XLOC_020717


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_020717
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 2224761 ~ 2228252 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00042275
ATTTAATAGTCCTTCTGAGTTCTTGTGTtgatatacatgcatacatgagctcctgaaaaaacacaaaaaaattaaataaataaataaaaatccacacTTGGCAAATCAAGCTCATCCTGATTCTGATTGAACAGTTTTCACAGTAGTTGCTATAGGGGCGGGGCAGGACAAATACACAGACCAATGGCTAAACAACAAAGGAGAGGTTAAGGTTAATGTTTCGTACAATTTTATATTCACTAAGTATAAGAGCCAtaagttcattgttttgtttatgttaaattaataatattgtgaaaggCGAAACTTGAAAATATTTAactaaaagtaattaaatatttaatatagagTATATGCTGATGTCACTTCCGGGAAGGGAGAAGTTGTGTAATGAAGATGGAAGCAAGACAGTTTTTGACCGTGTAATATAGTTCAGTTAAGTTGGTATTAAACATGTTCGAAATGACATCACTGGACTGTCTTATGTTACTCGCCTTCAAATCCTGCTAATTCAAagagagaaacaagacaagaagaGACGGATTGATGGCACATCCActaattgtcattattattatgttcacTACTGTCATGGATTCCAAACTAAAGCAAACAAATCGtctcaactgGAACAATTTTGTGCAACTAAAGCGCCACCAACTGGACGTGTTGAGCGCCTGACATTTTAAAGCTGACGTCTTTTCACTTTGGTGAATGTCTTTGAAGCATGAGGTGTTGTTTTTTTGTGCGATTATGAAACAGTAGAGTCCCAGCAGTGAATATACCACTGCATTGCTGGACATGTGATTATTCAGATAAAATTAAAAGGCGGGGCTAGCGCTGGATGATTCATCAAAGGCAGTTTTCAGATTGAGCAGCTTTACTGCACAGACCCAAAGTTCACTGACAAGCTACGCAAAAGATCGtcgattatttatttaatgtgattctGGAATCGAAGACTCGTTTTGAGATTTTACAGCTGTTTGCGTTCATTCTCAGTGATACGGCAGCGGTCCTCAACCACAGGGCCAAATGGTACCAGGCCACACAAGGCAGaggctgtgtgtttgtttgaataaCACAGTTGAGAGCCGGGTAAGTAACTGCATTATGGACCGGGTCTCGGGCGGCCGCTGTTATtggatactataccaaagttgggGACCCGGGGGTGTTACAGACAGGAAAATACAGACTACAGACTCGAAAATCAAAATTACTGGAGTTTTTtgagagaaataacaaaacgggagggtggtgggagatgggtctgaaatacgagaCTACCTAGAAAACgagaagtgttggcaggtatgggcGTGACACGCTCACGCCTTCCAGACACACCAAGTTCAAAGAATGCTGTGAGTGCACCATGTGACAAGAACTGCTCGATCAGCTTGTAACTGTTTGCTGTTATGTTGTATATTGTGTATATAAGTTGTTTACGTTTCCTTTTTGTTGTTGAGAAAATAGGTTACATTCATTATTTGTAAATGTAGTTTTGTTATTTGGTTTGGTGCTTTGATTTTAAAATCTCGACAGTTGACTGCCTGTAAGGTTCTTACTTGTGAGCAAGCAATCGGCAAACATGAACTGTTTGCATGCGAGCGTCAATGGATGTATTAAATGCAAAGAACTTGAACAAGAGATTGAAAGAGTATTCAAGACAATTACCTTCATGTAGCATGCAGCCAATGAGGTATTGtgctttatatttgtattttgtgtttaaagtTTCTAaggtttgtttgtttacgtttgttttggtttacatTAAGTTCATTTGTTttgccgctgagactgcagctctgcacaagacgtttggccagcggagaaattaattAGAAATTAGAGTCTGGTTTCCcctcaagttttttttccctctccgctgtcgcctctagcttgcatggtttgggatcggtagagctacccattggtgatttgctcttcagtttttggactctcagtaatgatttcaaaccaaactgaactgaacttaaacattaaaaactgaactactctgtttCAATtgctatgaccatttatgtgaagctgctttgaagcaatctacattgtgaaagcgttatacaaataaagctgaattgaattgaattaaatatttattgtttagtttttcacGGTGGATTTGGGGGAAAAGCCGTCAAATAAATCAGTATTACGGAAACCACTTGTGCTTCAGCttgaaatatacacatttcggtagattAATTATCTCAGACAGACACAGAACGcccaaacactgcagtcctttttAAGTTTCTCCATAATAAAAACTTGTATCAGAAccgcagcaatgttttgtcagcttgtgaTCTTCTGAGAAAAGCTTGATGATTGGGGGTGTTTTCATCCAATCTGAGATGATTTTGAGGCCTAATTTGGCCaaagctttctctgtgtttcagcaaaatgaatgatttttggtgataaatcttattttttggcatattttgggaaaaaagTGCTTTGaatttttcaaaaactcaacaatacactcaaattgtctcccctttggttatgttgggggctgtttttgccgcatcgacttccattataatcccattttttgattgcaaagtctATGACAGCATTTAATCATGTATTCTAGATCGTTGGTGGTTCTCCCTgatgggaagaggtaaaattagtaatttttattgttgatcatcagctgcagtgcaaaaaaagcttCGTTTCTGGATTTAACATGaagtgtagtgtgtgtttgtgtgtgtgagatattGTGCACTAGCATATGCACGAGAATCAAAGCTTTTGCTGAATCCCCATCTCAAATTCACTtcaattaatcatgcagccctaggcAGGGATTACGCAAGCATACACACGTTTAACTGTGAAATCTGGTGTTTTCAGGAAGGCGAATTTCCTTCATGTGTAAaactctta

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00042275 True 2937 lncRNA 0.38 2 2224761 2228252

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_020711 NA coding downstream 774 2061685 ~ 2223987 (-)
XLOC_020714 NA coding downstream 51420 2124609 ~ 2173341 (-)
XLOC_020713 NA coding downstream 99609 2096780 ~ 2125152 (-)
XLOC_020712 NA coding downstream 136911 2078625 ~ 2087850 (-)
XLOC_020708 NA coding downstream 203288 1960038 ~ 2021473 (-)
XLOC_020718 NA coding upstream 5737 2233989 ~ 2275936 (-)
XLOC_020719 NA coding upstream 25286 2253538 ~ 2259552 (-)
XLOC_020720 NA coding upstream 29671 2257923 ~ 2267553 (-)
XLOC_020721 NA coding upstream 37954 2266206 ~ 2348036 (-)
XLOC_020722 NA coding upstream 238021 2466273 ~ 2482489 (-)

Expression


Co-expression Network