G103865


Basic Information

Item Value
gene id G103865
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 205063 ~ 206020 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU116531
TGATATGTCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGTCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTATCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGTCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTCCTGGTGACAGAAGTAATGCTCTATATGTTCAAAAGGTTGATAATCACtca
>TU116533
TGATATGTCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGTCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAATAGGGAGATTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTATCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTATCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGTCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTCCTGGTGACAGAAGTAATGCTCTATATGTTCAAAAGGTTGATAATCACtca
>TU116534
TGATATGTCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGTCTACTAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGTCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAATAGGGAGATTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTATCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGTCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTCCTGGTGACAGAAGTAATGCTCTATATGTTCAAAAGGTTGATAATCACtca
>TU116535
TGATATGTCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGTCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTATCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGGCTATCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTGATATGATATGTCTACCAGTGATGTAGTAAAATAGGGAGGTTCCTGGTGACAGAAGTAATGCTCTATATGTTCAAAAGGTTGATAATCACtca

Function

NR:

description
PREDICTED: probable cyclin-dependent serine/threonine-protein kinase DDB_G0292550

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU116531 False 425 lncRNA 0.37 3 205063 206020
TU116533 False 580 lncRNA 0.37 4 205063 206020
TU116534 False 538 lncRNA 0.52 2 205063 206020
TU116535 True 509 lncRNA 0.37 4 205063 206020

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118936272 LOC106596174 coding upstream 186967 13864 ~ 18096 (+)
zgc:110410 LOC106594189 coding downstream 508710 714730 ~ 722393 (+)
LOC118937316 LOC106573240 coding downstream 518771 724791 ~ 731551 (+)
cmc1 cc068 coding downstream 654439 860459 ~ 872515 (+)
LOC110506977 LOC106595099 coding downstream 699556 905576 ~ 908576 (+)
LOC118936923 NA coding downstream 762596 968616 ~ 969528 (+)
G103864 NA non-coding upstream 219 204029 ~ 204844 (+)
G103862 NA non-coding upstream 2830 200740 ~ 202233 (+)
G103853 NA non-coding upstream 20633 183874 ~ 184430 (+)
G103798 NA non-coding upstream 23403 169833 ~ 181660 (+)
G103827 NA non-coding upstream 81781 121239 ~ 123282 (+)
G103867 NA non-coding downstream 2886 208906 ~ 209707 (+)
G103871 NA non-coding downstream 14046 220066 ~ 222075 (+)
G103878 NA non-coding downstream 30331 236351 ~ 237556 (+)
G103886 NA non-coding downstream 43599 249619 ~ 250550 (+)
G103887 NA non-coding downstream 45084 251104 ~ 253123 (+)
G103851 NA other upstream 24041 174996 ~ 181022 (+)
G104092 NA other downstream 484026 690046 ~ 701271 (+)
G104761 NA other downstream 947041 1153061 ~ 1153749 (+)
tgfbr2b LOC106606173 other downstream 1103258 1309202 ~ 1390936 (+)
G105036 NA other downstream 1493053 1699073 ~ 1700431 (+)

Expression


Co-expression Network