G113197


Basic Information

Item Value
gene id G113197
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 11273121 ~ 11300282 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU129362
GTGTAGGGCTGAAGGAGGCTGGCACTAACAAGCCTTGCTGTTTGATCTTATTATACCTCCcacatagcaccctattccctatacagcacATGACTTGTAGGTGAAGGTGTGGTAAGAGGCAAGGCtggagtcaattccatttcaattcagtcaatctGTGACATTCAAAATTTACAATTTTCCTCATGGGCTTTGATTGGGGAAAATTTGAATTTCAGTTAACTTTCTGCGTTTGGCTGAATTGAAAGGGAAATAACCCCAACCCTGGCAAGAGGTCGCGACGTGTCCAAGGTGACCGTCATTACAACTAATCCAACTTTCAGTAGTTTCTGGTCTGGAAAACAATAACAtcaacatgttctctctctgtactgcagTGTTGAGGTTTGTAGCTAGCTAACCGACTGGGGTATAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGACCGACTGGTTTGTAGCTAGCTGACCGACTGGTTTGTAGCTAGCTGACCGACTGgcttgtagctagctaactcacTGGTTTGTAGCTAGCTGATTTAATGGTGTTTAGTTAGCTGATTCACTGGTGTTTAGCTAACTAACCCACTggtttgtagctagctaactcgtTGATTCACTAGTTTGTAGCTAGCTGATTCATTGGTGTGTAGCTAGCCGATTCCCTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCATTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGATTCACTGGGGTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTGTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGATTCACTGGGGTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGATTCACTGGGGTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGTTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGATTCACTGGTGTGTAGTTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGATTCACTGGTGTGTAGTTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGATTCACTGGTGTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTAACAGTTACACTGCTATCTAGAGACaggaacacaccacacacacacacatagtttaAACATTCATTGTGTACGTATGCCTTTTAAAGAATATGACTTACTCATACTGTCATTTTTGTCCTTTGTCCAGATTTGTTGATTCATATTATGTGAGGTAGGCCATTGAATTCTTCAGCCCACCCACACTGTTGCcataagcagagagagagagatagagatcggTCAGTTTACATGCCCCATACATGATGTAATTGTTCATTTTTCTCAATAAGACAGACTCAGCTGTTGGCAATCCTAGCCACATGTTGAGattgcattaaaaaaaaatggagCTCTTGAAATGCAAGCTAAGCTTTATCCAATTACAACTTGGCCAGTTAGACTTGTTTACTTACTGTACATGCTAATAAAAAGCATCACTCATTATTATTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACAGCGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACCGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACCGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTTGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTTGAGACATTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTATAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACCGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTTGAGACATTGGAATCTAGAAGAGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGCTACATTTGGTTAGAGACAGTGGAATTTCGTCCGAaatgttttcttgttttttttatttcactgttCTGTCCTGGCTGCCTCCACATACAATATCACTAGTTGTCTTACTCAGTGAACGTGGAGCTGTTGAGCAGAGCCAAGTAGACATACAGTAACTGTGAAGACGCTGCTATGGAATTTCAGGGCAATTTCAGGGCAAATCAACCAACTAGTCAACTGGGAGACGCTGTTTTATCAACCAATCAAATCGAATGATCGATTGCTGGATTGATTTGATACGCTGTTTAGGCAATATCAGCTGGTCAATGTGTTTAgttagtgtactgtatatatatactgctacTGAAGGACCGTGTGCTCTACCTAACCGTGACACGTGTAGAGTACAACGCGACGCAGTCTACTCTAAGAGCAGCAAATTCAACCATGGTATCACGTCATGTAATAATAAcgttatttcttgttttttttatagaTTTGTATTGTTCCTGTCTTAAATATAAATAGTTGTTTTCTTCTCCTTCTGAATGGCAAAGTGCTTGTCTGTGTTTCAGTGTTCTTGAagacttttttttatttgtatattaTTGGCGTGTTGTATATATTAAACGCTGTGtgattttgtacattttgtgcttttgggggggggggggggggggcggaaaAGTTCCCAACTGAATGCCACGATGAGGCAGATATTTCTCTTGCACGTTCTTTTCAAAATGATCATGACTTATTTCAAAACTCACAGATACAAAATAAACAGAATgcctgtacata
>TU129364
GTGTAGGGCTGAAGGAGGCTGGCACTAACAAGCCTTGCTGTTTGATCTTATTATACCTCCcacatagcaccctattccctatacagcacATGACTTGTAGGTGAAGGTGTGGTAAGAGGCAAGGCtggagtcaattccatttcaattcagtcaatctGTGACATTCAAAATTTACAATTTTCCTCATGGGCTTTGATTGGGGAAAATTTGAATTTCAGTTAACTTTCTGCGTTTGGCTGAATTGAAAGGGAAATAACCCCAACCCTGGCAAGAGGTCGCGACGTGTCCAAGGTGACCGTCATTACAACTAATCCAACTTTCAGTAGTTTCTGGTCTGGAAAACAATAACAtcaacatgttctctctctgtactgcagTGTTGAGGTTTGTAGCTAGCTAACCGACTGGGGTATAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGACCGACTGGTTTGTAGCTAGCTGACCGACTGGTTTGTAGCTAGCTGACCGACTGgcttgtagctagctaactcacTGGTTTGTAGCTAGCTGATTTAATGGTGTTTAGTTAGCTGATTCACTGGTGTTTAGCTAACTAACCCACTggtttgtagctagctaactcgtTGATTCACTAGTTTGTAGCTAGCTGATTCATTGGTGTGTAGCTAGCCGATTCCCTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCATTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGATTCACTGGGGTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTGTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGATTCACTGGGGTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGATTCACTGGGGTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGTTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGATTCACTGGTGTGTAGTTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGATTCACTGGTGTGTAGTTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTTTGTAGCTAGCTGATTCACTGGTGTGTAGCTAGCTAACCCACTGGTAACAGTTACACTGCTATCTAGAGACaggaacacaccacacacacacacatagtttaAACATTCATTGTGTACGTATGCCTTTTAAAGAATATGACTTACTCATACTGTCATTTTTGTCCTTTGTCCAGATTTGTTGATTCATATTATGTGAGGTAGGCCATTGAATTCTTCAGCCCACCCACACTGTTGCcataagcagagagagagagatagagatcggTCAGTTTACATGCCCCATACATGATGTAATTGTTCATTTTTCTCAATAAGACAGACTCAGCTGTTGGCAATCCTAGCCACATGTTGAGattgcattaaaaaaaaatggagCTCTTGAAATGCAAGCTAAGCTTTATCCAATTACAACTTGGCCAGTTAGACTTGTTTACTTACTGTACATGCTAATAAAAAGCATCACTCATTATTATTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACAGCGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACCGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACCGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTTGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTTGAGACATTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTATAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACCGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTTGAGACATTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTTGAGACAGTGAAATCTAGAAGAGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGAGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGAGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGAGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTCGAGACAGTGGAATCTAGAAGAGACATTCGGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGCGACATTCAGTTAGAGACAGCGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGCGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACAGCGGAATCTAGAAGCGACATACGGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTATGAGACATTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTTGAGACAGTGGAATCTAGAAGAGACATTCGGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGAGACATTCAGTTAGAGGCAGTGGAATCTAGAAGAGACATTCAGTTAGAGGCAGTGGAATCTAGAAGAGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCGGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGGCAGTGGAATCTAGAAGAGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGTTAGAGACAGTGGAATCTAGAAGTGACATTCAGAGACAGTGGAATCTAGAAGAGACAGTGGAATCTAGAAGAGACATTTGGTTAGAGACAGTGGAATTTCGTCCGAaatgttttcttgttttttttatttcactgttCTGTCCTGGCTGCCTCCACATACAATATCACTAGTTGTCTTACTCAGTGAACGTGGAGCTGTTGAGCAGAGCCAAGTAGACATACAGTAACTGTGAAGACGCTGCTATGGAATTTCAGGGCAATTTCAGGGCAAATCAACCAACTAGTCAACTGGGAGACGCTGTTTTATCAACCAATCAAATCGAATGATCGATTGCTGGATTGATTTGATACGCTGTTTAGGCAATATCAGCTGGTCAATGTGTTTAgttagtgtactgtatatatatactgctacTGAAGGACCGTGTGCTCTACCTAACCGTGACACGTGTAGAGTACAACGCGACGCAGTCTACTCTAAGAGCAGCAAATTCAACCATGGTATCACGTCATGTAATAATAAcgttatttcttgttttttttatagaTTTGTATTGTTCCTGTCTTAAATATAAATAGTTGTTTTCTTCTCCTTCTGAATGGCAAAGTGCTTGTCTGTGTTTCAGTGTTCTTGAagacttttttttatttgtatattaTTGGCGTGTTGTATATATTAAACGCTGTGtgattttgtacattttCTTCTTTTTGGAG

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106594931 isoform X3

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU129362 False 2899 lncRNA 0.43 2 11273121 11278179
TU129364 True 3767 lncRNA 0.42 3 11273121 11300282

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
fbxo32 fbxo32 coding upstream 30047 11227497 ~ 11243074 (+)
LOC110512016 LOC106564714 coding upstream 61909 11202887 ~ 11211212 (+)
nsmce2 LOC106606151 coding upstream 175657 11084361 ~ 11097464 (+)
washc5 kiaa0196 coding upstream 190023 11031992 ~ 11083098 (+)
LOC110507508 LOC106605488 coding upstream 562761 10626586 ~ 10710360 (+)
LOC110520740 LOC106592347 coding downstream 6892 11307174 ~ 11324807 (+)
soga3a LOC106593623 coding downstream 27744 11328026 ~ 11373000 (+)
echdc1 echdc1 coding downstream 92660 11392942 ~ 11397308 (+)
fbxo43 fbxo43 coding downstream 102661 11402943 ~ 11413713 (+)
LOC110510416 LOC106596421 coding downstream 115924 11416206 ~ 11459325 (+)
G113241 NA non-coding upstream 13062 11259739 ~ 11260059 (+)
G113238 NA non-coding upstream 18617 11253868 ~ 11254504 (+)
G113200 NA non-coding upstream 25765 11245613 ~ 11247356 (+)
G113199 NA non-coding upstream 27559 11243710 ~ 11245562 (+)
G113256 NA non-coding downstream 3998 11304280 ~ 11305549 (+)
G113258 NA non-coding downstream 10878 11311160 ~ 11312084 (+)
G113265 NA non-coding downstream 36232 11336514 ~ 11337268 (+)
G113276 NA non-coding downstream 61030 11361312 ~ 11368100 (+)
elovl4a LOC106606161 other upstream 121 11260912 ~ 11275480 (+)
G112697 NA other upstream 447058 10811518 ~ 10826063 (+)
LOC118937659 NA other upstream 1496670 9773574 ~ 9776807 (+)
LOC110506952 LOC106606100 other upstream 1549250 9701990 ~ 9742723 (+)
G113285 NA other downstream 114649 11414931 ~ 11415178 (+)
G113313 LOC102781083 other downstream 177694 11477976 ~ 11482741 (+)
G113396 NA other downstream 408321 11708603 ~ 11709777 (+)
G114243 NA other downstream 1420126 12720408 ~ 12720693 (+)
G114244 NA other downstream 1420448 12720730 ~ 12721315 (+)

Expression


Co-expression Network