G117711


Basic Information

Item Value
gene id G117711
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 17068585 ~ 17072226 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU135464
CTGTTAagtactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgagtctctgttaactactctctgtctctgcgtcCCTGTTAACTACTCTCCGTCTCTGTTAACTACTCTTTGTCTCTGCGTCTCTGTTaactactctctccctctgcgtcccTGTTaactactctctccctctgcgtccctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtttctgttaactactctctgtctctgcatcCCTGTTaactactctctccctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtcCCTGTTAACTACACTCTCCCTCTGCGCCTCGGTTaactactctctccctctgcgtccctgttaactactctctgtctctgcgtccctgttaactactctctgtctctgcgtccctgttaactactctctgtctctgcgtcCCTGTTAACTACTCTCCGTCTCTGTTAACTACTCTTTGTCTCTGCGTCTCTGttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtccctgttaactactctctgtctctgcgtccctgttaactactctctgtctctgcgtcCCTGTTAACTACTCTCCGTCTCTGCGTCTCTGttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtctgttaactactctctgtctctgcgtctCTGTTAACTACTCTCCGTCTCTGCGTCTCTGTTAACTACTCTCTGGCTCTGCGTCTCTGttaactactctctgtctctctgtctctgttaactactctctttctctgttaactactctctgtctctgttaactactctctgtctctgttaactactctctgtctctgtgtctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactcttagtctctgcgtctctgttaactactctctgtatctgtgtctctgttaactactctctgtctctgcgtccctgttaactactctctgtctctgcgtccctgttaactactctctgtctctgcatctctgttatctactctctgtctctgcatctctgttaactactctctgtctctgcatctctgttaactactctctgtctctgcgtctcttttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctctgtctctgttaactactctctgtctctgttaactactctttgtctctgtgtctctgttaactactctctgtctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctcagtctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtccctgttaactactctctgtctctgcgtccctgttaactactctctgtctctgcatctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgcgtccctgttaactactctctgtctctgcatctctgttaactactctctgtctctgcgtctctgttaactactctctgtctctgtgtccctgttaactactctctgtctctgttaactactctctgtctctgcgtctCTGTTAACTACTCTCTGTTTCTGCGTCTCTGTTAACTACTCTCTGTCTATGCGTCTCTGTCTTCGATCGGAGGGAGAC

Function

NR:

description
PREDICTED: S-antigen protein-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU135464 True 1964 lncRNA 0.46 4 17068585 17072226

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110536287 LOC106605892 coding upstream 13396 17026878 ~ 17055189 (+)
LOC110534239 LOC106594151 coding upstream 63990 17002350 ~ 17004595 (+)
LOC110536241 LOC106606012 coding upstream 67222 16998821 ~ 17001363 (+)
LOC110536275 s10i coding upstream 70229 16995630 ~ 16998361 (+)
LOC118937935 LOC106606010 coding upstream 95723 16970054 ~ 16972862 (+)
LOC110534250 adar coding downstream 69438 17141664 ~ 17161398 (+)
LOC100135972 LOC100135972 coding downstream 97342 17169568 ~ 17322419 (+)
LOC110520897 NA coding downstream 238902 17311128 ~ 17315827 (+)
LOC110520882 rab13 coding downstream 310837 17383063 ~ 17394790 (+)
LOC110520798 fam189b coding downstream 323117 17395343 ~ 17421816 (+)
G117708 NA non-coding upstream 3208 17065173 ~ 17065377 (+)
G117701 NA non-coding upstream 25675 17041521 ~ 17042910 (+)
G117638 NA non-coding upstream 165340 16902902 ~ 16903245 (+)
G117636 NA non-coding upstream 167096 16901279 ~ 16901489 (+)
G117750 NA non-coding downstream 91959 17164185 ~ 17164471 (+)
G117772 LOC100380853 non-coding downstream 171183 17243409 ~ 17254914 (+)
G117780 NA non-coding downstream 192396 17264622 ~ 17286752 (+)
G117781 NA non-coding downstream 195039 17267265 ~ 17267624 (+)
G117787 NA non-coding downstream 209296 17281522 ~ 17289802 (+)
G117704 NA other upstream 17746 17050132 ~ 17050839 (+)
G117048 NA other upstream 882801 16182890 ~ 16185784 (+)
LOC110535842 LOC106605985 other upstream 1616897 15448845 ~ 15451856 (+)
LOC110535783 LOC106606004 other upstream 1701796 15355848 ~ 15368210 (+)
G117714 LOC106605886 other downstream 975 17073201 ~ 17073701 (+)
G117735 NA other downstream 383539 17455765 ~ 17458022 (+)
LOC110536658 LOC106577300 other downstream 1385132 18457284 ~ 18481741 (+)
G119153 LOC106605761 other downstream 1561613 18633839 ~ 18636041 (+)

Expression


Co-expression Network