G109020


Basic Information

Item Value
gene id G109020
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 6633078 ~ 6633913 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU124055
tgtctctctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCATTACCAGTACTATGTGTCTCTCTAGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACTAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACcatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTTTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCATTACCAGTACcatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTTTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGTACAGAGTATTA
>TU124056
tgtctctctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCATTACCAGTACTATGTGTCTCTCTAGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACcatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTTTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCATTACCAGTACcatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTTTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGTACAGAGTATTA
>TU124057
tgtctctctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCATTACCAGTACTATGTGTCTCTCTAGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACTAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACTAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTTTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGTACAGAGTATTA
>TU124060
tgtctctctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCATTACCAGTACTATGTGTCTCTCTAGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACTAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACTAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACcatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTTtggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTTTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGTACAGAGTATTA
>TU124062
tgtctctctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCATTACCAGTACcatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTTTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGTACAGAGTATTA
>TU124063
tgtctctctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCATTACCAGTACTATGTGTCTCTCTAGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACTAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACTAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACcatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTTTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACcatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTTTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGTACAGAGTATTA
>TU124065
tgtctctctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCATTACCAGTACTATGTGTCTCTCTAGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACTAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACTAGTactatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACcatgtgtctgtctggctgttcTTATCGTTACCAGTACCATGTGTCTCTTTGGCTGTTCTTATCGTTACCAGTACTATGTGTCTCTCTGTACAGAGTATTA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU124055 False 799 TUCP 0.43 2 6633078 6633913
TU124056 False 688 TUCP 0.43 2 6633078 6633913
TU124057 False 651 TUCP 0.42 2 6633078 6633913
TU124060 False 725 TUCP 0.43 2 6633078 6633913
TU124062 False 429 TUCP 0.43 2 6633078 6633913
TU124063 False 799 TUCP 0.43 2 6633078 6633913
TU124065 True 614 TUCP 0.39 2 6633078 6633913

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
zgc:158766 LOC106590969 coding upstream 3609 6545368 ~ 6629469 (+)
LOC118937387 NA coding upstream 11482 6619110 ~ 6621596 (+)
nkd2b LOC106574162 coding upstream 133380 6402676 ~ 6499698 (+)
trip13 LOC106590995 coding upstream 243290 6378373 ~ 6389788 (+)
cep72 LOC106573558 coding upstream 320479 6286558 ~ 6312599 (+)
LOC110505995 LOC106573077 coding downstream 11303 6645216 ~ 6649794 (+)
ptdss1a LOC106595791 coding downstream 19289 6653202 ~ 6684816 (+)
LOC110505984 LOC106574154 coding downstream 51987 6685900 ~ 6688012 (+)
kif13a kif13a coding downstream 54978 6688891 ~ 6839464 (+)
LOC110506079 NA coding downstream 207119 6841032 ~ 6842093 (+)
G109019 NA non-coding upstream 7065 6624956 ~ 6626013 (+)
G109018 NA non-coding upstream 8867 6623670 ~ 6624211 (+)
G108991 NA non-coding upstream 9495 6556041 ~ 6623583 (+)
G109015 NA non-coding upstream 32912 6598923 ~ 6600166 (+)
G109011 NA non-coding upstream 44450 6588164 ~ 6588628 (+)
G109030 NA non-coding downstream 29356 6663269 ~ 6664730 (+)
G109032 NA non-coding downstream 36785 6670698 ~ 6672100 (+)
G108930 NA non-coding downstream 75211 6709124 ~ 6753929 (+)
G108934 NA non-coding downstream 158098 6792011 ~ 6793179 (+)
G108874 LOC106573552 other upstream 347138 6282071 ~ 6285940 (+)
G108805 LOC106594197 other upstream 433737 6151712 ~ 6199341 (+)
G108775 LOC106606109 other upstream 574743 6056996 ~ 6058335 (+)
LOC110505679 LOC106579367 other upstream 630884 5976200 ~ 6002265 (+)
LOC110505637 LOC106573538 other upstream 674265 5953886 ~ 5958813 (+)
rbm24b LOC106596654 other downstream 222173 6855864 ~ 6868976 (+)
malsu1 malsu1 other downstream 274634 6908511 ~ 6911256 (+)
LOC110535156 LOC106606167 other downstream 307603 6941465 ~ 6944043 (+)
G109821 NA other downstream 501334 7135247 ~ 7140979 (+)
pde11al LOC106573285 other downstream 669115 7282430 ~ 7304709 (+)

Expression


Co-expression Network