G173370 (LOC106560927)


Basic Information

Item Value
gene id G173370
gene name LOC106560927
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 65833341 ~ 65839074 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU197163
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>TU197164
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Function

NR:

description
zinc finger protein 319-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU197163 False 5492 TUCP 0.44 2 65833341 65839074
TU197164 True 5510 TUCP 0.45 2 65833341 65839074

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
usb1 usb1 coding downstream 3601 65821657 ~ 65829740 (-)
ccdc135 drc7 coding downstream 40544 65782330 ~ 65792797 (-)
LOC110493917 LOC106560931 coding downstream 54825 65762721 ~ 65778516 (-)
LOC110493906 ca5a coding downstream 81296 65730731 ~ 65752045 (-)
slc7a5 slc7a5 coding downstream 117384 65685261 ~ 65715957 (-)
snrkb LOC106560921 coding upstream 192949 66032023 ~ 66069982 (-)
znrf1 znrf1 coding upstream 245152 66084226 ~ 66118713 (-)
LOC110494064 NA coding upstream 305772 66144846 ~ 66146269 (-)
si:dkeyp-50b9.1 LOC106560918 coding upstream 371362 66210436 ~ 66223350 (-)
LOC110494122 LOC106560915 coding upstream 459114 66277821 ~ 66299637 (-)
G173349 NA non-coding downstream 29991 65799892 ~ 65803350 (-)
G173328 NA non-coding downstream 109169 65723959 ~ 65724172 (-)
G173326 NA non-coding downstream 111020 65722121 ~ 65722321 (-)
G173309 NA non-coding downstream 139313 65693784 ~ 65694028 (-)
G173297 NA non-coding downstream 170704 65661852 ~ 65662637 (-)
G173393 NA non-coding upstream 36140 65875214 ~ 65877945 (-)
G173401 NA non-coding upstream 43363 65882437 ~ 65883420 (-)
G173428 NA non-coding upstream 75989 65915063 ~ 65917401 (-)
G173429 NA non-coding upstream 80924 65919998 ~ 65920259 (-)
G173436 NA non-coding upstream 91483 65930557 ~ 65930764 (-)
zcchc14 zcchc14 other downstream 296560 65530911 ~ 65571025 (-)
G173121 NA other downstream 449468 65383437 ~ 65383873 (-)
G172141 NA other downstream 747153 65085572 ~ 65086188 (-)
tmem117 LOC106573612 other downstream 1664943 64102056 ~ 64170220 (-)
LOC110501772 LOC106560973 other downstream 1869520 63958607 ~ 63963969 (-)
G173431 NA other upstream 82776 65921850 ~ 65922229 (-)
G173675 NA other upstream 496338 66335412 ~ 66338386 (-)
G173696 LOC106560906 other upstream 536152 66375226 ~ 66390766 (-)
G174505 NA other upstream 853334 66692408 ~ 66692850 (-)

Expression


Co-expression Network