G114340


Basic Information

Item Value
gene id G114340
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 12382090 ~ 12384153 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU131167
cagacagaccacagaccacagacAGACCACCGACAGACTCATCCCAGAGactcaacagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgtcatctcagagactcagcagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgtcatctcagagactcagcagacaggttataaCGGTGTCACctcagcagacaggttataatgatgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacatgttataacggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcaccTCAGCatacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgttatctcaacagacaggttataatggtgttatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcagcagac
>TU131170
cagacagaccacagaccacagacAGACCACCGACAGACTCATCCCAGAGactcaacagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgtcatctcagagactcagcagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgtcatctcagagactcagcagacaggttataaCGGTGTCACctcagcagacaggttataatgatgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacatgttataacggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcaccTCAGCatacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgttatctcaacagacaggttataatggtgttatctcaacagacaggttataatggtgtcacctcagcagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgttatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataat
>TU131169
cagacagaccacagaccacagacAGACCACCGACAGACTCATCCCAGAGactcaacagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgtcatctcagagactcagcagacaggttataatggtgtcatctcagcagacaggttataatggtgtcatctcagagactcagcagacaggttataaCGGTGTCACctcagcagacaggttataatgatgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacatgttataacggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcacctcagcagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgtcacctcagcagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataatggtgttatctcaacagacaggttataatggtgttatctcaacagacaggttataatggtgtcatctcaacagacaggttataat

Function

NR:

description
PREDICTED: actin cytoskeleton-regulatory complex protein pan1-like, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU131167 False 608 lncRNA 0.43 3 12382090 12384153
TU131170 False 758 lncRNA 0.42 2 12382248 12384153
TU131169 True 646 lncRNA 0.42 2 12383144 12384153

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
osr2 LOC106591507 coding downstream 77140 12299928 ~ 12304950 (-)
LOC118937706 NA coding downstream 292661 12085564 ~ 12089429 (-)
LOC118937715 NA coding downstream 419496 11961554 ~ 11962594 (-)
LOC118937716 NA coding downstream 421227 11959279 ~ 11960863 (-)
LOC118937710 NA coding downstream 795513 11585559 ~ 11586577 (-)
LOC118944056 NA coding upstream 51316 12435469 ~ 12445157 (-)
LOC118937718 LOC106590816 coding upstream 165146 12549299 ~ 12553519 (-)
LOC118944197 NA coding upstream 233353 12617506 ~ 12617694 (-)
pop1 LOC106561139 coding upstream 255549 12639702 ~ 12673874 (-)
LOC118937724 NA coding upstream 298905 12683058 ~ 12683775 (-)
G114108 NA non-coding downstream 39919 12341967 ~ 12342171 (-)
G114104 NA non-coding downstream 59365 12322519 ~ 12322725 (-)
G114075 NA non-coding downstream 107661 12271706 ~ 12274429 (-)
G114077 NA non-coding downstream 112269 12265543 ~ 12269821 (-)
G114074 NA non-coding downstream 114469 12263854 ~ 12267621 (-)
G114345 NA non-coding upstream 22855 12407008 ~ 12408829 (-)
G114336 NA non-coding upstream 40042 12424195 ~ 12428711 (-)
G114359 NA non-coding upstream 71609 12455762 ~ 12456037 (-)
G114361 NA non-coding upstream 78593 12462746 ~ 12464158 (-)
G114362 NA non-coding upstream 80412 12464565 ~ 12466400 (-)
LOC110513475 LOC106592216 other downstream 723422 11471939 ~ 12290710 (-)
G113733 LOC106606124 other downstream 1029349 11349342 ~ 11352741 (-)
G113720 NA other downstream 1056478 11323041 ~ 11325612 (-)
G113712 NA other downstream 1069432 11310843 ~ 11312658 (-)
G113688 NA other downstream 1163936 11210473 ~ 11218154 (-)
G114390 NA other upstream 199874 12584027 ~ 12585140 (-)
G114402 NA other upstream 226516 12610669 ~ 12613680 (-)
G114424 NA other upstream 323674 12707827 ~ 12709315 (-)
G114442 NA other upstream 351161 12735314 ~ 12739157 (-)
LOC110507534 LOC106606051 other upstream 707939 13086169 ~ 13094428 (-)

Expression


Co-expression Network