G139089 (LOC106605123)



Basic Information


Item Value
gene id G139089
gene name LOC106605123
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 37919735 ~ 37940714 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU159966
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>TU159964
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>TU159962
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>TU159972
cCGACAATAAAATAAGACTTTATTTCGTTTAGATAGACCACTGGGTTTTGCCAAAACATTTAGTAaacaagttttcaagatattgtaCTATAAAAATCATATCTATTTAACATTTCAAGGCACACATGGGAGCAATTGATTAAGAATAACAGTTCACTATGAGTGACCTTACAATCCATTGTAATTAAATGGTTCAACTGAGGtttttcagttgttaaatttcagcCCTAGACAATCTTTATATTGTACAGTATATTCAAAATACATAGTCTAGGAACATTTTAAGAAAGAGCATTGTTTGTCTAAAATACATTAAGTGTAACAGAAACAACCACAAGGCCTTTTGAGTTTCCCACTTTAATTACTTAATTTCCCCTAGTGTAATTGGTTCTGAAAACAGCCTAAAACTGTGTTCTTAAACTGAGCAAACTGAGCAGTCCAATTCCAAAATGACTTTGAAAAATCGTCTCACCGAATCCATTTCTATTTTCTCACAGAAGGTTCCAAGACCACTCTAAAGCATTGAGGATAATTTCCTAATATAATGACAAACAGCTCACGGCACTGTCCCGCTGTAAACTCACCAGTGTTGAGGGAAACATGGCCCCATAGCAAACAAAAGAAAGTGACCTCTCATTGCAAAATACTTGGTCCCTACTCCCTACAGTATCTCTGGCTATTTGTCAATGGCTGTATTAGTCCTTCCTTACTCCCTTTGTGTTTTTCTAAGGGCAATACTTTGTTCAGGCATCTCTCCACACTGTAGACTCCAATTATGATAAATGTTCCCGTTCACATGCCTAAATCACAAAGCAGCAGAACTGGTCTCAAAGGTGCCTTGTGGTATAACTCCATTATGGCAGTGGTAGTAGGTGACAAATGTTGATGGGGGAAATACATTCACACAGCACACCACTATCACATAGTGTTAGAGTCAAGACTTACACTTCAAGGGCCTGTTCAGAGGGATGTCACGTTACAGAATGTTCAGATAGAAACTTATCGTGCAGAACAGATATGTTTGTCTTTCAGGTAGAATAGTGAATTTTGTCAgctctattcattatatttctatctgcaacattcaGAAGATTTCACATCACTGAATACACCCCAGATCGAAGTAGCACGCCACTTGTGACCTGTCTGTATACAACAGCATGAGTGACACCCCTCATGGGAATCTGTCTTTGGCGGGTGTGGACCACAGTGTACCCCCTGATTCCATAGCACCATAGTTCTATATAGTATGTCCATTCAGTGGCCCAGTAGTACTGGACGTTAGTAGTAGTGCACCCGACCTATAGTGCCTGTTCCTGAACCCAGGATATCAGGCTGCCCATTCCTCCAGATCTCCCGTATGATTCGCTCCCTCTCCTCCAATCGCTGTGCCCTCTCTAGCTCCTCGGCCGACGTGAACACGTTAACGCTCAGTGTCCCGTCCGATTggctgtggttgtggtggttgcCAATGGGAATCTCTGTGGTGGGCATGGGGGCAGGTGCTTCGACgtcaccctcctcttcctcatcctcatcctcgcTATCTTCATCACATTCGTCCTCACTGAAGTCCTTCAGGTGTTTCTTCTCGGGCGTGGAGGCCGGGATGTTGGTGCGGGGCTTGCAGGAGATCCGGATGACCAGGAGGCAGAGGGTGAGGACCAGGCCAAAACAAACCCCAATCACAAAGTACAGCCC
>TU159974
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>TU159977
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Function


NR:

description
protein eva-1 homolog B-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU159966 False 2314 TUCP 0.41 2 37919735 37922070
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TU159974 False 1658 TUCP 0.44 2 37920391 37922070
TU159977 True 2214 TUCP 0.44 4 37920391 37940714

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
sh3d21 LOC106605124 coding upstream 8405 37891951 ~ 37911330 (+)
LOC110489035 LOC106605126 coding upstream 29225 37863201 ~ 37890510 (+)
LOC110501519 LOC106605129 coding upstream 156020 37699215 ~ 37763715 (+)
LOC110489000 LOC106605130 coding upstream 255442 37628152 ~ 37664293 (+)
LOC110488991 LOC106605131 coding upstream 297860 37607093 ~ 37621875 (+)
LOC110489135 LOC106605117 coding downstream 777578 38718292 ~ 38734398 (+)
LOC110489149 LOC106605176 coding downstream 816519 38757233 ~ 38786447 (+)
LOC110489163 LOC106605115 coding downstream 848822 38789536 ~ 38823441 (+)
LOC110489178 LOC106605114 coding downstream 882871 38823585 ~ 38847695 (+)
LOC110533769 LOC106583263 coding downstream 914468 38855182 ~ 38857226 (+)
G139040 NA non-coding upstream 142786 37776591 ~ 37776949 (+)
G139038 LOC106586992 non-coding upstream 146231 37772990 ~ 37773504 (+)
G138991 NA non-coding upstream 226554 37692982 ~ 37693181 (+)
G138805 NA non-coding upstream 329178 37535056 ~ 37590557 (+)
G138640 NA non-coding upstream 387622 37531419 ~ 37532113 (+)
G139102 NA non-coding downstream 4188 37944902 ~ 37945164 (+)
G139103 NA non-coding downstream 4630 37945344 ~ 37945605 (+)
G139139 LOC106605122 non-coding downstream 62352 38003066 ~ 38007585 (+)
G139167 NA non-coding downstream 95761 38036475 ~ 38036812 (+)
G139177 NA non-coding downstream 108224 38048938 ~ 38049391 (+)
G139004 NA other upstream 95725 37777061 ~ 37824010 (+)
LOC110488849 LOC106605147 other upstream 1517764 36354883 ~ 36405310 (+)
G137058 LOC106605156 other upstream 1819458 36099611 ~ 36100277 (+)
G136994 NA other upstream 1881994 35982832 ~ 36037741 (+)
LOC100653444 LOC106584591 other upstream 2063335 35855149 ~ 35865269 (+)
G139101 NA other downstream 3028 37943742 ~ 37944012 (+)
G139179 NA other downstream 110645 38051359 ~ 38051744 (+)
LOC110489834 eny2 other downstream 3598581 41539240 ~ 41541654 (+)
G143938 LOC106605049 other downstream 4027660 41968374 ~ 41969317 (+)
G144661 NA other downstream 4569616 42510330 ~ 42566030 (+)

Expression



Co-expression Network