LOC118943605


Basic Information

Item Value
gene id LOC118943605
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 92664825 ~ 92669744 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036959172.1
TCTGCTCTGTAGGGTTTGATCTGAAGAGAGCTGGAGAGAACATGTGAAGGACAGTGCTGAATCACCCAAAGTGATAAAGAGATCATTAGCCAGCATGACTGATCGTTTTGAACTGTTTTCAACCATCATAACAATTGCATAATTCCACGCCATGTCATCATACATTTCATTTAATacgctttaaaaatatatattattaatttACTTAGACATTTAATTGATTGTTTGATTGATTTACCTCAGAGCTGTATGTAAAATAGCTTTGATTTAACTCACCTTTTGAAAAGCTTTTACCTTATTGCTGACTCGTGTCGCTTACAACTGTTCTGCAGTAGATGTCTTTTGAAGGGCCGGTCATAGAAATATCATGATTGGACTGATCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTTTGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTAGGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTTTGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTTATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGCTATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTTTGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTAGATCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTTTGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTTATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGCTATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGCCATTCTATGTCTTTGTCTATGGGATTACTGGCCATTCTATGTCTTTGTCTATGGGATTACTGGCCATTCTATGTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTTATTTTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGCCATTCTATGTCTTTGTCTATGGGATTACTGGTCATTCTGTCTTGTCTTTGGGAATACGGGTCATTCTATGTCTATGGGATTACTGGCCAGTCTATGTCTATGGGATTACTGGCCATTCTATGTCTTTGTCTATGGGATTACGGGTCATTCTATGACTTTGTCTGTAGGATTACTGGTCATTCTTTGTCTATGGGGCAAGTGGCATGTTTGGAAGCTTGTATACAATTGCTTAATGAAAATACAACTAGGCCTgtagtggtcagtagtggttATAATATAATTCAGCTTTAAATGACAATATTACACTGTTTTTGCATAATATCCTGTGTTGATGGTGAGAGATTATTTTGTTGATTACTTTTGATCATCTGCTATATAAATTCTTTCTATTTTCTCATTTGTAAGCCACTTTGAGGAAAAAAATGGGTGATGATCAGTCTTCAGATAATGAGCGTCTAAAGAAGAGGATTGTATTCTCAGTCACTCTAAGTAATCGTCCCATGCATGGGAGCGctcaaaaaagaaagaaaaaaatgaaaaaacacTAGCATGTTGGTTGTGCAGTTGCCGCTGAACCATAGCCTGGtccagatcagtttgtgccgTCTTACCAACTTCTTGTCACTCATTGTCAATTATTTAAGGTTTGCGTCTTAAACGGCACCCTGACtcatatagtccactacttttaaacagagccctatgggccctggtcaaaagtagtggactggatagggaataggatgccatttaggatgcaaccAAGGAGTTAAAAACAGACCAAAACGGCTAAATCATAGAACCAAAAGAAAGTGATAGCTAGCTTGCACGGCTTTAACTTTGACCAATGTCAGTGTGACTATTTCTGTTCCCTTTTCCTTTATGCTCGGTTTGATTTCTCATTCTGACTGACGGAATGGATTGTCATTGGCTGAGATGATGGCTCGTTTTAGCTTGGAGACAGATGTAGAGTGTAGGCTATGGTATCCTATACTCACAGTGGAgcggtgtctgtctct

Function

NR:

description
PREDICTED: SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036959172.1 True 2300 mRNA 0.39 2 92664825 92669744

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118943603 NA coding upstream 21496 92642030 ~ 92643329 (+)
LOC110499906 LOC106561611 coding upstream 204209 92454325 ~ 92460616 (+)
LOC110499877 LOC106561610 coding upstream 272440 92388109 ~ 92392385 (+)
LOC110499833 LOC106561605 coding upstream 513002 92139080 ~ 92151823 (+)
LOC110499816 LOC106561604 coding upstream 535077 92123060 ~ 92129748 (+)
LOC110499936 LOC106561616 coding downstream 26438 92696182 ~ 92799984 (+)
LOC110499942 LOC106561637 coding downstream 167452 92837196 ~ 92839440 (+)
LOC110533914 LOC106561638 coding downstream 172048 92841792 ~ 92845806 (+)
trnap-ugg-3 NA coding downstream 365246 93034990 ~ 93035061 (+)
trnap-agg-3 NA coding downstream 368422 93038166 ~ 93038237 (+)
G204704 NA non-coding upstream 7579 92657038 ~ 92657246 (+)
G204701 NA non-coding upstream 14679 92649906 ~ 92650146 (+)
G204695 NA non-coding upstream 25674 92638936 ~ 92639151 (+)
G204686 NA non-coding upstream 36849 92627754 ~ 92627976 (+)
G204683 NA non-coding upstream 40583 92623981 ~ 92624242 (+)
G204591 NA non-coding downstream 12950 92682694 ~ 92683249 (+)
G204840 NA non-coding downstream 14101 92683845 ~ 92684139 (+)
G204909 NA non-coding downstream 112673 92782417 ~ 92782902 (+)
G205028 NA non-coding downstream 176162 92845906 ~ 92846227 (+)
G204240 ckap5 other upstream 504922 92157275 ~ 92159903 (+)
G203646 cpa2 other upstream 640083 92021755 ~ 92024742 (+)
G203551 NA other upstream 817425 91826849 ~ 91847400 (+)
G203438 LOC106561592 other upstream 992926 91668836 ~ 91671899 (+)
G203414 NA other upstream 1040532 91622001 ~ 91624293 (+)
G204593 NA other downstream 11602 92681346 ~ 92682355 (+)
G205404 NA other downstream 701649 93371393 ~ 93388550 (+)
G205482 NA other downstream 731873 93401617 ~ 93402234 (+)
G205683 LOC106573085 other downstream 1126338 93796082 ~ 93798936 (+)

Expression


Co-expression Network