G167288


Basic Information

Item Value
gene id G167288
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 61062593 ~ 61074591 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU190578
atactatgcaaaacatctaACATACTATGCATAACATCCAATATACTATACAAAACATCTAACATACTATACAAAACATCTaacatactatgcaaaacatctaACATACTATGCATAACATCCAatatactatgcaaaacatcagacatactatgcaaaacatcagacgtactatgcaaaacatctgatatcctatgcaaaacatctgatatcctatgcaaaacatctgatatcctatgcaaaacatcagacatactatgtaaaacatctgatatactatgcaaaacatcagacatactatgcaaaacaactaacatactatgcaaaacatctgaTACCCTATGCAAAACATCCAAAATATTCTGCAAAACAACCAACAATCATTGAAATCTTCTGATTTACTCTGCAAAACATCAGGCACACGATGAAAAACATCTAatatactatgcaaaacatcagaCATACTATGTAAAACATCAGGCACACTATGTAAAACATCAGAAATACCATGCAAAGCTTCTGCTATACTATGCAAAACTTCTGATATACTATTCAAAACATCAGGCACACTATGCAAAACATTTCATACACTCTGCAAGACATCTGATATACTATGCAAGACATCAGgcatactatgcaaaacatcagGCATACTATGTAAAACAACAGACATACTATGCATAACATCTGATATCCTATGTAAAACATCAGACATACTATGCATAACATCCAatatactatgcaaaacatccgATATACTTTGCAAAACATCCAatatactatgcaaaacatctgatatactatgcaaaacatcagaCATACTATGTAAAACATCAGGCATACTATGCAAGACatctgaTATACTCTGCAAAACATCAGGCATACTATGCTAAATGTCTAatatactatgcaaaacatccaACACACTATGCAAAACATCTCATACACTCTGCAAGACATCTGCTATACTATGCAAGACAATCAACATACATTCAAACATTCTGATTTACTATGCAAAACTTCTGATATACTATTCAAAACATCCAAAATACTATGATAAACTACCAAaatactatgcaaaacatctgaTATACTCTGCAAAACATCAGGCATACTATGCTAAATTTCTAatatactatgcaaaacatccaacatactatgcaaaacatctgaTATACTCTGCAAAACATCCGATATACCATGCACAACATCAGATGTACTATGCAAAACTTCTgatatactatgcaaaacatccaACATACTATGCACAACATCAGACGtactatgcaaaacatcagacgtactatgcaaaacatctgaTATACTATGCAAAACTTCTGATATACAGTACTATGCAAAACCTCTGATATACTATGCACAACATCAGCCATACTATGCAAAACCTCGGATATACTATGCAAAACTTCCGACATACTATGCAAGACATCTGCTATACTATGCAAAACTTCTGATATACTATTCAAAACATCAAGCACACTATGCAAAACATCTCATACACTCTGCAAGACATCTGCTATACTATGCAAGACATCAGGCATACTATATAAAACATCAGgcatactatgcaaaacatctgatatactatgcaaaacatctgatatactatgcaagacatcagacatactatgcaaaacatcagGCATACTATGTATAAAATCAGgcataatactgtatgtaaaacatcCAACATACTCTGATAAACATCCaacatactatgcaaaacatctaCTATACCATGCAAAACATCAgacatactatgcaaaacatctcATACACTCTGCAAGACATCTGCTATAGTATGCAAGACatcagacatactatgcaaaacatcagGCATACTATGTATAAAATCAGgcataatactgtatgtaaaacatcCAACATACTCTGATAAACATCCaacatactatgcaaaacatctaATATACCATGCAAAACATCAgacatactatgcaaaacatctgcTATCCTATGCAAAACAATCAACATACATTCAAATATTCTGATTTACTATGCAAAACTTCTGATATACTATTCAAAACATCCAAAATACTATGATAAACTACCAAAATACTATGCACAACATCTGATATACTCTGCAAAACATCAGGCATACTATACAAAACATCTGATATACTCTGCAAAACATCCGATATACCATGCACAACATCAGATGTACTATGCAAAACTTCTGATATACAGTACTATGCAAGACTTCTgatatactatgcaaaacatcagGCATACTATGCTAAATGTCTAatatactatgcaaaacatccaacatactatgcaaaacatctgaTATACTCTGCAAAACATCCGATATACCATGCACAACATCAGATGTACTATGCAAAACTACTGATATACAGTACTATGCAAGACTTCTGATATATTATGCAAAACATCAGGCATACTATGCTAAATGTCTAatatactatgcaaaacatccaACATACTATGCACAACATCAGACGtactatgcaaaacatcagacgtactatgcaaaacatctgaTATACTATGCAAAACTTCTGATATACAGTACTATGCAAGACTTCTgatatactatgcaaaacatcagacatactatgcaaaacatcagacatactatgcaaaacatcagaCATACTATACAAAACATGTGATATACTATGTAAAAC

Function

NR:

description
PREDICTED: zonadhesin

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU190578 True 2687 TUCP 0.33 6 61062593 61074591

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118937285 NA coding upstream 187156 60873225 ~ 60875437 (+)
LOC110493059 LOC100194658 coding upstream 196148 60851417 ~ 60866455 (+)
LOC110493043 LOC106561013 coding upstream 215618 60781715 ~ 60846975 (+)
LOC110492990 LOC106561017 coding upstream 322231 60735125 ~ 60740362 (+)
LOC100170211 LOC100170211 coding upstream 328562 60725590 ~ 60734031 (+)
LOC110493175 LOC106561005 coding downstream 109252 61130439 ~ 61193594 (+)
LOC118941124 NA coding downstream 183125 61257716 ~ 61259025 (+)
LOC118941126 NA coding downstream 236737 61311328 ~ 61312547 (+)
LOC110493325 LOC106561124 coding downstream 402520 61477111 ~ 61479816 (+)
LOC110493335 LOC106560997 coding downstream 424505 61499096 ~ 61509316 (+)
G167245 NA non-coding upstream 66235 60996153 ~ 60996358 (+)
G167227 NA non-coding upstream 87296 60974991 ~ 60975297 (+)
G167219 NA non-coding upstream 101216 60961097 ~ 60961377 (+)
G167205 NA non-coding upstream 125598 60936768 ~ 60936995 (+)
G167204 NA non-coding upstream 126104 60936253 ~ 60936489 (+)
G167306 NA non-coding downstream 29144 61103735 ~ 61104351 (+)
G167311 LOC106561008 non-coding downstream 34045 61108636 ~ 61109538 (+)
G167229 NA non-coding downstream 45144 61119735 ~ 61126534 (+)
G167365 NA non-coding downstream 121311 61195902 ~ 61196235 (+)
G166878 NA other upstream 546713 60515632 ~ 60515880 (+)
G166131 lmod2 other upstream 1109428 59945708 ~ 59953165 (+)
G163660 LOC106561040 other upstream 2846210 58215677 ~ 58216383 (+)
G163513 LOC106561046 other upstream 3130602 57928150 ~ 57931991 (+)
G167325 LOC106561003 other downstream 157605 61232196 ~ 61232545 (+)
LOC110510683 LOC106560954 other downstream 456998 61525283 ~ 61535728 (+)
G167609 LOC106560954 other downstream 652368 61726959 ~ 61727454 (+)
LOC118936783 LOC106560954 other downstream 805179 61870393 ~ 61880657 (+)
G169130 NA other downstream 1710767 62785358 ~ 62785643 (+)

Expression


Co-expression Network