G111716


Basic Information

Item Value
gene id G111716
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 9208013 ~ 9208962 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU127476
GCCTAGCTTTGTGTAGCTTAAGAAGACTGAGAATGTTGAGTGAAGGATAATGGGATGTCACAGTATGTTATGTCTATCTAgctataggtcctatgttactgtatgtctacctagttataggtcctatgttactgtatgtctacctagttataggtcctatgttatgtctatctagttataggtcctatgttactgtatgtctacctagttataggccctatgttactgtatgtctacctagttataggtcctatgttatgtctacctagttataggtcctatgttactgtatgtctacctagttataggtcctatgttactgtatgtctacctagttataggtcctatgttatgtctacctagttataggtcctatgttactgtatgtctacctagttataggtcctatgttatgtctacctagttataggtcctatgttactgtatgtctacctagttataggtcctatgttactgtatgtctacctagttataggtcctatgttactgtatgtctacctagttataggtcctatgttactgtatgtctacctagttataggtcctatattactgtatgtctacctagttataggtcctatgttatgtctacctagttataggtcctatattactgtatgtctacctagttatagttcctatgttactatatgtctacctagttataggtcctatgttatgtctacctagttataggtcctatgttactatatgtctacctagttataggtcctatgttatgtctacccagttataggtcctatgttactgtat

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU127476 True 795 lncRNA 0.36 2 9208013 9208962

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110506677 c4 coding downstream 66299 9116566 ~ 9141714 (-)
LOC110506642 LOC106606082 coding downstream 120093 9074773 ~ 9087920 (-)
LOC110514444 LOC108270036 coding downstream 388936 8804202 ~ 8819077 (-)
LOC110516599 LOC106606020 coding downstream 406010 8791636 ~ 8802003 (-)
LOC110519098 LOC106594466 coding downstream 425026 8769881 ~ 8782987 (-)
LOC110534043 LOC106606076 coding upstream 6421 9215383 ~ 9220273 (-)
LOC110510828 LOC106606088 coding upstream 36483 9245445 ~ 9284745 (-)
LOC118944050 LOC106593475 coding upstream 75326 9284288 ~ 9302415 (-)
LOC110506813 LOC106573659 coding upstream 106891 9315853 ~ 9321654 (-)
LOC118937655 pon2 coding upstream 113798 9322760 ~ 9328762 (-)
G111692 NA non-coding downstream 17513 9176228 ~ 9190500 (-)
G111698 NA non-coding downstream 23688 9183766 ~ 9184325 (-)
G111688 NA non-coding downstream 42305 9165040 ~ 9165708 (-)
G111680 NA non-coding downstream 59420 9148391 ~ 9148593 (-)
G111667 NA non-coding downstream 69818 9137271 ~ 9138195 (-)
G111718 NA non-coding upstream 1419 9210381 ~ 9210651 (-)
G111725 aif1 non-coding upstream 12282 9221244 ~ 9228224 (-)
G111731 NA non-coding upstream 27265 9236227 ~ 9237570 (-)
G111732 NA non-coding upstream 29684 9238646 ~ 9238908 (-)
G111659 NA other downstream 139951 9067612 ~ 9068062 (-)
G111650 NA other downstream 157215 9050289 ~ 9050798 (-)
LOC110535184 LOC106605879 other downstream 471615 8693136 ~ 8752164 (-)
G111044 NA other downstream 685252 8522002 ~ 8522761 (-)
G111855 NA other upstream 230400 9439362 ~ 9439938 (-)
G111955 NA other upstream 425575 9634537 ~ 9635130 (-)
G112066 NA other upstream 552338 9761300 ~ 9761665 (-)
G112076 LOC105018850 other upstream 570049 9779011 ~ 9780455 (-)
LOC110493960 LOC106606059 other upstream 791768 10000730 ~ 10007883 (-)

Expression


Co-expression Network