LOC118944014


Basic Information

Item Value
gene id LOC118944014
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 101701386 ~ 101703960 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005039305.1
GGGACATGTTCTTTAGACAATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACAACACAGGGACATGTTCTTTAGGCGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGGCGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGGCGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGAGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACTTGGTAGCCATAGAACGTTGTGATCCTCTAAGAACTAGAACAAGGTGTTCTCATTCCAATTCTACTGTTCCAACAGCAAGGTCCTTTCAGTGGAACCCCATTGGCTGTGTTGTCTAGTGCTTCAGTGATAGGAAGGGTTTTTCTGTGGAACCCCATTGGCTGTGTTGTCTAGTGCTTCAGTGATAGGAAGGGTTTTTCTGTGGAACCCCATTGGCTGTGTTGTCTAGTGCTTCAGTGATAGGAAGGGTTTTTCAGTGATTTTGTGCCTAATCTTTATTTGTGCTTTTATAATTGTATTTTTGGTGTTAAGATAGATCCTCCTCGCCCCCCTGAGATACACATGACGCAGACGGACAGATGACGGAGGCGTGTGATagatagaagaagagaaaggagagagagtgggactgaCATCAAAGAGAAATAACATCACAAGGTGtcacactaactaactaactaactaaactaAGCTATGACTACGTCATTACTAACTACAGCATTACTTCACAGccaaaccagacacacacacatacacacacacacacacacaaccaaac
>XR_005039306.1
GGGACATGTTCTTTAGACAATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACAACACAGGGACATGTTCTTTAGGCGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGGCGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGAGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACTTGGTAGCCATAGAACGTTGTGATCCTCTAAGAACTAGAACAAGGTGTTCTCATTCCAATTCTACTGTTCCAACAGCAAGGTCCTTTCAGTGGAACCCCATTGGCTGTGTTGTCTAGTGCTTCAGTGATAGGAAGGGTTTTTCTGTGGAACCCCATTGGCTGTGTTGTCTAGTGCTTCAGTGATAGGAAGGGTTTTTCTGTGGAACCCCATTGGCTGTGTTGTCTAGTGCTTCAGTGATAGGAAGGGTTTTTCAGTGATTTTGTGCCTAATCTTTATTTGTGCTTTTATAATTGTATTTTTGGTGTTAAGATAGATCCTCCTCGCCCCCCTGAGATACACATGACGCAGACGGACAGATGACGGAGGCGTGTGATagatagaagaagagaaaggagagagagtgggactgaCATCAAAGAGAAATAACATCACAAGGTGtcacactaactaactaactaactaaactaAGCTATGACTACGTCATTACTAACTACAGCATTACTTCACAGccaaaccagacacacacacatacacacacacacacacacaaccaaac
>XR_005039307.1
GGGACATGTTCTTTAGACAATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACAACACAGGGACATGTTCTTTAGGCGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGGCGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGATGATGTAGCAAGGTGGTATACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGCTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGTCATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGAGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACATGTTCTTTAGACGATGTAGCAAGGTGGTATACACCACAGGGACTTGGTAGCCATAGAACGTTGTGATCCTCTAAGAACTAGAACAAGGTGTTCTCATTCCAATTCTACTGTTCCAACAGCAAGGTCCTTTCAGTGGAACCCCATTGGCTGTGTTGTCTAGTGCTTCAGTGATAGGAAGGGTTTTTCTGTGGAACCCCATTGGCTGTGTTGTCTAGTGCTTCAGTGATAGGAAGGGTTTTTCTGTGGAACCCCATTGGCTGTGTTGTCTAGTGCTTCAGTGATAGGAAGGGTTTTTCAGTGATTTTGTGCCTAATCTTTATTTGTGCTTTTATAATTGTATTTTTGGTGTTAAGATAGATCCTCCTCGCCCCCCTGAGATACACATGACGCAGACGGACAGATGACGGAGGCGTGTGATagatagaagaagagaaaggagagagagtgggactgaCATCAAAGAGAAATAACATCACAAGGTGtcacactaactaactaactaactaaactaAGCTATGACTACGTCATTACTAACTACAGCATTACTTCACAGccaaaccagacacacacacatacacacacacacacacacaaccaaac

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106588051

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005039305.1 False 2536 mRNA 0.45 2 101701386 101703960
XR_005039306.1 False 2453 mRNA 0.45 2 101701386 101703960
XR_005039307.1 True 2365 mRNA 0.45 2 101701386 101703960

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110512506 LOC106590753 coding downstream 106000 101560267 ~ 101595386 (-)
LOC110501253 LOC106584787 coding downstream 147636 101482142 ~ 101553750 (-)
LOC118944013 NA coding downstream 164632 101536030 ~ 101536754 (-)
pgghg pgghg coding downstream 251222 101414312 ~ 101450164 (-)
incenp inceb coding downstream 292549 101394024 ~ 101408837 (-)
LOC118944015 NA coding upstream 2045 101706005 ~ 101706647 (-)
LOC110517830 LOC105018063 coding upstream 41308 101743015 ~ 101746551 (-)
LOC110501407 LOC106561868 coding upstream 209024 101912984 ~ 101916443 (-)
LOC110501416 LOC106561859 coding upstream 293839 101997799 ~ 102000087 (-)
commd4 comd4 coding upstream 583935 102287895 ~ 102292356 (-)
G212823 NA non-coding downstream 6815 101694232 ~ 101694571 (-)
G212794 NA non-coding downstream 7836 101620626 ~ 101693550 (-)
G212817 NA non-coding downstream 43435 101655495 ~ 101657951 (-)
G212811 NA non-coding downstream 55162 101645642 ~ 101646224 (-)
G212805 NA non-coding downstream 64306 101635758 ~ 101637080 (-)
G212825 NA non-coding upstream 3659 101707619 ~ 101707924 (-)
G212838 NA non-coding upstream 16162 101720122 ~ 101721030 (-)
G212840 NA non-coding upstream 17421 101721381 ~ 101721641 (-)
G212841 NA non-coding upstream 17847 101721807 ~ 101722089 (-)
G212848 NA non-coding upstream 22825 101726785 ~ 101727027 (-)
LOC110502631 LOC106592148 other downstream 521625 100976119 ~ 101191014 (-)
pkp3a pkp3 other downstream 987133 100662972 ~ 100716213 (-)
LOC110502607 ano5 other downstream 1221596 100461545 ~ 100543552 (-)
G211904 LOC100136012 other downstream 1245953 100455149 ~ 100455433 (-)
LOC110500995 LOC106561801 other downstream 1541431 100155072 ~ 100161971 (-)
G212829 LOC106613263 other upstream 8278 101712238 ~ 101712847 (-)
G212836 NA other upstream 15407 101719367 ~ 101719732 (-)
G213475 NA other upstream 682169 102386129 ~ 102531578 (-)
G214030 NA other upstream 1115408 102819368 ~ 102819829 (-)

Expression


Co-expression Network