XLOC_020826 (si:dkey-19a16.7)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_020826
gene name si:dkey-19a16.7
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 6487048 ~ 6499077 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00041036
ATGTTTGGAAGCTTTGTCACACGATGTCTATTGTGTGTTTTTCTCTTGAATGGTCTGTCTTTTACCTCAGACCCGTTATTAGTGAAGGAAGGACAATCTGTCACTTTATGCTCTAATATTAATCTAGACCAAAATGATATTAAAATTATGTGGTATTTTGATGATGTGCGCATTGCTGACATCAATGCAGTTAATAACGGTAAAACCTGTTTAAATGATCAGTGTAAAACGAGATTTAGTGACAGACTGAAGCTGCATCAACAGACTGGATCTCTAATAATCACAAACACCAGAACCACAGACTCTGGAGATTATAAATTGATGATCACAGGAAACGACAACTACAGTGAAAAGATCTTCAGTGTTTCTGTCAGTGGTGGGGCTGGTAATGGCTTAGATGAAGTGTTTGTGATGGAGGGGGATTCAGTCACTCTACTTGCTGATGTAAGAGCCGACCATGACAGAAGTGTGTGGTATTATAATGAGATTCGCCTCGCTAAGATCAATGGAGGTCAGAGTAGCATCTGTACAGATTATCAGTGTAAAAAGGGATTTGGTGACAGACTGAAGCTAGATAATCAGACCGCATCTCTGACCATCATGAACATCAGAGAAACAGACGCTGGACTTTATAAATTGATAAAACGCAACAGTGACAAAATcttcagtgttgttgtttgtgGTGTTCCTGGTACTCAGGATCAAATTAAGAAAAATCTAGTGAGGGATGGAGAATCCGTCACTATAAATCCTGACAGGTCTTCAGCTGCTGTTGCTCGTATACATTTTGttggtgctgctgctgctgctgtcctGCTGCTTGTGGCTGTTGTGATCATCATTGTCAAATGGAGGAAGACGCGGCCATATTCGGTAAAATAAACTGAATTGCTACATGATACTACTAAAAGCAGGGACTATGGATCTAGTTTTGTGTGATAgtctataaatacatataattaaatataaatgtaaaatttaaataattgtaatataaatTTAACTTTAAAGCTGTATATATTGGCAGTGTTAGGATTAATGTGTGAAGGTAATGTGAAATACTTACTGCTTTTTAAGGACTGTAACTGTTAAAGTAACACACTTTTctattttcaggaaaataagaGTAAAGCCATATATTGTCAGCACTTTTCGCAATGCTGTACAACAGTCCTTTATGGCTAAGCTTGAACATCAATAATTTTTTAATCATCAATAAAGCATGTCATCActaaaacatataaatacaatCCATACTCTTATATAGTGGATAAAAATTGATTTAAAGAGTtggtatttttattagtatttaaaaaatatgtagaaTTGGTAaattcaaaagaaaatgtttttttcaatagcCACATTTCCACTTTCAGGCCAGTGccagccagggcttttatcgggctggGCCGGGCTAATCGCCTgtgaggttgagcagtgaggccggaGTCATGTCGCGTTTctactgtcgggctagtagctcgcagtgtgtcacgcaaaccctgcccccagaacatcccccgaatgtCACGCAACCAGCCCACTTCagcaggaatcaggcagataaagcacatcatcttgaaaccattcaaatgaagctgttagcagaccactgtaatccagaAACATGGGTCCACTCGCCAGTGGTGCTCTCATCAcaggaaaatggaaacaaaattTCATTGTGACACATTTATAAATGCTGCATTACAGCAAAcgctgacgacccatgtctccaaactgTTTTAATTACGGTTGTTAACACAAGGTtgtgtctctctgccgtctgaacacagTAACGGGTAAAaagagtcttcgaagctatcatgcatattaatgaagtggcacctcattcacaatagagcacgctgattaaTTTAAACCAAGTCTTTTTCATGAAATAAGGATAAACTCAAAAGACGTCACGTTGTACTGACCGGTACAGACATTcagtctccacgctggaatttacacaatgatctcctTGCCGTGATGTAGcttgaaattttatttttaaaccggaagaatttgttcgaaataacacaaaaatagcaaccaatttttactttttagtgagatatgtgtgtcctaatagtgtttttagcagcgtgggacacacaaatgactgtcaacatcttaaaacatgtgtttttgtgtttcatgaccctttaaaatctGAGATAGAATTTGAGCTTGAAATGAATGGTTTAGTTAAAATAACACCGAGATATTCACTCTGCTTTTCTTTAAAATCACTaatccatttttttttgttactatggaagtgaataagCAGtcatatttgcttgttttttaccTTCTGTGAATCTGTTTTCTTACAGGGAGCCATCTCTGCTGTGGAAAGTGAGAGTTCATGACAGTCACTGACAGTGTAATCAAGAACAAGGTCCAATCACAATTCTACCCCTCATGGTTCGTTTACACCAGATGGTGATGATGAAGCATCTAGAATAAGTGATTTacttgttaagtcaatgcaaagacttgATTAGACATCCTTTGGTGAGTTTCGAGAGATTAAAGCAATTCGAGCACATGATATAAAGTGAATTAAGCTTAACCAAGTgggtgctgcacactggtggtggtgtggagagacccctctcctgattgtgaagcgcttttggtgtttggccatacacaataaatgcgctatataaattcaaattattaaaaaaatctaaacttttgTGGACATATACATATGCAATAACCAATAAGGAGCTTGCTCTAGTAGGGGTGTGATATTGATTTGCACCTGTAGTTGGTGTCATGAAGGGAAATCTTCCTGCTGACAtgggacaacagctcatcaaactgggacCGGCTGAGTCGGAAGTACAGCTTAAAGCATACGTCAGCCAGGCACATCTTCTGGAGGAGTTGGATCCAGACAGAGCACTAAACAAATGTATGCcattttcagccttcctaaagcacataaagtaCAGCTACTCTCTCAAAAAAATTCATCTCAGTCATTTAGTAATGAAACTGGAGTctccaggcagacagaagcccctaCCGTGACGCTAATCACAATCTAGTGTGAGGTGAATTTGACACATGAATGTAGCAAGTGCAAAATAGCGCACTCTATTTGCGTAAGCCGCATCTAGTGAGAGCGCCCCATTAGCATTTCTACTTCTCCCTCAGATTGCTCACtcacatgaaggggtaggggtcTCCCAATTCTTTTTTGCTTGAAGGGTTACGGTTAAGGCCATATAGCCCTAAgatttttcagaaccacactACAAACGAAGGCATATGAGACATTTCTATGAATACACCTGCAAACATGACACACAAATGTTGAAAAAAGGCATTAATaaggttttttaaaataaacatatatctCCTTTCTTACATTCATACCAGCATTAATGTGTCCCAGTCATTATCTtagaagaaacatttaaaaaataataaataaagctaaGCTCTGTAAACAATAGTGGCTTTTACTAAAATAGACACACAAATGAACACACTGCTAGCAATGAAACAAATAATGCATGATgtttttagtatatttatagttattaaaCTATTGCAGTTACAAGTTAGTAGGACATCTCTGTTTGCATTACTGGTTTGACATCTACCATTGTATCCTATTTATCCATTTACAACCTATTGAGAGTTATAATTTACCATAAGTTAATTATGACCAGAGATTCGTTTTTTGCCAATGTGGCTCATACTTCAACACACGAGCCCTCCACAAATATGCAGTTGTGAATTTGAAAACTGCTGTTTTACTCTAAATAATAATCTGGGTGCTTTATGGAAGTCTGCCCTTCATATTCATGTATAGCTTAATGTTTAAATTTTGTTTATAAGGGAAATGTTGATTCAGAAGCAATGAATGCAGATTCAGATTCTTCATTTAGAATGCAGATGCACTGCCTGAATATTGAATGCTGTTAGTTGCTAGTATTGTCACTCTGCTGCTATACGTAAAAAAATGTGCCTTAAACACTAATCTCTGAGCGtgttttcattactttttttattttttagtttacatTCAATCTCATGGAGAAGCACAAATGTTACCCTGGAGCACATGACTAGTTTGAACATGCAAGGATATATTGATTCTAGCAataaccaaaaatacattgtacattattttataaaaaaaaaaaaaaagtaaagtccATGAAGCTATATTGTTAATTttctacttttaaatatattataattttttgataaatattttcaAACTGTTGTAGCTCTGCCAAATATCCCACCCTATCAAACCATCAATCAAGCCAAAAATGCTTCTAGATGATACATAAATCTGATATGATTAATGTACGCTTGTGGTCACTACAAAGACCATGgtcacaaatactgtacatctaAGATGAAAATTGGCAGAATCTATggaaaataaagcagtttttgtgttttaaatacaGAATAATTCAGCATACGTTTATGTATATGCACTCAATTGTATTGTCATTTGTGTTCCTCAGTCTTTTCGTTTGTTTTTGTGACTGCCAATTGTGCCAATCgatttaatatgtaaattaacgaatataagtgcttctatttaaataaaagtgCCTGTGCAATTGTAAACTTATGTATGTCGTTCTTATTATTTAGGAATTCTCCACtgatgaacacacaaacacacacacacatccaacgCAGAATGGAAAAACCTTGCTGTTCTCCATTCTCAAAAAGAAATGTTTGCAACTGAAGAAAATCAGAGATAGTATGCTTGATAATTAATTCTTTTAATGATACTGCAaacttttattaatacattttgttatCATATTGATTCACAGTGTTGGGGTAACTTGCCCCAACACTGCTGATCCCTGACTGCTGCCACCAGCATTGTgatctcatttatttttatattcctCTACAACGTTGAAGTGAATACTGATGCATCCCAATACTATtttgtatatttctatattatattcttctatatttaacatttt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>TCONS_00041037
GATGTCTATTGTGTGTTTTTCTCTTGAATGGTCTGTCTTTTACCTCAGACCCGTTATTAGTGAAGGAAGGACAATCTGTCACTTTATGCTCTAATATTAATCTAGACCAAAATGATATTAAAATTATGTGGTATTTTGATGATGTGCGCATTGCTGACATCAATGCAGTTAATAACGGTAAAACCTGTTTAAATGATCAGTGTAAAACGAGATTTAGTGACAGACTGAAGCTGCATCAACAGACTGGATCTCTAATAATCACAAACACCAGAACCACAGACTCTGGAGATTATAAATTGATGATCACAGGAAACGACAACTACAGTGAAAAGATCTTCAGTGTTTCTGTCAGTGGTGGGGCTGGTAATGGCTTAGATGAAGTGTTTGTGATGGAGGGGGATTCAGTCACTCTACTTGCTGATGTAAGAGCCGACCATGACAGAAGTGTGTGGTATTATAATGAGATTCGCCTCGCTAAGATCAATGGAGGTCAGAGTAGCATCTGTACAGATTATCAGTGTAAAAAGGGATTTGGTGACAGACTGAAGCTAGATAATCAGACCGCATCTCTGACCATCATGAACATCAGAGAAACAGACGCTGGACTTTATAAATTGATAAAACGCAACAGTGACAAAATcttcagtgttgttgtttgtgGTGTTCCTGGTACTCAGGATCAAATTAAGAAAAATCTAGTGAGGGATGGAGAATCCGTCACTATAAATCCTGACAGGTCTTCAGCTGCTGTTGCTCGTATACATTTTGttggtgctgctgctgctgctgtcctGCTGCTTGTGGCTGTTGTGATCATCATTGTCAAATGGAGGAAGACGCGGCCATATTCGGGAGCCATCTCTGCTGTGGAAAGTGAGAGTTCATGACAGTCACTGACAGTGTAATCAAGAACAAGGTCCAATCACAATTCTACCCCTCATGGTTCGTTTACACCAGATGGTGATGATGAAGCATCTAGAATAAGTGATTTacttgttaagtcaatgcaaagacttgATTAGACATCCTTTGGTGAGTTTCGAGAGATTAAAGCAATTCGAGCACATGATATAAAGTGAATTAAGCTTAACCAAGTgggtgctgcacactggtggtggtgtggagagacccctctcctgattgtgaagcgcttttggtgtttggccatacacaataaatgcgctatataaattcaaattattaaaaaaatctaaacttttgTGGACATATACATATGCAATAACCAATAAGGAGCTTGCTCTAGTAGGGGTGTGATATTGATTTGCACCTGTAGTTGGTGTCATGAAGGGAAATCTTCCTGCTGACAtgggacaacagctcatcaaactgggacCGGCTGAGTCGGAAGTACAGCTTAAAGCATACGTCAGCCAGGCACATCTTCTGGAGGAGTTGGATCCAGACAGAGCACTAAACAAATGTATGCcattttcagccttcctaaagcacataaagtaCAGCTACTCTCTCAAAAAAATTCATCTCAGTCATTTAGTAATGAAACTGGAGTctccaggcagacagaagcccctaCCGTGACGCTAATCACAATCTAGTGTGAGGTGAATTTGACACATGAATGTAGCAAGTGCAAAATAGCGCACTCTATTTGCGTAAGCCGCATCTAGTGAGAGCGCCCCATTAGCATTTCTACTTCTCCCTCAGATTGCTCACtcacatgaaggggtaggggtcTCCCAATTCTTTTTTGCTTGAAGGGTTACGGTTAAGGCCATATAGCCCTAAgatttttcagaaccacactACAAACGAAGGCATATGAGACATTTCTATGAATACACCTGCAAACATGACACACAAATGTTGAAAAAAGGCATTAATaaggttttttaaaataaacatatatctCCTTTCTTACATTCATACCAGCATTAATGTGTCCCAGTCATTATCTtagaagaaacatttaaaaaataataaataaagctaaGCTCTGTAAACAATAGTGGCTTTTACTAAAATAGACACACAAATGAACACACTGCTAGCAATGAAACAAATAATGCATGATgtttttagtatatttatagttattaaaCTATTGCAGTTACAAGTTAGTAGGACATCTCTGTTTGCATTACTGGTTTGACATCTACCATTGTATCCTATTTATCCATTTACAACCTATTGAGAGTTATAATTTACCATAAGTTAATTATGACCAGAGATTCGTTTTTTGCCAATGTGGCTCATACTTCAACACACGAGCCCTCCACAAATATGCAGTTGTGAATTTGAAAACTGCTGTTTTACTCTAAATAATAATCTGGGTGCTTTATGGAAGTCTGCCCTTCATATTCATGTATAGCTTAATGTTTAAATTTTGTTTATAAGGGAAATGTTGATTCAGAAGCAATGAATGCAGATTCAGATTCTTCATTTAGAATGCAGATGCACTGCCTGAATATTGAATGCTGTTAGTTGCTAGTATTGTCACTCTGCTGCTATACGTAAAAAAATGTGCCTTAAACACTAATCTCTGAGCGtgttttcattactttttttattttttagtttacatTCAATCTCATGGAGAAGCACAAATGTTACCCTGGAGCACATGACTAGTTTGAACATGCAAGGATATATTGATTCTAGCAataaccaaaaatacattgtacattattttataaaaaaaaaaaaaaagtaaagtccATGAAGCTATATTGTTAATTttctacttttaaatatattataattttttgataaatattttcaAACTGTTGTAGCTCTGCCAAATATCCCACCCTATCAAACCATCAATCAAGCCAAAAATGCTTCTAGATGATACATAAATCTGATATGATTAATGTACGCTTGTGGTCACTACAAAGACCATGgtcacaaatactgtacatctaAGATGAAAATTGGCAGAATCTATggaaaataaagcagtttttgtgttttaaatacaGAATAATTCAGCATACGTTTATGTATATGCACTCAATTGTATTGTCATTTGTGTTCCTCAGTCTTTTCGTTTGTTTTTGTGACTGCCAATTGTGCCAATCgatttaatatgtaaattaacgaatataagtgcttctatttaaataaaagtgCCTGTGCAATTGTAAA

Function

symbol description
si:dkey-19a16.7 Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane.

GO:

id name namespace
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-060503-903 Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane.

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000071644

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00041036 False 5131 mRNA 0.36 5 6487048 6499077
TCONS_00041037 True 3126 mRNA 0.37 6 6487559 6499055

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_020825 CR926879.1 coding downstream 10790 6476142 ~ 6476258 (-)
XLOC_020824 zgc:172133 coding downstream 21988 6456003 ~ 6465060 (-)
XLOC_020823 si:dkey-19a16.12 coding downstream 41187 6434672 ~ 6445861 (-)
XLOC_020822 zgc:171699 coding downstream 66809 6407445 ~ 6420239 (-)
XLOC_020820 si:rp71-1i20.2 coding downstream 82138 6393227 ~ 6404910 (-)
XLOC_020827 CR352226.4 coding upstream 16320 6515397 ~ 6520026 (-)
XLOC_020828 CR352226.5 coding upstream 28337 6527414 ~ 6529377 (-)
XLOC_020829 zgc:171490 coding upstream 47620 6546697 ~ 6562618 (-)
XLOC_020830 NA coding upstream 64569 6563646 ~ 6565961 (-)
XLOC_020831 CR352226.2 coding upstream 88473 6587550 ~ 6601587 (-)
XLOC_020821 NA non-coding downstream 87331 6397413 ~ 6399717 (-)
XLOC_020818 AL928685.2 non-coding downstream 170069 6300311 ~ 6316979 (-)
XLOC_020816 AL928685.1 non-coding downstream 204859 6273581 ~ 6282189 (-)
XLOC_020815 NA non-coding downstream 240309 6243742 ~ 6246739 (-)
XLOC_020833 CR352226.3 non-coding upstream 162635 6661712 ~ 6662906 (-)

Expression


Co-expression Network