G123149


Basic Information

Item Value
gene id G123149
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 22610750 ~ 22624269 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU142256
atgtgagattgacagtggagggggtaatgtgagattgacagtggaaggggtaatgtgagattgacagtggaagggggtatatgagattgacagtggaagggggtatgtgagattgacagtgaaaggtgtaatgtgagattgacagtggaatttataatgtgagattgacagtggaaggggtaatttgagattgacagtggaagatgtaatgtgagattgacattGGAAGGGGGTATGTGAGGTTGACAGTGGAATGGGTAATGTGAGGTTGACATTAAAAGGTGTAATGTGAGATTggcagtggaaggggtaatgtgagattgacagtggaaggggtaatgtgagattgacagtggaaggggtaatgtgaatTTTACAGTGGAaggtgtaatgtgagattgacagtggaaggtgtaatgtgagattgacagtgaaAGGGGTAATGTGAatttgacagtggaaggggtaatgtgagattgacagtcgaaggggtaatgtgagattgacagtggaaggtgtaatgtgagattgacagtggaagggttAATgggagattgacagtggaaggggtaatgtgagattgacagtggaaggggtaatgtgagattgacagtg
>TU142257
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>TU142259
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>TU142261
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>TU142262
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Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC105913341, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU142256 False 615 lncRNA 0.43 3 22610750 22618524
TU142257 False 615 lncRNA 0.47 3 22610750 22618524
TU142259 False 615 lncRNA 0.43 3 22610750 22618524
TU142261 False 589 lncRNA 0.42 2 22610750 22618524
TU142262 True 429 lncRNA 0.33 3 22610750 22624269

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
rps19 LOC100689943 coding downstream 79694 22525184 ~ 22531056 (-)
bcam LOC106577531 coding downstream 111604 22399657 ~ 22499146 (-)
LOC110537898 LOC106605692 coding downstream 294682 22314451 ~ 22316068 (-)
LOC110537882 LOC106577487 coding downstream 357264 22236828 ~ 22253486 (-)
LOC110537877 LOC106577478 coding downstream 375826 22229800 ~ 22234924 (-)
LOC110534479 LOC106578237 coding upstream 131083 22755352 ~ 22774315 (-)
si:ch211-79k12.2 LOC106605590 coding upstream 150239 22774508 ~ 22779710 (-)
LOC118938460 LOC106605577 coding upstream 155775 22780044 ~ 22791836 (-)
LOC110538019 zn576 coding upstream 169917 22794186 ~ 22803401 (-)
LOC110538006 LOC106605591 coding upstream 179178 22803447 ~ 22813135 (-)
cadm4 LOC106577561 non-coding downstream 17619 22550928 ~ 22749138 (-)
G123090 NA non-coding downstream 35428 22481870 ~ 22575322 (-)
G123088 NA non-coding downstream 136546 22473454 ~ 22474204 (-)
G123044 NA non-coding downstream 225954 22384146 ~ 22384796 (-)
G122967 apoa2 non-coding downstream 254678 22354585 ~ 22356072 (-)
G123158 NA non-coding upstream 11773 22636042 ~ 22660713 (-)
G123247 NA non-coding upstream 141984 22766253 ~ 22767773 (-)
G123267 NA non-coding upstream 192994 22817263 ~ 22817587 (-)
G123268 NA non-coding upstream 193797 22818066 ~ 22818280 (-)
G122972 NA other downstream 232590 22376153 ~ 22378160 (-)
LOC110537842 NA other downstream 453216 22120579 ~ 22157534 (-)
G122829 LOC106605673 other downstream 583033 22026299 ~ 22027717 (-)
G122761 LOC106578847 other downstream 754849 21851433 ~ 21856413 (-)
G122733 LOC106592382 other downstream 798318 21796507 ~ 21812432 (-)
G123308 NA other upstream 380717 23004986 ~ 23005812 (-)
G123435 NA other upstream 561371 23185640 ~ 23199252 (-)
LOC110538355 LOC106577931 other upstream 655910 23279116 ~ 23281851 (-)
G124840 NA other upstream 1279570 23903839 ~ 23904677 (-)
LOC110538705 LOC106577653 other upstream 1534898 24144519 ~ 24172836 (-)

Expression


Co-expression Network