G109821


Basic Information

Item Value
gene id G109821
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 7135247 ~ 7140979 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU125129
GCACGAAACACACGTGCCCTTCTGAAACATCTCCGTTTGTTTACAGTAATATAGTTCACCCAGTAAGGCATTAGACAGGTGCAGAATAAATATTGACACGTACACCTTCTCAACGGTGTTACAAGTACCATGGAATCTCATCTCAGAGGTAGAAAACCGCGTGTATTAAGACAGTGTTGTACAGTCAACAGCTGTGTTAATGTGAACTAGTAGCTAAGTTAGCGAGGATCGGCAATACAAAAAGGGAAGGATTATTCCACAGTCTTTGCAGAACCCACAAGGCCAGTAATTCATTCATTAGTACCTTGTTGAAGTATACAGTATTTCCTATGTGTTCTATTCTGCACGACGAGACACCACAGGTGGAAAAACAGGACACCATTGTTGCATAATAGTCTCTGCATTCGAAGGGTATGCTCACTAAGACGCTACATTAATACACTACTCGGATAAATGTTGTCTATTAAGGCAATGAACTGGATAAACTCTCAAATGAAAACAACAATGAATTATAAAGCAGCAACATgcgtggggtgggggggggggtggacagtAGATAGACATGTGAAtgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggatagtagatggacatgttaatgatggatagtagatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatagatagtagatggacatgtgaatgatggaCAGTAGATGGACATGTGCAAGActgtacgtcccaaatggcaccctattccctttagcgTATGATGCACTACTTGGGCccacaggactctggtcaaaagcagtacactatgtagggaatagggtgccatttgaggcgTAACCAATGAGACGGATAGAGCAGCAGGACTCCAGCCCCCAGAACCAGCCTGGGTCACAGTACAGACAGGAAGTCCAAACAGGGTCGTGTTCATaagtgcacaccgtagcaaaacgttttgcaactgaaAACCAAAAAATTAAGTTTCTTATTGGACTGGAAGTTGCAGTCTGTCTTCTTCCGTTTGGTACCTTATGAACACacgttcaggtagtccctccctgtttcagtcctgggcctaatgaacatgacccaggtgtgTGACCAGTGGCCACAAATGTCACACTAAGGTCACCACAACACAGGACAGTCCAGGTGGTGATAGCCTGGTTCCCTCCTCAGGTCACCACAACATAGGACAGTCCAGGTGGTGATAGCCTGGTTCCCTCCTCAGGTCACCACAACACAGGACAGTCCAGGTGGGCAAAGCCTGGATCCCTTCTCAGGTCCCAGTAAGTGTTGCTGCTAACCCAGGTGTCGTCCTTTGATTTCCTGTGGACAACAGAAAGACATATTCTTTACTTGAACTGAATAATGAAATACCTTCTaaaaagaatcaacaacaaaaagaTCATGATGCAAAACAcagcctcatcatcatcatcatcagcctcatcatcatcatcagcctcATCATCAGCCTCATCATCATCAGCCTCATCATCATcagcctcatcatcatcatcagcctcctcatcatcatcagccTCGTCATCATCATCAGCCTCGTCATCATCAGCCTCGTCATCATCATcagcctcatcatcatcatcagcctcatcatcatcatcatcagcctcatcatcatcatcagcctcgtcatcatcatcatcagcctcctcatcatcatcatcaggttTTTGCTTTTTATTAGAAGTGCTCTTTCTTGAAACCTTGACTGTTGACATTTTTGTGGATAAACAGTGGACTGatgaacaaaatacaaaacatgtGACCGTTTTTGAACTATGCCTTCAACACTCACAAGCCTGCCAACAGAAGTGAATGGAAACTGAGAACCAGCTACTGAAAATGGAGAAACCTAATGTTCCCATGGACATGTGACATGACTGGTGTGTCTGTTGTGGTACTTGTACATCTATATAGGTACATCCATATTgtgttataaactgggtggttcgagccctgaatgatgattggctgaaagccgtggtaaaTGAGACCGTAtatcacgggtatgacaaaacaattatttttactgttctaattacgttggtaaccagtttataatagcaataaggcacctcgggggtttgtggtatatggccaatataccacggctaagggccgtATCCAGGCACGTTgtgtcatgcataagaacagcccatagccgtggtatattggccatataccacacctcctccttcctgcCTTATTGCTTTAATAAACCCTGTGGGAATAAATGCAGGTGGAGTTTAGCTGTGGAGATGAATTAGAAC
>TU125130
GCACGAAACACACGTGCCCTTCTGAAACATCTCCGTTTGTTTACAGTAATATAGTTCACCCAGTAAGGCATTAGACAGGTGCAGAATAAATATTGACACGTACACCTTCTCAACGGTGTTACAAGTACCATGGAATCTCATCTCAGAGGTAGAAAACCGCGTGTATTAAGACAGTGTTGTACAGTCAACAGCTGTGTTAATGTGAACTAGTAGCTAAGTTAGCGAGGATCGGCAATACAAAAAGGGAAGGATTATTCCACAGTCTTTGCAGAACCCACAAGGCCAGTAATTCATTCATTAGTACCTTGTTGAAGTATACAGTATTTCCTATGTGTTCTATTCTGCACGACGAGACACCACAGGTGGAAAAACAGGACACCATTGTTGCATAATAGTCTCTGCATTCGAAGGGTATGCTCACTAAGACGCTACATTAATACACTACTCGGATAAATGTTGTCTATTAAGGCAATGAACTGGATAAACTCTCAAATGAAAACAACAATGAATTATAAAGCAGCAACATgcgtggggtgggggggggggtggacagtAGATAGACATGTGAAtgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggatagtagatggacatgttaatgatggatagtagatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatagatagtagatggacatgtgaatgatggaCAGTAGATGGACATGTGCAAGActgtacgtcccaaatggcaccctattccctttagcgTATGATGCACTACTTGGGCccacaggactctggtcaaaagcagtacactatgtagggaatagggtgccatttgaggcgTAACCAATGAGACGGATAGAGCAGCAGGACTCCAGCCCCCAGAACCAGCCTGGGTCACAGTACAGACAGGAAGTCCAAACAGGGTCGTGTTCATaagtgcacaccgtagcaaaacgttttgcaactgaaAACCAAAAAATTAAGTTTCTTATTGGACTGGAAGTTGCAGTCTGTCTTCTTCCGTTTGGTACCTTATGAACACacgttcaggtagtccctccctgtttcagtcctgggcctaatgaacatgacccaggtgtgTGACCAGTGGCCACAAATGTCACACTAAGGTCACCACAACACAGGACAGTCCAGGTGGTGATAGCCTGGTTCCCTCCTCAGGTCACAACAACACAGGacagtccaggtgggaaaagccTTGATCCCTTCTCAGGTCACCACAACACAGGACAGTCCAGGTGGGCAAAGCCTGGATCCCTTCTCAGGTCCCAGTAAGTGTTGCTGCTAACCCAGGTGTCGTCCTTTGATTTCCTGTGGACAACAGAAAGACATATTCTTTACTTGAACTGAATAATGAAATACCTTCTaaaaagaatcaacaacaaaaagaTCATGATGCAAAACAcagcctcatcatcatcatcatcagcctcatcatcatcatcagcctcATCATCAGCCTCATCATCATCAGCCTCATCATCATcagcctcatcatcatcatcagcctcctcatcatcatcagccTCGTCATCATCATCAGCCTCGTCATCATCAGCCTCGTCATCATCATcagcctcatcatcatcatcagcctcatcatcatcatcatcagcctcatcatcatcatcagcctcgtcatcatcatcatcagcctcctcatcatcatcatcaggttTTTGCTTTTTATTAGAAGTGCTCTTTCTTGAAACCTTGACTGTTGACATTTTTGTGGATAAACAGTGGACTGatgaacaaaatacaaaacatgtGACCGTTTTTGAACTATGCCTTCAACACTCACAAGCCTGCCAACAGAAGTGAATGGAAACTGAGAACCAGCTACTGAAAATGGAGAAACCTAATGTTCCCATGGACATGTGACATGACTGGTGTGTCTGTTGTGGTACTTGTACATCTATATAGGTACATCCATATTgtgttataaactgggtggttcgagccctgaatgatgattggctgaaagccgtggtaaaTGAGACCGTAtatcacgggtatgacaaaacaattatttttactgttctaattacgttggtaaccagtttataatagcaataaggcacctcgggggtttgtggtatatggccaatataccacggctaagggccgtATCCAGGCACGTTgtgtcatgcataagaacagcccatagccgtggtatattggccatataccacacctcctccttcctgcCTTATTGCTTTAATAAACCCTGTGGGAATAAATGCAGGTGGAGTTTAGCTGTGGAGATGAATTAGAAC
>TU125128
AATGATGGACagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacagtagatggacatgtgcatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgcatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacagtagatggacatgtgcatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatagatagtagatggacatgtgaatgatggaCAGTAGATGGACATGTGCAAGActgtacgtcccaaatggcaccctattccctttagcgTATGATGCACTACTTGGGCccacaggactctggtcaaaagcagtacactatgtagggaatagggtgccatttgaggcgTAACCAATGAGACGGATAGAGCAGCAGGACTCCAGCCCCCAGAACCAGCCTGGGTCACAGTACAGACAGGAAGTCCAAACAGGGTCGTGTTCATaagtgcacaccgtagcaaaacgttttgcaactgaaAACCAAAAAATTAAGTTTCTTATTGGACTGGAAGTTGCAGTCTGTCTTCTTCCGTTTGGTACCTTATGAACACacgttcaggtagtccctccctgtttcagtcctgggcctaatgaacatgacccaggtgtgTGACCAGTGGCCACAAATGTCACACTAAGGTCACCAGGACAGTCCAGGTGGTGATAGCCTGGTTCCCTCCTCAGGTCACCACAACACAGGACAGTCCAGGTGGGCAAAGCCTGGATCCCTTCTCAGGTCCCAGTAAGTGTTGCTGCTAACCCAGGTGTCGTCCTTTGATTTCCTGTGGACAACAGAAAGACATATTCTTTACTTGAACTGAATAATGAAATACCTTCTaaaaagaatcaacaacaaaaagaTCATGATGCAAAACAcagcctcatcatcatcatcatcagcctcatcatcatcatcagcctcATCATCAGCCTCATCATCATCAGCCtcatcatcatcatcagcctcctcatcatcatcatcaggttTTTGCTTTTTATTAGAAGTGCTCTTTCTTGAAACCTTGACTGTTGACATTTTTGTGGATAAACAGTGGACTGatgaacaaaatacaaaacatgtGACCGTTTTTGAACTATGCCTTCAACACTCACAAGCCTGCCAACAGAAGTGAATGGAAACTGAGAACCAGCTACTGAAAATGGAGAAACCTAATGTTCCCATGGACATGTGACATGACTGGTGTGTCTGTTGTGGTACTTGTACATCTATATAGGTACATCCATATTgtgttataaactgggtggttcgagccctgaatgatgattggctgaaagccgtggtaaaTGAGACCGTAtatcacgggtatgacaaaacaattatttttactgttctaattacgttggtaaccagtttataatagcaataaggcacctcgggggtttgtggtatatggccaatataccacggctaagggccgtATCCAGGCACGTTgtgtcatgcataagaacagcccatagccgtggtatattggccatataccacacctcctccttcctgcCTTATTGCTTTAATAAACCCTGTGGGAATAAATGCAGGTGGAGTTTAGCTGTGGAGATGAATTAGAAC
>TU125133
AATGATGGACagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacagtagatggacatgtgcatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgcatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacagtagatggacatgtgcatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggacagtagatggacatgtgaatgatggatagtagatggacatgtgaatgatggaCAGTAGATGGACATGTGCAAGActgtacgtcccaaatggcaccctattccctttagcgTATGATGCACTACTTGGGCccacaggactctggtcaaaagcagtacactatgtagggaatagggtgccatttgaggcgTAACCAATGAGACGGATAGAGCAGCAGGACTCCAGCCCCCAGAACCAGCCTGGGTCACAGTACAGACAGGAAGTCCAAACAGGGTCGTGTTCATaagtgcacaccgtagcaaaacgttttgcaactgaaAACCAAAAAATTAAGTTTCTTATTGGACTGGAAGTTGCAGTCTGTCTTCTTCCGTTTGGTACCTTATGAACACacgttcaggtagtccctccctgtttcagtcctgggcctaatgaacatgacccaggtgtgTGACCAGTGGCCACAAATGTCACACTAAGGTCACCACAACACAGGACAGTCCAGGTGGTGATAGCCTGGTTCCCTCCTCAGGTCACCACAACACAGGACAGTCCAGGTTGTGATAGCCTGGTTCCCTCCTCAGGTCACCACAACATAGGACAGTCCAGGTGGTGATAGCCTGGTTCCCTCCTCAGGTCACCACAACACAGGACAGTCCAGGTGGGCAAAGCCTGGATCCCTTCTCAGGTCCCAGTAAGTGTTGCTGCTAACCCAGGTGTCGTCCTTTGATTTCCTGTGGACAACAGAAAGACATATTCTTTACTTGAACTGAATAATGAAATACCTTCTaaaaagaatcaacaacaaaaagaTCATGATGCAAAACAcagcctcatcatcatcatcatcagcctcatcatcatcatcagcctcATCATCAGCCTCATCATCATCAGCCtcatcatcatcatcagcctcctcatcatcatcatcaggttTTTGCTTTTTATTAGAAGTGCTCTTTCTTGAAACCTTGACTGTTGACATTTTTGTGGATAAACAGTGGACTGatgaacaaaatacaaaacatgtGACCGTTTTTGAACTATGCCTTCAACACTCACAAGCCTGCCAACAGAAGTGAATGGAAACTGAGAACCAGCTACTGAAAATGGAGAAACCTAATGTTCCCATGGACATGTGACATGACTGGTGTGTCTGTTGTGGTACTTGTACATCTATATAGGTACATCCATATTgtgttataaactgggtggttcgagccctgaatgatgattggctgaaagccgtggtaaaTGAGACCGTAtatcacgggtatgacaaaacaattatttttactgttctaattacgttggtaaccagtttataatagcaataaggcacctcgggggtttgtggtatatggccaatataccacggctaagggccgtATCCAGGCACGTTgtgtcatgcataagaacagcccatagccgtggtatattggccatataccacacctcctccttcctgcCTTATTGCTTTAATAAACCCTGTGGGAATAAATGCAGGTGGAGTTTAGCTGTGGAGATGAATTAGAAC

Function

NR:

description
unnamed protein product, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU125129 False 3151 TUCP 0.43 4 7135247 7140979
TU125130 False 3151 TUCP 0.44 3 7135247 7140979
TU125128 False 2256 lncRNA 0.43 4 7138399 7140979
TU125133 True 2341 lncRNA 0.61 4 7138399 7140979

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110535004 LOC106596209 coding upstream 59322 7067283 ~ 7079077 (+)
LOC110535127 LOC106592104 coding upstream 59424 7030625 ~ 7078975 (+)
mpp6a LOC106594438 coding upstream 143684 6944265 ~ 6994715 (+)
LOC110535156 LOC106606167 coding upstream 194356 6941465 ~ 6944043 (+)
stk31 LOC106595692 coding upstream 199649 6912089 ~ 6938750 (+)
pde11al LOC106573285 coding downstream 141451 7282430 ~ 7304709 (+)
cbx3b LOC106573104 coding downstream 217926 7358905 ~ 7369148 (+)
snx10b LOC106593746 coding downstream 228364 7369343 ~ 7377095 (+)
tax1bp1b LOC106594183 coding downstream 355204 7496183 ~ 7531274 (+)
creb5b LOC106573409 coding downstream 474931 7615910 ~ 7706660 (+)
G109766 LOC106592104 non-coding upstream 8879 7116428 ~ 7129520 (+)
G109797 NA non-coding upstream 20404 7092426 ~ 7117995 (+)
G109761 NA non-coding upstream 30338 7089292 ~ 7108061 (+)
G109762 LOC106596760 non-coding upstream 33102 7104055 ~ 7105297 (+)
G109787 NA non-coding upstream 59001 7054449 ~ 7079398 (+)
G109823 NA non-coding downstream 210 7141189 ~ 7141711 (+)
G109828 NA non-coding downstream 5722 7146701 ~ 7148101 (+)
G109834 NA non-coding downstream 13266 7154245 ~ 7155162 (+)
G109842 NA non-coding downstream 23012 7163991 ~ 7165357 (+)
G109763 NA non-coding downstream 41174 7182153 ~ 7184712 (+)
malsu1 malsu1 other upstream 227194 6908511 ~ 6911256 (+)
rbm24b LOC106596654 other upstream 269423 6855864 ~ 6868976 (+)
G109020 NA other upstream 504486 6633078 ~ 6633913 (+)
G108874 LOC106573552 other upstream 852459 6282071 ~ 6285940 (+)
G110644 NA other downstream 757617 7898596 ~ 7935137 (+)
G110674 NA other downstream 932387 8073366 ~ 8103920 (+)
LOC110518388 LOC106598833 other downstream 1895825 8820359 ~ 9072449 (+)
G109764 LOC106592104 non-coding upstream 45024 6997217 ~ 7090223 (+)

Expression


Co-expression Network