XLOC_020993 (CT990618.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_020993
gene name CT990618.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 13711434 ~ 13716585 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00041280
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>TCONS_00041281
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>TCONS_00041283
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>TCONS_00041284
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>TCONS_00041285
gttaagttgtttgcagtttcattgttgtaaaaataccatactttttccttttttatcagCAGGTGGAGAGACCGTCTGGgcagcagaaacaagacaactaatcatagttaggttgagattagtattattaacttgactagtttggttgcagacttgttcaatacttaacaatttgtatgagttacaagatcaatggtcctgctatcaatgtttttgtaacttaaattcattacagtttagatacaatcaaatgtccaaaccatctctgagtgaatgacatcaaggaaacaggatcaaaagatcattcattatagaccgtttcatagGTCATTCTGTTCTCCTGGTTGTGAGCATGTGCAGAGGCtgtatttgtcag
>TCONS_00041286
tggacttgtaggcaaaaccggagcacccagagaaaacccacgcaaacgcagggagaatttgcaaactccacacagaaatgccagctgatccagccgaggctcgagtcagcatccttgcttattggatgcctgattgcagttcaactccaaactcagttggaccagctgatcagtgtcttcagtatTACCACAAGCTACTGGGCAGATGTGTGGACACGACAGCTATGAGCCAGACTTGGGACGTTTGGTTTTTAGGTAATACCAGTGACAAAGTATTCAGtaaattgcttataataaaagatgctcactgcttacccccttatagttaagttgtttgcagtttcattgttgtaaaaataccatactttttccttttttatcagCAGGTGGAGAGACCGTCTGGgcagcagaaacaagacaactaatcatagttaggttgagattagtattattaacttgactagtttggttgcagacttgttcaatacttaacaatttgtatgagttacaagatcaatggtcctgctatcaatgtttttgtaacttaaattcattacagtttagatacaatcaaatgtccaaaccatctctgagtgaatgacatcaaggaaacaggatcaaaagatcattcattatagaccgtttcataggtaacagcacatcctttgtgaaaaataatttatttttgtgtcatcatCACAAGACCAAATACATTTCAACTGATTTCAG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000095236

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00041280 False 2342 processed_transcript 0.33 7 13711434 13716397
TCONS_00041282 False 2165 processed_transcript 0.33 6 13711434 13716585
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TCONS_00041283 False 919 processed_transcript 0.40 6 13712592 13716020
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TCONS_00041286 True 729 processed_transcript 0.39 2 13715455 13716402

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_020992 NA coding downstream 17807 13668985 ~ 13693627 (-)
XLOC_020991 si:ch211-279g13.1 coding downstream 61830 13638586 ~ 13649604 (-)
XLOC_020990 NA coding downstream 103871 13606281 ~ 13607563 (-)
XLOC_020989 cntnap5b coding downstream 167190 13458735 ~ 13544244 (-)
XLOC_020988 CU062647.1 coding downstream 280130 13422568 ~ 13431304 (-)
XLOC_020994 s100b coding upstream 129545 13846130 ~ 13857729 (-)
XLOC_020995 BX649510.1 coding upstream 229368 13945953 ~ 13946067 (-)
XLOC_020996 BX649296.1 coding upstream 303019 14019604 ~ 14019722 (-)
XLOC_020997 aox5 coding upstream 367144 14083729 ~ 14115316 (-)
XLOC_020998 si:ch211-246m6.4 coding upstream 410887 14127472 ~ 14128716 (-)
XLOC_020986 NA non-coding downstream 466883 13201478 ~ 13244551 (-)
XLOC_020985 NA non-coding downstream 523102 13187861 ~ 13188332 (-)
XLOC_021001 NA non-coding upstream 559161 14275746 ~ 14298602 (-)
XLOC_021002 NA non-coding upstream 583215 14299800 ~ 14301873 (-)
XLOC_021004 NA non-coding upstream 615865 14332450 ~ 14334135 (-)

Expression


Co-expression Network