G198034


Basic Information

Item Value
gene id G198034
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 86728503 ~ 86732160 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU224177
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>TU224178
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>TU224179
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>TU224180
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Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106578363 isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU224177 False 1019 lncRNA 0.45 5 86728503 86732160
TU224178 False 1705 lncRNA 0.41 4 86728503 86732160
TU224179 False 1052 lncRNA 0.43 6 86728503 86732160
TU224180 True 1594 lncRNA 0.42 5 86728503 86732160

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
zpd LOC106594968 coding downstream 9331 86715060 ~ 86719172 (-)
LOC110498636 LOC106561446 coding downstream 13507 86707476 ~ 86714996 (-)
LOC118942936 LOC106611498 coding downstream 27252 86699341 ~ 86701251 (-)
LOC118937297 LOC106561464 coding downstream 33301 86684087 ~ 86695202 (-)
LOC110498617 LOC106561447 coding downstream 52253 86658014 ~ 86676250 (-)
LOC110533876 NA coding upstream 11772 86743932 ~ 86747314 (-)
LOC118942938 LOC106561453 coding upstream 153003 86885163 ~ 86887339 (-)
LOC110498693 LOC106561455 coding upstream 206135 86938295 ~ 86967505 (-)
rassf10a LOC106561459 coding upstream 305134 87037294 ~ 87039516 (-)
LOC110498779 LOC106561460 coding upstream 311729 87043889 ~ 87138769 (-)
G198032 NA non-coding downstream 8351 86719711 ~ 86720152 (-)
G198007 NA non-coding downstream 73963 86648809 ~ 86654540 (-)
G198005 NA non-coding downstream 80515 86647681 ~ 86647988 (-)
G197974 NA non-coding downstream 117239 86607931 ~ 86611264 (-)
G198074 NA non-coding upstream 28549 86760709 ~ 86760932 (-)
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G198231 NA non-coding upstream 139086 86871246 ~ 86873200 (-)
G198334 LOC106561456 non-coding upstream 203243 86935403 ~ 86937181 (-)
G197554 NA other downstream 764838 85959845 ~ 85963665 (-)
G197498 slc25a18 other downstream 885010 85831239 ~ 85843493 (-)
LOC110498022 LOC106561385 other downstream 2088747 84596433 ~ 84910878 (-)
G195486 LOC106573171 other downstream 2746336 83977965 ~ 83982167 (-)
G195427 NA other downstream 2824052 83881540 ~ 83904451 (-)
G198342 LOC100194703 other upstream 170876 86903036 ~ 86903956 (-)
G198912 NA other upstream 589979 87322139 ~ 87326469 (-)
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G203915 rassf9 other upstream 4857052 91589212 ~ 91591049 (-)

Expression


Co-expression Network