G120169


Basic Information

Item Value
gene id G120169
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 20407862 ~ 20419128 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU138671
CTGGAGAAATACAAATATGATATGTAAGATGGTTCGATGACATTTATAAAAATGTTACATTTGCAAGCACTATAAAGGAGTGGACATTTCCCCTTTCCCTTTGTATTGGATCTTCATCCAGCTCCGGGGAGAAGTTTTAATGTGCGTAAAACCCTCATAGTCTCAGTTGTCTTGCCTGTATTATACACCCACGGGAGGAATTATGATGCCCATAACTATATTTAGACATATCCTTTTTAAAGCAAGTTGTTGTTTCGTTTTTATTTGAATTATACAGTCTTTTTAGGCCTTTTTTCTTTCTTGCTTTTTGACTGTCTGGAATGTCCATGTGCAGACTGCAGATTACAGTAGGcatagcccctatatcagtgtgaatactATAGCCTATGCTTAACAACGTATTTCCATGGTGAAGAAATGCAActagaacaatgtggactgcagtgaggggccaagccttaacacacccacaacttgttgattcatcaaaacccagccctttcatGCCACCGCTAGCAAATGCACCCATTATTGTGGTTGTGGAAATAGCCtaaatatttctgacacacccctgAACCTATAGTGCTACCACCAGCACTTAATTTACCATTGCCAAGCccggctctagccttttgggggccctaagcgagattCGGAAGCCCAAGTGGGAACATTTTTAATTTTCTGCaagttcatttcctgcaattctacacattttgccatgacttatgcaatgttggggcggcagggtagcctagtggttagagcgttggactagtaactgaaaggttgcaagttcaagctGACATGCTTGAACAAGGTACAAggtatctgtcgttctgcccctgaacaaggcagttaacccactgttcctagaccagttaacccactgttcctagaccagttaacccactgttcctaggccgtcattgtaaataagaatctgtcgttctgcccctgaacaaggcagttaacccactgttcctaggccgtcattgaaaataagaatttgttcttaactgacttgcctagttaaataaaggtaaaataaatgttaatgatgtgagagtgactaacaaccGTGTGCCCGGTTGGTATTTGGCCATGataactacaagtttagataatgggctagactaatttaccttTGAAATTTGTCATGGCTTATTGAGTGAGTGTCTGTGACTGACACAACtagaggaaaactgctgatgcacaaccaaatctGAACtagcaccttgtgtattctactattctaactctcaacagtaactTGAGACCCCAACTGAGTTCCTTTGGGCCAGGGGCTAGCGGCCAGGGGCTAGCGGCCAGGGGCCCTAAGCGACCGCTTAGGAAGTTTTTGTCTAAAGCAATTCACCTGTGCTGAAGAGTTAGATCTTCTCTTTGTCTGAGTTCTACTATAAGATATGAGCATTTGTGGTCTACATGTGGAGTAATGGTCTGATGTTCCCTTTTGCTTTCGCTTCCTCAACGGTGTTGCTTCTCCTGGTCCACTAGGGAGAGTCGAACATACCTGAGCTCATCTGAATAACTGCCACTAGAATAACTGAGTTCCAAAAGTCCTTCCATAACAAGATATACAGACACATTCTGTCAAATATTGTCTGAAGATCCTTCTCCCAGGACACTAtggggctcagttggtagagcatggtgcttacaATGCCaaggatagtgggttcgattccagcTTGGGCCACCCATagtaaaaatgtatgcacacatgactgtaagtcgctttggataaaagcatctgctaaattcgATATACTGTATTATGTTATTCTTAACTAACTCGTCCAAAGGATTATTCAGCATCCTTTGCAGGCAGACACACTCGCATGATGGAACTACTAAATGTGAGTGGGTGTTGGAGCTTGATCAAGGCAATGTGGTGATGATGAAATAGGCAATTTCCAAATGAGGGGAACGGAGGATGTGGTTGCCTCCTGCATATACTCTGCCTCTTAATAAGagacaggaaaacaacaggatTGCGTCTTCTTACTGTAGCTAATAGGAATCTAGGATTTTCTGTTAATCAGACAAGGTCTTCTGAAAGGGATACATGAAGTGAAGTCAATATGGCCCTAAGCTCTTTAGctcccccctttcctcttctGTTACCATGACACTCTTTCTTTTCCCTCTTTTTCAGACAGCGAATTATACCTTCAGGGGGTCTCAATTCTTTTCACAGGAACTGCACACGTTTTTTAATGGGCCTAATAGTCATTtaacacaattttttttattacCTATTAATTTGGCATGAACACAACctgtcatgatgttttcatcttatTGTCAAAAGACAAATCACTTCACTGTGCGTGTTCGTACACTCCAAAATAACTACAGGATAGTAACAGTGCAATTAGATGAATGGACAAATCAAGAAAATAAGATATTGGTTGAGTATATCTATTTTGTAGATAGTATcacaggtgtagcgaaatgcctatattcctagctccaacagggaAGCAATacataacaatacaaaacaatacacccAAATCCCCCTCACCCCTAAAAGATAATTAAGGAATATAGAAATATTATAAGGAGCATTGTCAGAGTCTGGTATGATGGAGTGTGTAGACATAGTGGACAGTATATTAATAGAAAAGGTgtatacagcagtagttatatacagttgaagtcaaaagtttacatacatttatgttggtgtcattaaaacttttcaaccactccacaaatttcttgagaacaaactatagatttgtcaagtcggttaggacatctactttgtgcatgacacaagtcatttttccaacaattatttacagacagattaattcactgtatcacaattccagtgggtcagaagttagggggcagtattttcacgtccggatgaaaagcgtgcccaaagtaaactgcctgttactcaggcccagaagctaggatatgcagaTAATTGGTAGATTcttatagaaaacactctaaagtttctaaaactgttaaaataatgtctgtgagtataacagaattgatttggcaggcgaaacccagaggacaaaccacccCCCAAAACAAAATTCAGCCTAgcactgttttcaatggctgtcaatTTTATTATAAGGTGaaaacctcccagattgcagttcctatgtcttccactagatgtcagccgtctttagaaagagtttcaggctgatTTTTGTAAAAATGAGCTAGaagttgtagtttttctaagtggctcccattttggctgtagtgtttccatgcgCGTGGAGGAAAGCGCATTCTTTggtatttatctccggtaatgaacatactattctccgtcttaaatgttatcgtttatttacgtattagggtacctagggtttgattataaacgttgtttgacttgtttggataagtttattggtttagtttagtttaacgtttgggattcattttgtatgcattttgaaggagggaaactggtggattattgactgaatcACGCCAGccaaactgagtttttatggatataaagaaggactttatcgaacaaaagaaccatttgtgatgtaactgggaccttttggagtgtcaacagaagaagatcttcaaaggtaaggcatttattatatcgctatttctgactttcgtgtcgcacctgcctggttgaaaaatgtttttcatggttttgtatgcagggcgctgtcctcagatcgCATGgtatggtttgctttcgccgtaaagcctttttgaaacctgacacagcagctggattaacaagaagttaagctttattttgatgtattacacatgtattttcatgaatgtaaaaatatttatatttctgtagtttgaatttcgcgctctgcaatttcaccggatgttgtcgaggtgggtcgctagcggaacgcctgcacTAGAAaggttaacaaacaatagtttgtgCATGacaatctactttgtgcatgacacaagtaatttttccaacaattgtttacagacagattatttcacttttaattcactgtatcacaattccagtgggtcagaagtttacatatactaagttgactgtgcctttaaacagcttggaaaattccagaaaatgatgtcatggctttagaagcttctgataggctaattaacaaaattttagtcaattggaggtgtacctgtgaatgtatttcaaggcctaccttcaaacttgacatcatgggaaaatcaaaataaatcagtcaagacctcagaaaaaagattgtagacttccacaagtctggttcatccttgggagcaatttccaaatgcctgaaggtaccacgttcatctgtacaagcaatagtatgcaagtataaacaccatgggaccatgcagccatcataccgctcaggaaggagacgcgttctgtctcctagagatgaacgtactttggtgcggaaagtgcaaatcaatcccagaacaacagcaaaggaccttgtgaagatgctggaggaaacaggtacaaaagtatctatatccacaataaaatgagtcctatatcaacataacctgaaaggccgctcagcaaggaagaagccactgctccaaacccgccataaaaaaaagccagactacggtttgcaactgcacatggggacaaagatcgtactttatgaacaaatgtcctctggtctgatgaaacaaaaatagaactgtttggccataatgaccattgttatgtttggaggaaaaagggggaggcttgcaacctaaagaacaccatcccaaccatgtagcacgggggtggcagcatcatgttgtgggggtgatttgctgcaggagggtctgatgtacttcacaaaatagatgccatcatgaggtgggaaaattatgtggatatattgaagtaacatctcaagacatcagtcaaagtaaagcttggtcgcaaatgggtcttccaaatggacaatgaccccaagcatacttccaaagttgtagaaaatggcttaaggacaacaaagtcaagctattggagtggccatcacaaagccctgacctcactcCTATTGAGAATGTGTATgcagaattgaaaaagtgtgtgagcgtaaggaggcctacaaacctgactcagttacactagttctgtcaggaggaatgggccaaaattcacccaacctattgtgggaagcttgtggaaggctacccaaaacgtttaacccaagttaatcaatttaaaggcaatgctaccaaatactaattgagtgtatgtaaacttctggcccactgggaatgtgttgaaagaaataaaagctgaaataaatcattcgctctactatttttctgacatttcacattcttaaaataaagtggtgatcctaacggacctaaaacagggattttttactatgattaaatgtcaggaattgtgaaaaactgagtttaaatgtatttggctaaggtgtactgtatgtaaacctccgacttcaactgtattatattttatacattttagactaaggctgtaacgtaataacattttgaaaagtcaaggggtctaaatactttccgaatgcactgtatgtcatggaaagagctaatgttttgtacactcaatgtattaAAATGACCTATACAGTTGATAATAACAATTGTAATAATAAAAAACAGACTTAACATGTATTTAATATGCTCCAGTTACAGAAAACCCTTAATTcaataaaaaaacatatattgtgtttatattgtataTTTGCTGCTATCCTCGACAAACTCAAACATTTCTTGCATAATTTATACAGCCCTAATTTCGATTCTCCTCCATAGTCTTCTTGATCCATTCTACATAGTTAGCTACACGGGTGTAGACCCCATATTGGCCTGGTTCTCCACAGTCAATTCCCCAGCTGGCGATCCCTGCTGCCCAGAAAACACCCCCATACTTCAGGACATACGGCCCTCCACCATCCCCTGCACAGGTGTCCTTTCCACCCTCTGGTAACCCGGCACAGAACATGCCGTCTGTCAAATCAGGggcttctctcttcttcttcctcacCTCATCAATAGAGCTTCTGCACTTCGCCTGGTCCACCAGGGGAATCCGGACATATCTGAGGTTACTGGGCTTTTCATCATCATCTTTGAGGCCAAACCCTGAAACccagctgagagagggagggcgggagagagagaccgagagagaagtcccgtttatacctggtgctaacattggtcctttgtcctgatcttgtctacattcagattgtgcccacatttccaGGGGCTACtcaggggaggacggctcatgatAATGGCTGGAACGTAGCGAATGGAATTGCATCAAagacatggaaaccatgtgtttgatgttgttcATACCTTTCCACTGATTcggctccagccattaccacatgCCCATCCTcaccaattcaaatcaaatccaaatccatttttatttgtcacatgccctgCACAcaaactttacagtgaaatgcttacttacaagcccttaaacaacaatgcaaaacaccagtctcaatgtcaacagtgaagaggcgactctggaatactggccttctaggcagagttccctctgtccagtgtttgtgttattttgcccaACTCAATCTTttcattttattggccagtctgagataaggctttttctttgcaactctgcctagtaggccagcatcccggagtcgcctcttcactgttgactttgaaactggtgttttacgggtactatttaatgaagctgccagttgaggacttgtgagacatctgtttctcaaactagacactctaatgtacttgtcctcttgctcagttgtgcaccggtgcctcccactactctttctagtctggttagtgccagtttgcgctgttctgtgaagggagtagtacacagcgttgtacgagatcctcagtttcttgtcaatttctcacatggaatagccttcctttctcaaaacaagaatagactgatgcgtttcagaagaaagttctttgtttctggtcattttgagcatctaatcaaatccacaaatgctgatgctccagatactcaactagtcaaaTGAAGGCCAGTTTTGTTGCTTTTTTAATCggcacaaccgttttcagctgtgctaacataattgcaaaattattttctaatgatcaattagcatatccaagtttatcatttcaaaaggctaacacaacatgccattggaacacaggagtgatggttgctgataattggcagctgtacgcctatgtagatattccataaaaaatctgcccttttcagttacaatagtcatttacaacattaacaatgtctacactgtattctgatcaatttgattatattttaatggacaaaaaatgtgcttttctttcaaaaagaagaatatttctaagtgaccccaaacttttgaacggtagtgtaggtagagttattcaagtgactatgcatagataataacagagtagcagcagtgtaaaagagggggcggggcaatgcaaatagtctgggtagccaattgattagatgttcaggagtcttgtggcttggggatagaagctgtttagaagcctcttggacctagacttggcggcccggtactgcttgccgttcGGTAGCAGAGAttacagtctatgactagggtggctggagtctttgtcaatttttagggccttcatctgacaccgcctggtacagaggtcctgaatggcaggaagcttggccccagtgatgtactgggctgtacccactaccctctatagtgggttgcggtcggaggctgagcagctgccataccaggcagtgatgcaacccatcaggatgctctcgatggtgcagctgtaaaaccttttgatgatctgaggacccatgccaaatcttttcagtctcctgagggggaataggttttgtcgtgcccccttcacgactgtcttgctaTGCATGGATCATGTTCATTTGTTGGGGATATGGGCACCAAGgagcttgaagctctcaacctgctctactatagccctgtcgatgagaatgggggcgtgcttggcaattattttcctatagtccacaatcatcttgtttgtcttgatcacgttgagggagaggttgttgtcctggcaccacatggccaggtctctgacctactccctataggctgtctcgttgttctcggtgatcaggcctgctgtgtcatcggcaaaattcatgatggtgttggagtcgtgcctggccatgcagtcatgagtgacctgggagcacaggagcacaggaggggactgagcacgcatccctgaggggcccctgtgttgaggatcagttgCGGATTTGTTGTTACGtacacttaccacctgggggcggtccatcAGAAAGtcctggatccagttgcagaaggaggtgtttagtcccagggtccttagcttagtgatgagctttgagggcaattAAGGTGTCGTCAAACTCCTGTGCTACACATGCTATTAAAATGTGTCTGTTATCCATCgactgtgtctgcattgtgaCCACATTTCCTGGTCCCTTCATTTGTTCAAATtattaaccagttgcatctctaggggcgctatttcatgtTTGGATAAAAAactttcccgttttaagcgcgatattatgtcacgaaaagatgctcgactatgcagttttggaaagaaaacactctgaagtttcagaatctgcaaagattttgtctgtaagtgccccagaactcattctacaggcgaaaccaagatgatacgtcaaacaggaaatgagcagaatttctgaagctctgttttctaatgtctccttatatggctgtgaatgcgacaggaataagcttagacattctgccgtttccccaagatgtcggcagcattgtgacgtatttgtaggcatatcattggaagattgaccataagagactacattttccaagtgtccgcctggtgtcctgcgtcgaaactggtgcgcaaagccatgtgcaagtatttttccatttgattgagaggggaaaccatgcttccacgaacgatatatcatcgaagagatatgtgaaaaacaccttgaggattgattctaaacaacgtttgccatgttttcagtcgatattatggagttaatttggaaaaaagttcgcgttttgaggactgaattttcgtttttttttggtagccaaatgtgatgtacaaaacggagctatttctaatacacaaagaatattttgggaaaaactgagcatctgctatctaactgagagtctcctcattgaaaacatctgaagttcttcaaaggtaaatgattttatttgaaggcttttatgtttttgttgaaatgttgcgtgctggatgctaacgctaatgctaacgctaaatgctacgctaggtagctacttttacacaaatgattgttttcctatggttgagaagcatattttgaaaatctgagatgacagtgttgttaacaaaaggctaagcttgagagctagcatatttatttcatttaatttgcaattttcatgaatcgttaacgttgcgttatggtaatgagcttgagtctgtattcacgatcccggatccgggatggggagatcagaaaggttaaacagcTTTTCCTACAAAATAATATTAATTTATTCTAAGACACATTGTGACGACGTAATCGGTCAAATTctgtcaatgattttagaagGCGGAATAATGATGATGATTTAAATGATTTCTCTGTCCAGATCTGTCTACAAATGTAAGATTTCCAAACACAATGTATGTCTGACTACCTCCGGAGGTGGGCAGGATgatctgatcacaatcagatcacaatgtgtcttttGATTGTCTACACCTGTGTAATAATTTGGGgacaatcagaatgtggataagatcaggacaaaggatgcAAGTTAGAACCAAGTATAAACAGGACTAGAGAAAGATAAATGACAAATGCAGTATCATAGCTTCTGTTTCCATTGCATTGAGGTAGTTttaggaagaaaaaaaatacaatggaAACAGAAATAGAGAATGCCCAATAACTATACTGTCAAATATCAAACATTTACTGCACAGGAGAGCAAACTCTTACCCAACTCTTCCAGTGGAGTATTCAGCGCCCTTTGCAGGCAGACACACTTGCATGATGGAACTACTGAATGTGAGTGGGTGTTGAAGCTTGATCAAGGCAATGTCGTGGTTGAAGGATAAACCGTCTGTGTTACTGTACCCAgggtgaggatggagagaggccACTTCAAGAGGTGGAGACTGAAGGAGGTTTTCCACATTGTTGTCGCCAACGTATGCCTTCACTCTTCTTGATGACTTGGTTGTTATGTTGATGCACCAGGCCATGAGCAGCAGTCAGGATCCACCTGTCCCCGATGACCATCCCTCCTGATCGGCCTCCTTCCACACTGAGAAGCATCTGCCAGGGAAATGTTCCTTTTGGAGCTACCTCTCCTCCCAGAATCCTTTGGTGTATTTCTATGGACACCATAGGTCTTCCACAGACTGGTTTTTTGCTCTTCCTCCTCTATGGTCTTCTTGATCCAGTCTACGTAGTTAGCCACACGGGTGTAGACCCCATATTGTCCAGGCTCTCCACAGTTAATCCCCCAGCTGACGATCCCTGCTGCCCAGAAATAATCACCCTCCTTCAGGATGTACGCTCCTCCACTGTCTCCCGTACAGGAGTCCTTGCCTCCCTCAGAATTCCCAGCACAGAGCATGTTGTCTGTTAGACTGAGATTTCTTTCATTTTTCACCTTCTCAATAGATTTCCTACAGATTGTCTGGTTCACCACAGGTAGAGGAACATACATGAGGTTATTGGTAGCCATATCACGCTCTTTGTTGCCAAATCCTGAAATTAAG

Function

NR:

description
mannan-binding lectin serine protease 2-like

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU138671 True 10842 TUCP 0.42 3 20407862 20419128

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110509646 NA coding upstream 35839 20364572 ~ 20372023 (+)
LOC110509663 LOC100194563 coding upstream 43650 20362226 ~ 20364212 (+)
plekhg6 LOC106605732 coding upstream 54016 20338252 ~ 20353846 (+)
LOC110509528 tnr1a coding upstream 70189 20326378 ~ 20337673 (+)
LOC110509548 LOC106575195 coding upstream 97087 20298486 ~ 20310775 (+)
LOC110509563 LOC106576603 coding downstream 33654 20452782 ~ 20462007 (+)
wnt4b wnt4b coding downstream 166181 20585309 ~ 20596873 (+)
LOC110537428 mlf2 coding downstream 189423 20608551 ~ 20612480 (+)
LOC110537439 LOC106576545 coding downstream 196508 20615636 ~ 20628482 (+)
LOC110537453 atn1 coding downstream 209998 20629126 ~ 20649273 (+)
G120272 NA non-coding upstream 50720 20356751 ~ 20357142 (+)
G120271 NA non-coding upstream 51521 20356128 ~ 20356341 (+)
G120270 lag-3 non-coding upstream 51882 20355631 ~ 20355980 (+)
G120269 lag-3 non-coding upstream 52293 20355181 ~ 20355569 (+)
G120289 NA non-coding downstream 34589 20453717 ~ 20454314 (+)
G120285 NA non-coding downstream 43579 20462707 ~ 20464258 (+)
G120317 NA non-coding downstream 117475 20536603 ~ 20542112 (+)
G120318 NA non-coding downstream 119586 20538714 ~ 20540302 (+)
G120342 NA non-coding downstream 160167 20579295 ~ 20579761 (+)
G120259 NA other upstream 87606 20319739 ~ 20320256 (+)
LOC110537348 LOC106575899 other upstream 223237 20179254 ~ 20185414 (+)
G120211 NA other upstream 236481 20171082 ~ 20171381 (+)
zyx zyx other upstream 250752 20145710 ~ 20165887 (+)
casp2 LOC106605831 other upstream 382879 20018602 ~ 20030933 (+)
erfl3 LOC106576393 other downstream 481146 20900204 ~ 20977481 (+)
LOC110509768 LOC106576258 other downstream 572626 20990131 ~ 21058856 (+)
LOC118938333 LOC106605563 other downstream 1122969 21532987 ~ 21547038 (+)
G121677 NA other downstream 1166293 21585421 ~ 21586101 (+)
LOC110537735 LOC106595974 other downstream 1402086 21821165 ~ 21825285 (+)

Expression


Co-expression Network