 2792 lncRNA 0.32 2 20665016 20667861

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_002069 NA coding upstream 19557 20643335 ~ 20645459 (+)
XLOC_002068 prnpb coding upstream 32237 20628698 ~ 20632779 (+)
XLOC_002067 letm2 coding upstream 38221 20589969 ~ 20626795 (+)
XLOC_002066 NA coding upstream 162838 20501776 ~ 20502178 (+)
XLOC_002065 NA coding upstream 212386 20448467 ~ 20452630 (+)
XLOC_002071 BX548043.1 coding downstream 16175 20684036 ~ 20684150 (+)
XLOC_002072 NA coding downstream 63753 20731614 ~ 20738676 (+)
XLOC_002073 NA coding downstream 436060 21103921 ~ 21106710 (+)
XLOC_002074 NA coding downstream 511623 21179484 ~ 21208200 (+)
XLOC_002075 BX004886.1 coding downstream 568703 21236564 ~ 21236678 (+)
XLOC_002063 NA non-coding upstream 283703 20377088 ~ 20381313 (+)
XLOC_002058 CABZ01059623.1 non-coding upstream 939422 19602334 ~ 19725594 (+)

Expression


Co-expression Network