LOC110499897 (LOC106573100)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110499897
gene name LOC106573100
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 92398054 ~ 92443838 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021576959.2
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>TU231426
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>TU231427
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU231427 True 2394 lncRNA 0.39 2 92398060 92443838

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cry2 LOC106561609 coding downstream 133035 92233431 ~ 92265019 (-)
LOC110502383 LOC106561607 coding downstream 169306 92210330 ~ 92228748 (-)
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LOC110499841 LOC106561606 coding downstream 207682 92153384 ~ 92190372 (-)
LOC110499762 cbpa2 coding downstream 370281 92021755 ~ 92027773 (-)
LOC110499952 LOC106561617 coding upstream 430214 92869846 ~ 92881298 (-)
LOC110499968 NA coding upstream 647629 93087261 ~ 93090465 (-)
LOC118936876 NA coding upstream 736678 93176310 ~ 93199900 (-)
LOC110499982 LOC106561633 coding upstream 898265 93337897 ~ 93372952 (-)
LOC110499989 LOC106573087 coding upstream 1037429 93477061 ~ 93606905 (-)
G204547 NA non-coding downstream 513 92396070 ~ 92397541 (-)
G204421 NA non-coding downstream 71231 92326597 ~ 92326823 (-)
G204379 NA non-coding downstream 90311 92255744 ~ 92307743 (-)
G204290 NA non-coding downstream 188488 92209305 ~ 92209566 (-)
G204288 NA non-coding downstream 190714 92207090 ~ 92207340 (-)
G204728 NA non-coding upstream 24469 92464101 ~ 92464313 (-)
G204736 NA non-coding upstream 29893 92469525 ~ 92469862 (-)
G204738 NA non-coding upstream 36031 92475663 ~ 92480209 (-)
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G204793 NA non-coding upstream 168011 92607643 ~ 92607903 (-)
G204024 NA other downstream 609951 91787187 ~ 91788103 (-)
G203915 rassf9 other downstream 807005 91589212 ~ 91591049 (-)
G202279 NA other downstream 1956629 90377557 ~ 90441425 (-)
LOC110499346 vps4a other downstream 2788164 89606837 ~ 89609890 (-)
G198912 NA other downstream 5071585 87322139 ~ 87326469 (-)
G205192 NA other upstream 522412 92962044 ~ 92962934 (-)
G206742 LOC106561643 other upstream 1872792 94312424 ~ 94312774 (-)
G206744 LOC106561643 other upstream 1873758 94313390 ~ 94313918 (-)
G206750 NA other upstream 1888278 94327910 ~ 94328183 (-)
G207244 LOC100194703 other upstream 2177283 94616915 ~ 94617232 (-)

Expression


Co-expression Network