XLOC_002077 (BX465186.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_002077
gene name BX465186.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 21397320 ~ 21404971 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00004013
gcattgtgggaaggGGATCGCAGCTCAGAAAGCGTTTGATGGACACCGGGACATATTTCTTCCTGTTTTTTCCCTGttgtTTGTCCGTATTTTTCTAAACTGCCGTGCGCGGGAAGTGACGTGACGTCCCAATCACCCACTCACTCCTTCTGCACCTGCGTGAGTCTGACTGGATTAACGGTAAACGTCAGCTTTTCAGTGAGAGTGTAAAAgGTTCTTtcattttggttataagtacatGTTATAGGTAAATTCTTAgattcaatccaaactgaatttgaattaacacagacaaatgaaataaaatacacctgggattttaaatgttttaattttttttattattcacaacgTTTGTGAAGTCTAAATGTAGACTGTCTCAAAttgaatgagtgttatttttgttgtaggtgtgttggtgtaaaaattgatgctgactggttagtactgcatttttacccataacaataatgatttatatttagcatagcatctattgtcattttaccaagaatgtgtttgctctttcagaactaaggcagttgtgctggacctTCTGTACTTTATACAGGAGATGACAGTAAACTTtcaagtttaagaggtaaaatgttcagggtttttctgtttgattttgagtgttttgtagatataaggttcactgatatatgatataagatttgctttatgtttatgttgtcattttggttataagtacaaGGTACAGTTACATTTACATAgcaatctaaattaaaatcttaaatcttacattcaatccaaactgaatttgaattaacatggacaaattaaataaaatacacctgggattttaaatgttttcatttttttgttatttacaaagtttaaagtttaaaagtagACTACGTGCTGCATctttcaaa
>TCONS_00004014
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>TCONS_00004015
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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000093047 ENSDARG00000094461

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00004013 False 899 processed_transcript 0.33 3 21397320 21399705
TCONS_00004014 False 2500 processed_transcript 0.36 10 21397367 21404971
TCONS_00004015 True 541 processed_transcript 0.40 8 21399715 21402166

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_002075 BX004886.1 coding upstream 160642 21236564 ~ 21236678 (+)
XLOC_002074 NA coding upstream 189120 21179484 ~ 21208200 (+)
XLOC_002073 NA coding upstream 290610 21103921 ~ 21106710 (+)
XLOC_002072 NA coding upstream 658644 20731614 ~ 20738676 (+)
XLOC_002071 BX548043.1 coding upstream 713170 20684036 ~ 20684150 (+)
XLOC_002078 etf1b coding downstream 29678 21434649 ~ 21470593 (+)
XLOC_002079 BX957322.3 coding downstream 106524 21511495 ~ 21521507 (+)
XLOC_002080 BX957322.1 coding downstream 117574 21522545 ~ 21530675 (+)
XLOC_002081 NA coding downstream 137550 21542521 ~ 21543562 (+)
XLOC_002082 pcdh1a6 coding downstream 154634 21559605 ~ 21649172 (+)
XLOC_002085 CT737184.1 non-coding downstream 265860 21670831 ~ 21674458 (+)
XLOC_002088 NA non-coding downstream 340291 21745262 ~ 21745505 (+)
XLOC_002091 NA non-coding downstream 501181 21906152 ~ 21906377 (+)
XLOC_002092 NA non-coding downstream 509664 21914635 ~ 21944085 (+)

Expression


Co-expression Network