pias1b (LOC106584817)


Basic Information

Item Value
gene id pias1b
gene name LOC106584817
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 103087359 ~ 103125059 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036961353.1
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Function

NR:

description
PREDICTED: E3 SUMO-protein ligase PIAS1-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036961353.1 False 5370 mRNA 0.47 13 103087359 103125035
TU242857 False 2148 TUCP 0.43 1 103121589 103123736
TU242858 True 2255 lncRNA 0.41 1 103122805 103125059

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
skor1b LOC106561870 coding upstream 4076 103069733 ~ 103083283 (+)
c2h15orf61 cssa10h15orf61 coding upstream 230018 102855890 ~ 102857341 (+)
LOC110501485 LOC106591986 coding upstream 330847 102735537 ~ 102756512 (+)
slc24a1 LOC106561848 coding upstream 366119 102682822 ~ 102721240 (+)
LOC118936918 NA coding upstream 479026 102600618 ~ 102608333 (+)
kbtbd4 kbtbd4 coding downstream 105114 103230149 ~ 103233417 (+)
rapsn rapsn coding downstream 130711 103255746 ~ 103274597 (+)
chid1 chid1 coding downstream 192834 103317869 ~ 103330515 (+)
LOC110533945 NA coding downstream 212073 103337108 ~ 103339336 (+)
LOC110502665 eps8l2 coding downstream 345898 103470933 ~ 103605437 (+)
G213780 NA non-coding upstream 2850 103078745 ~ 103084509 (+)
G213769 NA non-coding upstream 50283 103030111 ~ 103037076 (+)
G213759 NA non-coding upstream 99616 102987295 ~ 102987743 (+)
G213756 NA non-coding upstream 103292 102983782 ~ 102984067 (+)
G213750 NA non-coding upstream 118775 102966435 ~ 102968584 (+)
G213786 NA non-coding downstream 9317 103134352 ~ 103141946 (+)
G213807 NA non-coding downstream 25399 103150434 ~ 103151205 (+)
G213815 NA non-coding downstream 38274 103163309 ~ 103163659 (+)
G213839 kif23 non-coding downstream 64465 103189500 ~ 103191940 (+)
G213859 NA non-coding downstream 94875 103219910 ~ 103220348 (+)
G213775 NA other upstream 22032 103064317 ~ 103065327 (+)
G213645 NA other upstream 407263 102679375 ~ 102680096 (+)
G213221 NA other upstream 487493 102595531 ~ 102599866 (+)
G213185 NA other upstream 571057 102514207 ~ 102516302 (+)
G213055 NA other upstream 847819 102238303 ~ 102239540 (+)
G213798 NA non-coding upstream 11205 103111180 ~ 103111600 (+)
G213797 NA non-coding upstream 14677 103106197 ~ 103108128 (+)
G213794 NA non-coding upstream 19205 103102984 ~ 103103600 (+)
G213791 NA non-coding upstream 24854 103097736 ~ 103097951 (+)
G213790 NA non-coding upstream 25628 103096844 ~ 103097177 (+)

Expression


Co-expression Network