G105220


Basic Information

Item Value
gene id G105220
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 1333986 ~ 1342335 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU118548
gccctctctctctctctctctctctctctccctcccccgccctctacctccctccccctctctctctctctgtgttcccgtGAGTCACTCCTCTTTAAAACTGTTCAGTGTGACTGCAGGCCAAGATTCCACAGTATAAGGAACTGTAAAATCTCACAGAGCGACCGACTGACTGGAATAAAGGCACAAGACATAtttcccttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttctattatTATAATACAATAGCCAGTGACCAGAATGCTTTGGGACAGCTGATGAGGAGGATATTATTCATAATCAGGGGTTGTTAAAATAACCCAGGGATGGAAACAAGCTCAGAAAACCTTGAACAACAGTTTAACACAGACAGATATTTTCAACACACCGTGAATTCATGAATTATATCCTTATCTCTGAATCACGTTGAATTACAGGCGACTTTTAGAGAGTGAAAGTAATTCTGACAGCTGcccccaaaaaacaaaaaaacacacattatTATAAACTTGTTTTTGTGGCTTCCCTTCTCaatgttgactacacttcccttgtctatgttgactacacttcccttctcaatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacattgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctataTTGACTACGCTTCCCTTCTCTATGTTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgctTCCCTTCTCTAGgctgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctatgcttcccttctctatgttgactacgtttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacatttcccttctctatgttgactacgtttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgt
>TU118550
gccctctctctctctctctctctctctctccctcccccgccctctacctccctccccctctctctctctctgtgttcccgtGAGTCACTCCTCTTTAAAACTGTTCAGTGTGACTGCAGGCCAAGATTCCACAGTATAAGGAACTGTAAAATCTCACAGAGCGACCGACTGACTGGAATAAAGGCACAAGACATAtttcccttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttctattatTATAATACAATAGCCAGTGACCAGAATGCTTTGGGACAGCTGATGAGGAGGATATTATTCATAATCAGGGGTTGTTAAAATAACCCAGGGATGGAAACAAGCTCAGAAAACCTTGAACAACAGTTTAACACAGACAGATATTTTCAACACACCGTGAATTCATGAATTATATCCTTATCTCTGAATCACGTTGAATTACAGGCGACTTTTAGAGAGTGAAAGTAATTCTGACAGCTGcccccaaaaaacaaaaaaacacacattatTATAAACTTGTTTTTGTGGCTTCCCTTCTCaatgttgactacacttcccttgtctatgttgactacacttcccttctcaatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacgcTTCCCTTCTCaatgttgactacacttcccttctctacgcttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacccTTCCCTTctctacacttcccttctctacgttgactacgctccccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgcttccattctctacgttgactacccTTCCCTTCTCTACCCTTCCCTTctctacacttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctatgttgacaacgcttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacgcTTCTACGCTTCCCTTCTCTAAGTTGACTAtgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacgcTTCTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctaagTTGACTACGCTTCTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacattgactacacttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacccttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctataTTGACTACGCTTCCCTTCTCTATGTTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgctTCCCTTCTCTAGgctgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctatgcttcccttctctatgttgactacgtttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgcttccattctctacgttgactacccTTCCCTTCTCTACCCTTCCCTTctctacacttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctatgttgacTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccatctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgatgactacacttcccttttctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacccTTCCCTTCTCTACCCTTCCCTTctctacacttcccttctctacgttgactacgctccccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttcagtacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacccTTCCCTTCTCTAcccttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctacgttgactacgctccccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacattgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgctgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctatgcttcccttctctatgttgactacgtttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacatttcccttctctatgttgactacgtttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgt
>TU118552
gccctctctctctctctctctctctctctccctcccccgccctctacctccctccccctctctctctctctgtgttcccgtGAGTCACTCCTCTTTAAAACTGTTCAGTGTGACTGCAGGCCAAGATTCCACAGTATAAGGAACTGTAAAATCTCACAGAGCGACCGACTGACTGGAATAAAGGCACAAGACATAtttcccttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttctattatTATAATACAATAGCCAGTGACCAGAATGCTTTGGGACAGCTGATGAGGAGGATATTATTCATAATCAGGGGTTGTTAAAATAACCCAGGGATGGAAACAAGCTCAGAAAACCTTGAACAACAGTTTAACACAGACAGATATTTTCAACACACCGTGAATTCATGAATTATATCCTTATCTCTGAATCACGTTGAATTACAGGCGACTTTTAGAGAGTGAAAGTAATTCTGACAGCTGcccccaaaaaacaaaaaaacacacattatTATAAACTTGTTTTTGTGGCTTCCCTTCTCaatgttgactacacttcccttgtctatgttgactacacttcccttctcaatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacgcTTCCCTTCTCaatgttgactacacttcccttctctacgcttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacccTTCCCTTctctacacttcccttctctacgttgactacgctccccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgcttccattctctacgttgactacccTTCCCTTCTCTACCCTTCCCTTctctacacttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctatgttgacaacgcttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacgcTTCTACGCTTCCCTTCTCTAAGTTGACTAtgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacgcTTCTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctaagTTGACTACGCTTCTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacattgactacacttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacccttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctataTTGACTACGCTTCCCTTCTCTATGTTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcTTCCCTTCTCTAGGCTGACTacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgctTCCCTTCTCTAGgctgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctatgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacccTTCCCTTCTCTAcccttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctacgttgactacgctccccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacattgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgctgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacgcttcccttctctatgcttcccttctctatgttgactacgtttcccttctctacgttgactacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgttgactacatttcccttctctatgttgactacgtttcccttctctatgttgactacacttcccttctctacgcttcccttctctacgttgactacacttcccttctctatgt

Function

NR:

description
PREDICTED: S-antigen protein-like, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU118548 False 2257 TUCP 0.42 3 1333986 1342335
TU118550 False 5446 TUCP 0.45 5 1333986 1342335
TU118552 True 4747 TUCP 0.45 5 1333986 1342335

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118937319 NA coding downstream 17741 1314565 ~ 1316245 (-)
azi2 azi2 coding downstream 428568 879818 ~ 905418 (-)
eomesb eomesb coding downstream 520796 806150 ~ 813190 (-)
LOC110516483 LOC106573240 coding downstream 543115 727654 ~ 790871 (-)
LOC118937315 NA coding downstream 657474 672497 ~ 676512 (-)
LOC110515934 gadl1 coding upstream 84916 1427251 ~ 1457133 (-)
LOC110515405 LOC106590999 coding upstream 231067 1573402 ~ 1683489 (-)
kiaa1143 k1143 coding upstream 360616 1702951 ~ 1704863 (-)
zdhhc3a zdhhc3 coding upstream 367181 1709516 ~ 1732333 (-)
nrsn1 nrsn1 coding upstream 578675 1921010 ~ 1925939 (-)
G105200 NA non-coding downstream 29243 1304512 ~ 1304743 (-)
G105197 NA non-coding downstream 35340 1298370 ~ 1298646 (-)
G104898 NA non-coding downstream 55820 1277656 ~ 1278166 (-)
G104892 NA non-coding downstream 68557 1264427 ~ 1265429 (-)
G105230 NA non-coding upstream 21418 1363753 ~ 1376441 (-)
G105231 NA non-coding upstream 27626 1369961 ~ 1371674 (-)
G105205 NA non-coding upstream 34748 1377083 ~ 1390929 (-)
G105244 NA non-coding upstream 56138 1398473 ~ 1402640 (-)
G105257 NA non-coding upstream 93855 1436190 ~ 1438620 (-)
G105285 NA other upstream 198395 1540730 ~ 1541706 (-)
G105340 NA other upstream 298932 1641267 ~ 1641732 (-)
G105427 NA other upstream 570257 1912592 ~ 1917188 (-)
G105428 NA other upstream 575016 1917351 ~ 1918027 (-)

Expression


Co-expression Network